Alphanecrovirus
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Alphanecrovirus est un genre de virus de la famille des Tombusviridae, sous-famille des Procedovirinae, qui comprend quatre espèces acceptées par l'ICTV, dont l'espèce-type, Tobacco necrosis virus A (virus A de la nécrose du tabac). Ce sont des virus à ARN linéaire, à simple brin de polarité positive, classés dans le groupe IV de la classification Baltimore. Ces virus infectent les plantes (phytovirus).
| Realm | Riboviria |
|---|---|
| Règne | Orthornavirae |
| Embranchement | Kitrinoviricota |
| Classe | Tolucaviricetes |
| Ordre | Tolivirales |
| Famille | Tombusviridae |
| Sous-famille | Procedovirinae |
Espèces de rang inférieur
- espèce-type : Tobacco necrosis virus A
Ce genre résulte de la scission proposée en 2011 de l'ancien genre Necrovirus, qui comprenait sept espèces, en deux nouveaux genres Alphanecrovirus (3 espèces) et Betanecrovirus (3 espèces), la septième espèce, Chenopodium necrosis virus étant non classée dans un genre. Une nouvelle espèce, Potato necrosis virus a été rattachée au genre Alphanecrovirus en 2018[2],[3].
Le génome est monopartite. Les virions, non enveloppés, sont constitués d'une capside icosaédrique de 28 nm de diamètre. Ces virus sont transmis par le sol, en général par des champignons chytridiomycètes, et n'infectent que les racines. Ils infectent une vaste gamme de plantes-hôtes, appartenant aux monocotylédones et dicotylédones.
Structure
modifierLes virions sont des particules non-enveloppées, de forme sphérique, d'environ 28 nm de diamètre. La capside à symétrie icosaédrique de type T=3, est composée de 30 capsomères hexamériques (le virion est constitué de 180 sous-unités protéiques)[4].
Génome
modifierLe génome, monopartite, est constitué d'une molécule d'ARN linéaire à simple brin de sens positif, d'environ 4 kb. Il est dépourvu de structure de coiffe à l'extrémité 5' et de queue poly(A)[4].
Transmission
modifierLes virus de ce genre sont transmis par le sol. Certains, comme le TNV-A (Tobacco necrosis virus A), sont transmis naturellement par une espèce de champignons chytridiomycètes, Olpidium brassicae, tandis que d'autres comme l'OLV-1 (Olive latent virus-1) sont transmis par le sol sans intervention apparente d'un vecteur. Les virions sont facilement transmis par inoculation mécanique[5].
Liste des espèces et non-classés
modifierSelon NCBI (6 février 2021)[6] :
- Olive latent virus 1 (OLV-1)
- Olive mild mosaic virus (OMMV)
- Potato necrosis virus (PoNV)
- Tobacco necrosis virus A (TNV-A)
- non-classé
Notes et références
modifier- ICTV. International Committee on Taxonomy of Viruses. Taxonomy history. Published on the Internet https://talk.ictvonline.org/., consulté le 6 février 2021
- (en) « Divide the genus Necrovirus into 2 new genera, Alphanecrovirus and Betanecrovirus », sur talk.ictvonline.org, ICTV, (consulté le ).
- (en) « ICTV Taxonomy history: Potato necrosis virus », sur talk.ictvonline.org, ICTV, (consulté le ).
- (en) « Tombusviridae », sur talk.ictvonline.org, ICTV (consulté le ).
- NCBI, consulté le 6 février 2021
Liens externes
modifier- (en) Référence NCBI : Alphanecrovirus (taxons inclus) (consulté le )
- (en) Référence WoRMS : Alphanecrovirus (+ liste espèces) (consulté le )
- (en) Référence ICTV : Alphanecrovirus (consulté le )
- (en) « Alphanecrovirus », sur ViralZone (consulté le ).
