InterPro est une base de données intégrées de « signatures » de domaines et de signaux protéiques utilisée pour la classification et l'annotation automatique de protéines[1].

Interpro permet la classification des protéines en fonction de la présence de domaines fonctionnels, répétitions, et signaux grâce à une recherche automatisée dans plusieurs bases de données (CATH-Gene3D, HAMAP, PANTHER, Pfam, PIRSF, PRINTS, ProDom, PROSITE, SMART, SUPERFAMILY, TIGRFAMs).

Notes et références

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  1. Hunter, S., Apweiler, R., Attwood, K., Bairoch, A., Bateman, A., Binns, D., Bork, P., Das, U. et al. (2009), « InterPro: the integrative protein signature database » (Free full text), Nucleic acids research 37 (Database issue): D211–D215. Publié en ligne le 21 octobre 2008.

Lien externe

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  • (en) « InterPro », sur ebi.ac.uk (consulté le )