La saison 1999-2000 du Championnat du Luxembourg de football est la 86e édition du championnat de première division au Luxembourg. Les douze meilleurs clubs du pays se retrouvent au sein d'une poule unique, la Division Nationale, où ils s'affrontent deux fois, à domicile et à l'extérieur. À l'issue de cette première phase, les quatre premiers disputent une poule pour le titre tandis que les huit autres clubs jouent une phase de relégation, réparties en deux poules de quatre, avec le dernier de chaque poule relégué en Promotion d'Honneur.
C'est le F91 Dudelange qui s'impose lors du championnat cette saison, après avoir terminé en tête du classement final de la poule pour le titre, avec onze points d'avance sur un duo composé du CS Grevenmacher et du quintuple champion en titre, le club de la Jeunesse d'Esch. C'est le tout premier titre de ce club formé en 1991. La Jeunesse d'Esch remporte tout de même un trophée cette année après sa victoire en finale de la Coupe du Luxembourg face au FC Mondercange, un résultat identique à la finale de l'année précédente.
Le barème utilisé pour établir le classement est le suivant :
- Victoire : 3 points
- Match nul : 1 point
- Défaite : 0 point
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Participation à la poule pour le titre
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Participation à la phase de relégation
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(T) Tenant du titre (P) : Promu de deuxième division
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Qualification pour la Coupe Intertoto 2000
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Relégation directe en Promotion d'Honneur
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(P) : Promu de deuxième division
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Relégation directe en Promotion d'Honneur
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(T) Tenant du titre (C) Vainqueur de la Coupe du Luxembourg (P) : Promu de deuxième division
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