Aude Bernheim

microbiologiste française

Aude Bernheim (1989) est une microbiologiste française dont les recherches portent sur les systèmes de défense bactériens contre les phages et sur l’évolution de l’immunité. Elle contribue au développement du concept d’« immunité ancestrale[8] », explorant les liens entre systèmes antiphages et les systèmes immunitaires eucaryotes. Chercheuse à l’Institut Pasteur, elle dirige le laboratoire « Diversité moléculaire des microbes ». Cofondatrice de WAX Science et engagée pour une science inclusive, elle est membre du Conseil présidentiel de la science[9],[10]. Ses travaux ont été distingués par plusieurs prix, dont le prix Bettencourt, le prix Jacques Monod, le prix du Collège de France et le prix Irène Joliot-Curie.

Aude Bernheim
Biographie
Naissance
Nationalité
Française
Formation
Activité
  • Chercheuse en microbiologie
  • Enseignement / vulgarisation
  • Cofondatrice de WAX Science
Autres informations
A travaillé pour
Directeurs de thèse
David Bikard (d), Eduardo Rocha (d)Voir et modifier les données sur Wikidata
Distinction
  • Prix Bettencourt pour les jeunes chercheurs (2018)[2]
  • Prix Jacques Monod (2020)[3]
  • Prix du Collège de France (2022)[4]
  • EMBO Young Investigator (2024–2027)[5]
  • Prix Irène Joliot-Curie – Jeune femme scientifique (2024)[6]
  • Ordre national du Mérite (chevalier, 2025)[7]

Biographie

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Formation

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Aude Bernheim est diplômée d’AgroParisTech et a rejoint en 2013 le corps des ingénieurs des ponts, des eaux et des forêts (IPEF)[1]. Elle suit également le master AIRE du Centre de recherches interdisciplinaires (devenu Learning Planet Institute), où elle s’oriente vers la biologie évolutive et les interactions virus–bactéries[11].

Parcours scientifique

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Elle réalise un doctorat à l’Institut Pasteur consacré à l’évolution des systèmes de défense bactériens, combinant analyses comparatives et approches de bio-informatique pour étudier les systèmes CRISPR et d’autres mécanismes antiviraux[12],[13].

Elle poursuit par un postdoctorat au Weizmann Institute of Science dans l’équipe de Rotem Sorek, où elle participe à l’identification et à la caractérisation de nouveaux systèmes anti-phages à l’aide d’approches de génomique comparative et de biologie moléculaire[14].

Elle rejoint ensuite l’Institut Pasteur, où elle fonde et dirige le laboratoire Diversité moléculaire des microbes[12].

Travaux de recherche

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Immunité anti-phage et systèmes de défense bactériens

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Les travaux d’Aude Bernheim portent sur la diversité, l’évolution et le fonctionnement des systèmes de défense bactériens contre les bactériophages. Elle utilise des approches de bio-informatique, de génomique comparative et de biologie moléculaire pour explorer et caractériser la diversité des mécanismes immunitaires bactériens, incluant notamment les systèmes CRISPR[12],[13].

Immunité « ancestrale »

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À partir des années 2020, elle contribue à populariser et à explorer l’hypothèse d’une conservation de modules génétiques immunitaires entre bactéries et eucaryotes, notamment les humains, hérités de leur ancêtre commun ou acquis par transfert horizontal de gènes, présentée comme une forme d’« immunité ancestrale »[15],[16],[17],[18]. Cette approche suggère qu’une partie des gènes impliqués dans l’immunité innée humaine pourrait être issue de mécanismes anciens partagés au cours de l’évolution, ouvrant la possibilité, à terme, d’un renouvellement du cadre conceptuel de l’immunité et du développement de thérapies innovantes[15],[16],[19],[17],[18],[20].

Dans ce cadre, elle cosigne avec Enzo Z. Poirier et leurs collègues un article[21] dans Science établissant pour la première fois le rôle immunitaire dans la voie des récepteurs de type Toll d’une protéine humaine nommée SIRal, identifiée préalablement par des analyses bioinformatiques comme homologue de protéines bactériennes de défense antiphage[15].

Engagement associatif

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En 2013, Aude Bernheim cofonde avec Flora Vincent l’association WAX Science What About Xperiencing Science »), vouée à la promotion d’une science sans stéréotypes et à la mixité dans les carrières scientifiques[22],[23].

L’association organise des ateliers de sensibilisation auprès des jeunes, développe des outils numériques tels que l’application « It Counts » pour mesurer la représentation hommes-femmes dans les réunions scientifiques, et mène des actions de “science citoyenne”, par exemple via le projet « Science à la pelle » invitant le grand public à prélever et envoyer des échantillons de sol pour soutenir les recherches microbiennes[24].

Bernheim considère que la recherche et l’engagement pour une science inclusive ne sont pas dissociables, et affirme que son implication associative s’inscrit « dans une nécessité et non un choix optionnel »[23].

Elle coécrit avec Flora Vincent l’ouvrage L’intelligence artificielle, pas sans elles !, consacré aux questions d’égalité dans les sciences et le numérique[25].

Distinctions

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  • Prix Bettencourt pour les jeunes chercheurs (2018)[2].
  • Prix Jacques Monod (2020)[3].
  • Prix du Collège de France pour les jeunes chercheuses et les jeunes chercheurs (2022)[4].
  • EMBO Young Investigator (2024–2027)[5].
  • Prix Irène Joliot-Curie, Jeune femme scientifique (2024)[26],[27].
  • Chevalier de l'Ordre national du Mérite (2025)[7]

Publications sélectionnées

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  • Delphine Bonhomme et al., « A human homolog of SIR2 antiphage proteins mediates immunity via the Toll-like receptor pathway », Science, (DOI 10.1126/science.adr8536)[15]
  • Jean Cury et al., « Conservation of antiviral systems across domains of life reveals immune genes in humans », Cell Host & Microbe, (DOI 10.1016/j.chom.2024.08.002)[28]
  • Bernheim A. et al., « Prokaryotic viperins produce diverse antiviral molecules », Nature, vol. 589, , p. 120-124 (DOI 10.1038/s41586-020-2762-2)[29]

Notes et références

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  1. 1 2 3 « Arrêté du 19 juillet 2013 portant nomination d'ingénieurs-élèves des ponts, des eaux et des forêts », sur Légifrance (consulté le )
  2. 1 2 « Prix Bettencourt pour les jeunes chercheurs (lauréats 2018) », sur Fondation Bettencourt Schueller (consulté le )
  3. 1 2 « Dix chercheurs récompensés pour leurs travaux prometteurs (Prix Jacques Monod 2020) », sur Fondation de France (consulté le )
  4. 1 2 « Prix du Collège de France 2022 », sur Collège de France (consulté le )
  5. 1 2 « Aude Bernheim – EMBO Young Investigator », sur EMBO (consulté le )
  6. « Prix Irène Joliot-Curie 2024 », sur Ministère de l'Enseignement supérieur et de la Recherche (consulté le )
  7. 1 2 « Décret du 2 décembre 2025 portant promotion et nomination dans l'ordre national du Mérite », sur Légifrance – Journal officiel, (consulté le )
  8. (en) Aude Bernheim, Jean Cury et Enzo Z. Poirier, « The immune modules conserved across the tree of life: Towards a definition of ancestral immunity », PLOS Biology, vol. 22, no 7, , e3002717 (ISSN 1545-7885, PMID 39008452, PMCID 11249213, DOI 10.1371/journal.pbio.3002717, lire en ligne, consulté le )
  9. « Un nouveau Conseil présidentiel de la science », sur CNRS, (consulté le )
  10. « Le président de la République annonce la création d’un nouveau Conseil scientifique », sur Le Figaro, (consulté le )
  11. « Aude Bernheim, alumni du master AIRE », sur Learning Planet Institute, (consulté le )
  12. 1 2 3 « Aude Bernheim », sur Institut Pasteur (consulté le )
  13. 1 2 « Aude Bernheim, entre évolutions humaines et bactériennes », La lettre de l'institut Pasteur, no 127, , p. 7 (ISSN 1243-8863)
  14. « Aude Bernheim », sur Collège de France (consulté le )
  15. 1 2 3 4 Bonhomme D. et al., « A human homolog of SIR2 antiphage proteins mediates immunity via the Toll-like receptor pathway », Science, (DOI 10.1126/science.adr8536)
  16. 1 2 « La révolution de l’immunité ancestrale : quand nos défenses sont un héritage des bactéries », sur Le Monde, (consulté le )
  17. 1 2 « L'immunité humaine est en partie héritée des bactéries », sur Pour la Science, (consulté le )
  18. 1 2 « Immunité innée : l'étude des bactéries éclaire nos connaissances chez l'humain », sur Inserm, (consulté le )
  19. Thérèse Deleu de Aguiar et Ibrahim Touré, « Comment des bactéries nous ont transmis des armes pour mieux les combattre », sur Le Figaro Santé, (consulté le )
  20. « Les promesses de l'immunité ancestrale », sur Fondation pour la recherche médicale, (consulté le )
  21. (en) Delphine Bonhomme, Hugo Vaysset, Eirene Marie Q. Ednacot et Vasco Rodrigues, « A human homolog of SIR2 antiphage proteins mediates immunity via the Toll-like receptor pathway », Science, vol. 389, no 6758, (ISSN 0036-8075 et 1095-9203, DOI 10.1126/science.adr8536, lire en ligne, consulté le )
  22. « Avec Wax Science, Aude Bernheim veut promouvoir une science sans stéréotypes », sur Les Inrockuptibles, (consulté le )
  23. 1 2 « Aude Bernheim : chercheuse et militante », sur Inserm, (consulté le )
  24. « « Communauté » : Aude Bernheim, chercheuse en microbiologie et en génétique », sur Learning Planet Institute, (consulté le )
  25. « L’intelligence artificielle, pas sans elles ! », sur BnF (consulté le )
  26. « Portrait de Aude Bernheim, lauréate du prix Irène Joliot-Curie 2024 », sur Ministère de l’Enseignement supérieur et de la Recherche, (consulté le )
  27. « Lauréat 2024 du Prix Irène Joliot-Curie (Jeune femme scientifique) - Aude Bernheim », sur Académie des sciences (consulté le )
  28. Poirier E. Z. et Bernheim A. et al., « Conservation of antiviral systems across domains of life reveals immune genes in humans », Cell Host & Microbe, (DOI 10.1016/j.chom.2024.08.002)
  29. Bernheim A. et al., « Prokaryotic viperins produce diverse antiviral molecules », Nature, vol. 589, , p. 120-124 (DOI 10.1038/s41586-020-2762-2)

Liens externes

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