Colwellia demingiae
Colwellia demingiae est une des espèces du genre bactérien Colwellia. Ce sont des bacilles à Gram négatif de la famille des Colwelliaceae. Ces bactéries marines psychrophiles font partie de l'embranchement des Pseudomonadota.
| Domaine | Bacteria |
|---|---|
| Embranchement | Pseudomonadota |
| Classe | Gammaproteobacteria |
| Ordre | Alteromonadales |
| Famille | Colwelliaceae |
| Genre | Colwellia |
Historique
modifierColwellia demingiae a d'abord été décrite en en même temps que trois autres espèces, Colwellia hornerae, Colwellia rossensis et Colwellia psychrotropica, toutes les quatre isolées à partir de prélèvements d'eaux de l'Antarctique[2].
Taxonomie
modifierÉtymologie
modifierL'étymologie de cette espèce est la suivante : dem.ing’i.ae N.L. gen. fem. n. demingiae, Nommé en honneur de Jody W. Deming, une microbiologiste américaine qui accru les connaissances sur les bactéries des profondeurs marines[3],[4].
Phylogénie
modifierL'analyse de la séquence de l'ARNr 16S de la souche ICP11 a révélé qu'elle présente une homologie de 99,8 % avec la souche IC068. Ces deux souches forment un clade distinct proche de l'espèce Colwellia psychrerythraea (souche type du genre décrite en [5])[6]. Cela a donné lieu à la création d'un nouveau genre bactérien et de le classer au sein des Protéobactéries. La famille Colwelliaceae décrite en a permis de regrouper dans une même famille les genres Colwellia et Thalassomonas du fait de l'homologie de leurs séquences nucléotidiques en ARNr 16S[7]. En , lors de la description de l'ordre Alteromonadales dans le Bergey's Manual, la famille Alteromonadaceae y est intégrée comme unique famille de cet ordre et contenant entre autres les Colwellia[8]. La même année dans la liste des nouveaux noms n°106, les Colwellia sont séparées de cette famille et intégrée dans celle des Colwelliaceae[9].
Description
modifierLors de sa description de , la famille Colwelliaceae reprend la description des Colwellia et de l'espèce type Colwellia psychrerythraea. Tout comme l'espèce type, Colwellia demingiae est composée de bactéries à Gram négatif avec des bacilles à morphologie incurvée et mobiles[10]. Ces bacilles ne forment pas d'endospores ni de kystes[10]. La majeure partie des bactéries de cette famille sont des chimioorganotrophes anaérobies facultatifs nécessitant des ions sodium pour leur croissance[10].
Notes et références
modifier- Bowman et et al. 1998, p. 1171.
- Bowman et et al. 1998, p. 1172.
- Bowman et et al. 1998, p. 1178.
- (en) « Species Colwellia demingiae », sur LPSN,
- Deming et et al. 1988, p. 152.
- Bowman et et al. 1998, p. 1177.
- Ivanova, Flavier et Christen 2004, p. 1781.
- Bowman et McMeekin 2005, p. 443.
- (en) Jean Euzéby, « Validation List no. 106. Validation of publication of new names and new combinations previously effectively published outside the IJSEM », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, IUMS, vol. 55, , p. 2235–2238 (DOI 10.1099/ijs.0.64108-0)
- Ivanova, Flavier et Christen 2004, p. 1785.
Bibliographie
modifier- (en) John P. Bowman, John J. Gosink, Sharee A. McCammon, Tom E. Lewis, David S. Nichols, Peter D. Nichols, Jenny H. Skerratt, Jim T. Staley et Tom A. McMeekin, « Colwellia demingiae sp. nov., Colwellia hornerae sp. nov., Colwellia rossensis and Colwellia psychrotropica sp. nov.: psychrophilic Antarctic species with the ability to synthesize docosahexaenoic acid (22:6ω3). », Int. J. Syst. Bacteriol., vol. 48, no 4, , p. 1171-1180 (DOI 10.1099/00207713-48-4-1171)
- (en) JY D'Aoust et DJ. Kushner, « Vibrio psychroerythrus sp. n.: classification of the psychrophilic marine bacterium, NRC 1004. », J Bacteriol, vol. 111, , p. 340-342 (DOI 10.1128/jb.111.2.340-342.1972)
- (en) Jody W. Deming, Leslie K. Somers, William L. Straube, David G. Swartz et Michael T. Macdonell, « Isolation of an Obligately Barophilic Bacterium and Description of a New Genus, Colwellia gen. nov. », Systematic and Applied Microbiology, vol. 10, no 2, , p. 152-160 (DOI 10.1016/S0723-2020(88)80030-4)
- (en) Elena P. Ivanova, Sébastien Flavier et Richard Christen, « Phylogenetic relationships among marine Alteromonas-like proteobacteria: emended description of the family Alteromonadaceae and proposal of Pseudoalteromonadaceae fam. nov., Colwelliaceae fam. nov., Shewanellaceae fam. nov., Moritellaceae fam. nov., Ferrimonadaceae fam. nov., Idiomarinaceae fam. nov. and Psychromonadaceae fam. nov. », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 54, no 5, , p. 1773-1788
- (en) John P. Bowman et Thomas A. McMeekin, « Order X. Alteromonadales ord. nov. », dans Brenner Don J., Krieg Noel R., Staley James T., Garrity GM (eds), Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, vol. 2 (The Proteobacteria), part B (The Gammaproteobacteria), New York, Springer, , p. 443
- (en) E.P. Ivanova et V.V. Mikhailov, « A New Family, Alteromonadaceae fam. nov., Including Marine Proteobacteria of the Genera Alteromonas, Pseudoalteromonas, Idiomarina, and Colwellia », Microbiology, vol. 70, , p. 10–17 (DOI 10.1023/A:1004876301036)
- (ru) E.P. Ivanova et V.V. Mikhailov, « A New Family, Alteromonadaceae fam. nov., Including Marine Proteobacteria of the Genera Alteromonas, Pseudoalteromonas, Idiomarina, and Colwellia », Microbiologiia, vol. 70, , p. 15-23
Liens externes
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- Ressources relatives au vivant :
