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Protéine à doigt de zinc

classe de protéines

Les protéines à doigt de zinc (ou ZNF pour Zinc Fingers[1]) sont des protéines (à doigt de zinc) capables de se lier à l’ADN et régulant la transcription de nombreux gènes[2].

Types

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Il existe plusieurs types de protéines à doigt de zinc :

Types de protéines à doigt de zinc[3]
Type Nombre

de gènes

 Exemples de gènes
C2H2 (ZNF) 720 KLF4, KLF5, EGR3, ZFP637, SLUG, ZBP89, GLIS1, GLIS3
RNF 275 MDM2, BRCA1, RNF112 (uk) (ZNF179)
PHF 90 KDM2A, PHF1, ING1
LIM domain containing

[Traduire passage]

 53 ZNF185, LIMK1, PXN
NR 50 VDR, ESR1, NR4A1
CCCH (ZC3H) 35 RC3H1, HELZ, MBNL1, ZFP36, ZFP36L1
FYVE (ZFYVE) 31 EEA1, HGS, PIKFYVE
CCHC (ZCCHC) 25 CNBP, SF1, LIN28A
DHHC (ZDHHC) 24 ZDHHC2, ZDHHC8, ZDHHC9
MYND (ZMYND) 21 PDCD2, RUNX1T1, SMYD2, SMYD1
RANBP2 (ZRANB) 21 YAF2, SHARPIN, EWSR1
ZZ (ZZZ) 18 HERC2, NBR1, CREBBP
C2HC (ZC2HC) 16 IKBKG, L3MBTL1, ZNF746
GATA (GATAD) 15 GATA4, GATA6, MTA1
ZF class homeoboxes

and pseudogenes[Traduire passage]

 15 ADNP, ZEB1, ZHX1
THAP 12 THAP1, THAP4, THAP11
CXXC 12 CXXC1, CXXC5, MBD1, DNMT1
SWIM (ZSWIM) 9 MAP3K1, ZSWIM5, ZSWIM6
AN1 (ZFAND) 8 ZFAND3, ZFAND6, IGHMBP2
3CXXC (Z3CXXC) 8 ZAR1, RTP1, RTP4
CW (ZCW) 7 MORC1, ZCWPW1, KDM1B
GRF (ZGRF) 7 TTF2, NEIL3, TOP3A
MIZ (ZMIZ) 7 PIAS1, PIAS3, PIAS4
BED (ZBED) 6 ZBED1, ZBED4, ZBED6
HIT (ZNHIT) 6 ZNHIT3, DDX59, INO80B
MYM (ZMYM) 6 ZMYM2, ZMYM3, ZMYM4 (uk)
Matrin (ZMAT) 5 ZNF638, ZMAT1, ZMAT3, ZMAT5
C2H2C 3 MYT1, MYT1L, ST18
DBF (ZDBF) 3 DBF4, DBF4B, ZDBF2
PARP 2 LIG3, PARP1

Type C2H2 (ZNF)

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ZNF 1 à 99

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Liste de gènes ZNF 1 à 99
Nom OMIM Locus
ZNF37A

(KOX21,

ZNF37)

 616085[4] 10p11.1
ZNF41 314995[5] Xp11.3
ZNF43 603972[6] 19p12
ZNF90 603973[7] 19p12
ZNF91 603971[8] 19p12
ZNF92 603974[9] 7q11.21
ZNF93 603975[10] 19p12
ZNF94 603976[11] 19p13.1-p12
ZNF97 603979[12] 19
ZNF98 603980[13] 19p12
ZNF99 603981[14] 19p12

ZNF 100 à 199

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Liste de gènes ZNF 100 à 199
Nom OMIM Locus
ZNF100 603982[15] 19p12
ZNF101 603983[16] 19p13.11
ZNF103 603985[17] /
ZNF105 603987[18] /
ZNF107 603989[19] 7q11.21
ZNF109 603991[20] /
ZNF110 603992[21] 19p13.1-p12
ZNF111 603993[22] 19p13.1-p12
ZNF112 603994[23] 19q13.31
ZNF113 603995[24] 19p13.1-p12
ZNF114 603996[25] 19q13.33
ZNF118 603997[26] 19p13.1-p12
ZNF119 603998[27] 19p13.1-p12
ZNF120 603999[28] 19p13.1-p12
ZNF122 604000[29] 19p13.1-p12
ZNF136 604078[30] 19p13.2
ZNF137

(ZNF137P)

 604079[31] 19q13.41
ZNF138 604080[32] 7q11.21
ZNF182

(ZNF21)

 314993[33] Xp11.23

ZNF 200 à 299

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Liste de gènes ZNF 200 à 299
Nom OMIM Locus
ZNF204

(ZNF204P)

 603282[34] 6p21.3
ZNF208

(ZNF95)

 603977[35] 19p12
ZNF212 602386[36] 7q36.1
ZNF213

(CR53)

 608387[37] 16p13.3
ZNF214 605015[38] 11p15.4
ZNF215 605016[39] 11p15.4
ZNF222 617357[40] 19q13.31
ZNF224

(KOX22)

 194555[41] 19q13.31
ZNF229 620827[42] 19q13.31
ZNF263 604191[43] 16p13.3
ZNF264 604668[44] 19q13.43
ZNF281

(ZBP99,

ZNP99,

GZP1)

 618703[45] 1q32.1

ZNF 300 à 399

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Liste de gènes ZNF 300 à 399
Nom OMIM Locus
ZNF304 613840[46] 19q13.43
ZNF341 618269[47] 20q11.22
ZNF354C

(KID3)

 619511[48] 5q35.3

ZNF 400 à 499

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Liste de gènes ZNF 400 à 499
Nom OMIM Locus
ZNF432 620554[49] 19q13.41
ZNF443

(ZK1)

 606697[50] 19p13.2

ZNF 500 à 599

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Liste de gènes ZNF 500 à 599
Nom OMIM Locus
ZNF555 621580[51] 19p13.3
ZNF582 615600[52] 19q13.43
ZNF589

(SZF1)

 616702[53] 3p21.31
ZNF568 617566[54] 19q13.12

ZNF 600 à 699

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Liste de gènes ZNF 600 à 699
Nom OMIM Locus
ZNF628

(ZFP628, ZEC)

 610671[55] 19q13.42
ZNF695

(SBZF3)

 616348[56] 1q44
ZNF630 300819[57] Xp11.23

ZNF 700 à 799

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Liste de gènes ZNF 700 à 799
Nom OMIM Locus
ZNF746

(PARIS)

 613914[58] 7q36.1
ZNF750

(FLJ13841)

 610226[59] 17q25.3
ZNF777 619298[60] 7q36.1

ZNF 800 à 899

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Liste de gènes ZNF 800 à 899
Nom OMIM Locus
ZNF862 (uk) 620974[61] 7q36.1

RNF

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Article détaillé : Domaine RING.

Notes et références

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  1. ↑ « Les protéines aux doigts de zinc, les doigts de fée du vivant », sur Top of the Prots, (consulté le )
  2. ↑ « Dictionnaire médical de l'Académie de Médecine », sur www.academie-medecine.fr (consulté le )
  3. ↑ (en) « Table 1 Types of zinc-finger proteins | Cell Death Discovery », www.nature.com,‎ (lire en ligne, consulté le )
  4. ↑ (en) « ZINC FINGER PROTEIN 37A; ZNF37A » Accès libre, sur omim.org (consulté le )
  5. ↑ (en) « ZINC FINGER PROTEIN 41; ZNF41 » Accès libre, sur omim.org (consulté le )
  6. ↑ (en-US) « Entry - *603972 - ZINC FINGER PROTEIN 43; ZNF43 - OMIM » [archive du ], sur omim.org (consulté le )
  7. ↑ (en-US) « Entry - *603973 - ZINC FINGER PROTEIN 90; ZNF90 - OMIM » [archive du ], sur omim.org (consulté le )
  8. ↑ (en-US) « Entry - *603971 - ZINC FINGER PROTEIN 91; ZNF91 - OMIM » [archive du ], sur omim.org (consulté le )
  9. ↑ (en-US) « Entry - *603974 - ZINC FINGER PROTEIN 92; ZNF92 - OMIM » [archive du ], sur omim.org (consulté le )
  10. ↑ (en-US) « Entry - *603975 - ZINC FINGER PROTEIN 93; ZNF93 - OMIM » [archive du ], sur omim.org (consulté le )
  11. ↑ (en) « ZINC FINGER PROTEIN 94; ZNF94 » Accès libre, sur omim.org (consulté le )
  12. ↑ (en) « ZINC FINGER PROTEIN 97; ZNF97 » Accès libre, sur omim.org (consulté le )
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Articles connexes

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