Ambiviricota est un phylum de virus à ARN simple brin de polarité ambisens qui infectent les champignons. Leurs membres sont communément appelés des ambivirus[3].

Les génomes d'ambivirus contiennent au moins deux cadres de lecture ouverts disposés selon une orientation ambisens sans chevauchement. Cette structure ambisens permet au virus de coder deux protéines à partir de brins d'ARN opposés. Les génomes des ambivirus ont un mode de se réplication circulaire et forment une structure en bâtonnet contenant des ribozymes dans les orientations sens et antisens, à l'instar des viroïdes  de petits agents infectieux circulaires qui utilisent également des ribozymes[4].

Il a été établi que les ambivirus infectent diverses espèces de champignons, ce qui en fait un sujet d'étude important pour comprendre les interactions virales chez ces hôtes. Au moins quatre divisions taxonomiques fongiques majeures sont connues pour héberger des ambivirus : les Ascomycota (champignons à asques), les Basidiomycota (champignons à basides, incluant les champignons à chapeau), les Chytridiomycota (champignons primitifs) et les Glomeromycota (champignons formant des relations symbiotiques avec les plantes). Ce large spectre d'hôtes suggère que les ambivirus pourraient jouer un rôle significatif dans l'écologie fongique, en affectant potentiellement tant la reproduction des champignons que leurs interactions avec d'autres organismes[3].

Arbre phylogénétique illustrant la diversité des champignons infectés par des ambivirus.

Le génome des ambivirus codent l'ARN-polymérase ARN-dépendante et des ribozymes à ARN auto-clivants typiques de nombreux viroïdes[5].

Étymologie

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Le nom Ambiviricota dérive du terme latin ambi, signifiant « les deux », en référence à l'orientation ambisens sans chevauchement des cadres de lecture ouverts dans les génomes des membres de ce taxon ; le suffixe -viricota indique son classement en tant que phylum viral[2].

Références

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  1. ICTV. International Committee on Taxonomy of Viruses. Taxonomy history. Published on the Internet https://talk.ictvonline.org/., consulté le .
  2. 1 2 (en) « Virus Taxonomy: 2024 Release », ICTV, (consulté le ).
  3. 1 2 Jens H. Kuhn, Leticia Botella, Marcos de la Peña et Eeva J. Vainio, « Ambiviricota, a novel ribovirian phylum for viruses with viroid-like properties », Journal of Virology, vol. 98, no 7, , e00831–24 (PMID 38856119, PMCID 11265453, DOI 10.1128/jvi.00831-24, lire en ligne, consulté le )
  4. (en) Marco Forgia, Beatriz Navarro, Stefania Daghino et Amelia Cervera, « Hybrids of RNA viruses and viroid-like elements replicate in fungi », Nature Communications, vol. 14, no 1, , p. 2591 (ISSN 2041-1723, DOI 10.1038/s41467-023-38301-2, lire en ligne, consulté le )
  5. (en) Li Chuin Chong et Chris Lauber, « Viroid-like RNA-dependent RNA polymerase-encoding ambiviruses are abundant in complex fungi », Frontiers in Microbiology, Frontiers, vol. 14, (ISSN 1664-302X, DOI 10.3389/fmicb.2023.1144003, lire en ligne, consulté le )

Référence biologique

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