LYRa11
| Domaine | Riboviria |
|---|---|
| Ordre | Nidovirales |
| Sous-ordre | Cornidovirineae |
| Famille | Coronaviridae |
| Sous-famille | Orthocoronavirinae |
| Genre | Betacoronavirus |
| Sous-genre | Sarbecovirus |
| Espèce | SARSr-CoV |
Le virus LYRa11 est une souche de coronavirus associé au SRAS (espèce SARSr-CoV), qui a été identifié en 2011 dans des échantillons de chauves-souris Rhinolophus affinis à Baoshan dans le Yunnan en Chine.
Le génome de cette souche virale a une longueur de 29 805 bases et est à 91 % similaire à la séquence génomique entière du SRAS-CoV, responsable l'épidémie de SRAS[1].
Le virus LYRa11, comme le SARS-CoV et le SARS-CoV-2, utilise l'ACE2 comme récepteur pour infecter les cellules[2].
Position phylogénétique modifier
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SARS-CoV-2, 79 % / SARS-CoV-1[10] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
- Animal hôte :
- chauve-souris
- viverridé
- humain
Références modifier
- He B, Zhang Y, Xu L, Yang W, Yang F, Feng Y et al., « Identification of diverse alphacoronaviruses and genomic characterization of a novel severe acute respiratory syndrome-like coronavirus from bats in China. », J Virol, vol. 88, no 12, , p. 7070-82 (PMID 24719429, PMCID 4054348, DOI 10.1128/JVI.00631-14, lire en ligne).
- H L Wells, M Letko, G Lasso, B Ssebide, J Nziza, D K Byarugaba, I Navarrete-Macias, E Liang, M Cranfield, B A Han, M W Tingley, M Diuk-Wasser, T Goldstein, C K Johnson, J A K Mazet, K Chandran, V J Munster, K Gilardi et S J Anthony, « The evolutionary history of ACE2 usage within the coronavirus subgenus Sarbecovirus », Virus Evolution, (ISSN 2057-1577, DOI 10.1093/ve/veab007)
- Kim Y, Son K, Kim YS, Lee SY, Jheong W, Oem JK, « Complete genome analysis of a SARS-like bat coronavirus identified in the Republic of Korea. », Virus Genes, vol. 55, no 4, , p. 545-549 (PMID 31076983, PMCID 7089380, DOI 10.1007/s11262-019-01668-w, lire en ligne)
- W. Li, « Bats Are Natural Reservoirs of SARS-Like Coronaviruses », Science, vol. 310, no 5748, , p. 676–679 (ISSN 0036-8075, DOI 10.1126/science.1118391)
- Xing‐Yi Ge, Ben Hu, and Zheng‐Li Shi, Bats and Viruses: A New Frontier of Emerging Infectious Diseases, First Edition., John Wiley & Sons, (lire en ligne), « BAT CORONAVIRUSES »
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- Susanna K. P. Lau, Yun Feng, Honglin Chen, Hayes K. H. Luk, Wei-Hong Yang, Kenneth S. M. Li, Yu-Zhen Zhang, Yi Huang, Zhi-Zhong Song, Wang-Ngai Chow, Rachel Y. Y. Fan, Syed Shakeel Ahmed, Hazel C. Yeung, Carol S. F. Lam, Jian-Piao Cai, Samson S. Y. Wong, Jasper F. W. Chan, Kwok-Yung Yuen, Hai-Lin Zhang, Patrick C. Y. Woo et S. Perlman, « Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) Coronavirus ORF8 Protein Is Acquired from SARS-Related Coronavirus from Greater Horseshoe Bats through Recombination », Journal of Virology, vol. 89, no 20, , p. 10532–10547 (ISSN 0022-538X, DOI 10.1128/JVI.01048-15)
- Xing-Yi Ge, Jia-Lu Li et Xing-Lou Yang, « Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor », Nature, vol. 503, no 7477, , p. 535–8 (PMID 24172901, PMCID 5389864, DOI 10.1038/nature12711, Bibcode 2013Natur.503..535G)
- Yang XL, Hu B, Wang B, Wang MN, Zhang Q, Zhang W, « Isolation and Characterization of a Novel Bat Coronavirus Closely Related to the Direct Progenitor of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus. », J Virol, vol. 90, no 6, , p. 3253-6 (PMID 26719272, PMCID 4810638, DOI 10.1128/JVI.02582-15, lire en ligne)
- Hu Ben, Guo Hua, Zhou Peng et Shi Zheng-Li, « Characteristics of SARS-CoV-2 and COVID-19. », Nature Reviews Microbiology, no 19, , p. 141-154 (DOI 10.1038/s41579-020-00459-7, lire en ligne)
