Megalocytivirus
Megalocytivirus est un genre de virus géants de la famille des Iridoviridae[1].
| Domaine | Varidnaviria |
|---|---|
| Règne | Bamfordvirae |
| Phylum | Nucleocytoviricota |
| Classe | Megaviricetes |
| Ordre | Pimascovirales |
| Sous-ordre | Ocovirineae |
| Famille | Iridoviridae |
| Sous-famille | Alphairidovirinae |
ICTV, 2004
Espèces de rang inférieur
À l'instar des deux autres genres Lymphocystivirus et Ranavirus de la même sous-famille des Alphairidovirinae, les virus du genre Megalocytivirus peuvent infecter les poissons téléostéens, notamment d'élevage.
Systématique
modifierSelon l'ICTV, la systématique du genre Megalocytivirus est la suivante[1],[2] :
Famille : Iridoviridae
- Sous-famille : Alphairidovirinae
- Genre : Megalocytivirus
- Espèce : Megalocytivirus lates1 dont le virus de la maladie de la chute des écailles (SDDV)
- Espèce : Megalocytivirus spagrus1 (anciennement espèce type) avec le virus de la nécrose infectieuse de la rate et des reins (ISKV, ISKNV)
Par ailleurs, les espèces candidates suivantes ne sont pas encore classées[3] :
- Espèce : « Iridovirus du chevesne européen » (ECIV)[4]
- Espèce : « Iridovirus du bar géant » (GSIV-K1)[5]
- Espèce : « Iridovirus du mérou à taches oranges » (également appelé « Iridovirus d'Epinephelus coioides », OSGIV)[6]
- Espèce : « Iridovirus de la dorade rouge » (RSIV)[7],[8],[9]
- Espèce : « Iridovirus de la brème » (RBIV)[10]
- Espèce : « Iridovirus des cichlidés d'Amérique du Sud » (SACIV)[11]
- Espèce : « Iridovirus du turbot à corps rougeâtre » (TRBIV)[12],[13]
- Espèce : « Iridovirus du gourami à trois points » (TSGIV)[14]
Song et al. (2008) ont examiné la localisation géographique et la variation génétique du gène principal de la protéine de capside de 48 isolats de mégalocytivirus asiatiques et australiens. Ils ont ensuite élaboré un arbre phylogénétique dégageant trois groupes distincts. L'un de ces groupes (génotype I) est répandu dans plusieurs pays d'Asie, dont 13 isolats de Corée, neuf isolats du Japon, un de Thaïlande, un de Chine et un de la mer de Chine méridionale. En revanche, les deux autres génotypes présentaient une gamme d'hôtes plus restreinte et avaient une distribution plus locale. Les mégalocytivirus du génotype II infectent les poissons d'eau douce d'Asie du Sud-Est et d'Australie, tandis que les mégalocytivirus du génotype III ont principalement infecté les poissons plats de Chine et de Corée[15].
Références
modifier- 1 2 « Current ICTV Taxonomy Release | ICTV », sur ictv.global (consulté le )
- ↑ ICTV: Virus Metadata Resource (VMR).
- ↑ Maya A. Halaly, Kuttichantran Subramaniam, Samantha A. Koda, Vsevolod L. Popov, David Stone, KeithWay, Thomas B. Waltzek: Characterization of a Novel Megalocytivirus Isolated from European Chub (Squalius cephalus), in: MDPI – Viruses 2019, 11, 440; doi:10.3390/v11050440, PDF
- ↑ taxonomy, « Taxonomy browser (European chub iridovirus) », sur www.ncbi.nlm.nih.gov (consulté le )
- ↑ taxonomy, « Taxonomy browser (Giant seaperch iridovirus) », sur www.ncbi.nlm.nih.gov (consulté le )
- ↑ taxonomy, « Taxonomy browser (orange spotted grouper iridovirus) », sur www.ncbi.nlm.nih.gov (consulté le )
- ↑ CABI, « red sea bream iridoviral disease », CABI Compendium, vol. CABI Compendium, , p. 66796 (DOI 10.1079/cabicompendium.66796, lire en ligne, consulté le )
- ↑ (en) « Red sea bream iridoviral disease », sur The Fish Site, (consulté le )
- ↑ Yang Liu, Bich Ngoc Tran, Fan Wang, Puey Ounjai, Jinlu Wu, Choy L. Hew: Visualization of Assembly Intermediates and Budding Vacuoles of Singapore Grouper Iridovirus in Grouper Embryonic Cells, in: Sci Rep 6, 18696, 4, Januar 2016, doi:10.1038/srep18696
- ↑ taxonomy, « Taxonomy browser (Rock bream iridovirus) », sur www.ncbi.nlm.nih.gov (consulté le )
- ↑ taxonomy, « Taxonomy browser (South American cichlid iridovirus) », sur www.ncbi.nlm.nih.gov (consulté le )
- ↑ Qingli Zhang, Chenyin Shi, Jie Huang, Kuntong Jia, Xinhua Chen, Hong Liuc: Rapid diagnosis of turbot reddish body iridovirus in turbot using the loop-mediated isothermal amplification method, in: Journal of Virological Methods, Volume 158, Issues 1–2, Juni 2009, S. 18–23, doi:10.1016/j.jviromet.2009.01.008
- ↑ (en) « UniProt », sur UniProt (consulté le )
- ↑ taxonomy, « Taxonomy browser (Three spot gourami iridovirus) », sur www.ncbi.nlm.nih.gov (consulté le )
- ↑ (en) Jun-Young Song, Shin-Ichi Kitamura, Sung-Ju Jung et Toshiaki Miyadai, « Genetic variation and geographic distribution of megalocytiviruses », The Journal of Microbiology, vol. 46, no 1, , p. 29–33 (ISSN 1976-3794, DOI 10.1007/s12275-007-0184-6, lire en ligne, consulté le )
