Un total de 54 équipes participent à cette édition de la Ligue des Champions. 32 d'entre elles sont directement qualifiées pour la saison régulière, les 29 clubs restants doivent passer par des qualifications pour déterminer les 3 dernières équipes participant à la saison régulière.
1er, 2e, etc. : Place dans le championnat domestique
Un total de 25 équipes participe aux tours de qualification cette saison. Celles-ci sont réparties selon leur place dans leur championnat national (pots 1 et 2 pour les champions), et leur ranking FIBA (pots 3 à 6). Le tirage au sort les répartit dans trois tableaux dont chaque vainqueur accède à la saison régulière de la Ligue des Champions. Un tour préliminaire supplémentaire est organisé pour départager les deux dernières équipes souhaitant entrer dans les qualifications. Toutes les rencontres se déroulent à Antalya, à l'Antalya Sports Hall, du 24 septembre au 1eroctobre 2023.
Les équipes éliminées sont reversées en Coupe d'Europe FIBA si elles y sont candidates.
Les play-ins se déroulent du 2 au 17 janvier 2024 et opposent les 2es et 3es de groupes de la saison régulière. Ils consistent en une rencontre au meilleur des 3 manches, avec avantage du terrain pour l'équipe qui s'est classée 2e. Les vainqueurs se qualifient pour le Top 16.
Le Top 16 se déroule du - janvier au - mars 2024 et met aux prises les huit vainqueurs de groupe de la saison régulière ainsi que les huit gagnants des play-ins. Les 16 équipes sont divisées en 4 groupes de 4. Les deux premiers de chaque groupe se qualifient pour les quarts de finale.
↑Le club de ZZ Leiden était qualifié en tant que vainqueur de BNXT League 2022-23, mais s'est retiré de la compétition car leur arène ne répondait pas aux normes de capacité de la FIBA. Par conséquent, la place a été attribuée à Heroes Den Bosch, troisième de la ligue nationale.