List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
La List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN, en français : « Liste des noms procaryotes ayant un statut dans la nomenclature ») est une base de données en ligne qui conserve des informations sur la nomenclature et la taxonomie des procaryotes[1] conformément aux exigences taxonomiques et aux décisions du Code international de nomenclature des procaryotes[2]. À ce titre, la LPSN fait autorité sur la validité des noms attribués aux bactéries et aux archées[3].
| Type | |
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| Fondation | |
| Site web |
(en) www.bacterio.net |
Jean Euzéby en a été l'initiateur et le conservateur de à [4],[3]. C'est Aidan Parte qui en a pris le relais de à . En , la LPSN a été intégrée au service de mise à jour de la nomenclature procaryote de l'Institut Leibniz DSMZ (Collection allemande de micro-organismes et de cultures cellulaires)[5].
En , la LPSN présente les dernières mises à jour de son logiciel TYGS, incluant une phylogénie à l'échelle du génome et des estimations des limites aux niveaux de l'espèce et des sous-espèces, afin de faciliter l'exploration taxonomique des séquences bactériennes interrogées pour leur l'identification. Le logiciel fournit aussi les informations sur la nomenclature officielle, la synonymie et la littérature taxonomique associées[3].
Références
modifier- ↑ Wackett LP, « Microbial strain collections and information », Microbial Biotechnology, (PMCID 4241729, DOI 10.1111/1751-7915.12135)
- ↑ Parte AC, « LPSN - list of prokaryotic names with standing in nomenclature », Nucleic Acids Research, vol. 42, , D613–D616 (PMID 24243842, PMCID 3965054, DOI 10.1093/nar/gkt1111)
- 1 2 3 (en) Jan P Meier-Kolthoff, Joaquim Sardà Carbasse, Rosa L Peinado-Olarte et Markus Göker, « TYGS and LPSN: a database tandem for fast and reliable genome-based classification and nomenclature of prokaryotes », Nucleic Acids Research, vol. 50, no D1, , D801-D807 (PMID 34634793, DOI 10.1093/nar/gkab902)
- ↑ Euzeby, « List of Bacterial Names with Standing in Nomenclature: a Folder Available on the Internet », International Journal of Systematic Bacteriology, vol. 47, no 2, , p. 590–2 (PMID 9103655, DOI 10.1099/00207713-47-2-590)
- ↑ (de) « Innovation für die globale Bakterienwelt », sur www.innovations-report.de (consulté le )
