En 2015, au [[Brésil]], la société est soupçonnée de [[corruption]]<ref name=":0">{{Article|titre = Brazil police uncover another fraud scheme at finance ministry|périodique = Reuters|date = 2015-07-01|lire en ligne = https://www.reuters.com/article/2015/07/01/brazil-tax-fraud-idUSL1N0ZH0KT20150701|consulté le = 2015-10-23}}</ref> dans une enquête relative à l'attribution d'un contrat concernant le suivi des consommations de boisson (SICOBE). Charles Nelson Finkel, vice-président exécutif de SICPA<ref>[https://www.prnewswire.com/news-releases/meyercord-revenue-inc-a-sicpa-company-unveils-next-generation-excise-tax-solution-to-aid-governments-in-collecting-much-needed-tobacco-excise-taxes-123740149.html PR Newswire]</ref> aurait versé 32 millions $<ref>{{Lien web|titre = Sigarette, svolta sulla tracciabilità. Scacco matto al contrabbando?|url = http://www.affaritaliani.it/fattieconti/sigarette-svolta-sulla-tracciabilita-scacco-matto-al-contrabbando-375386.html|site = Affaritaliani.it|consulté le = 2015-10-23}}</ref> de [[Corruption|pots-de-vin]]<ref name=":0" /> à des fonctionnaires de l'agence de l'Impôt fédéral et de la Monnaie brésilienne afin de s'assurer l'obtention du contrat<ref name=":0" /> de plusieurs milliards d'euros<ref name=":0" />. Il est placé en détention préventive jusqu'en mars 2018, puis sous contrôle judiciaire<ref>[https://www.jusbrasil.com.br/diarios/documentos/554625640/andamento-do-processo-n-2016-0278181-8-pet-recurso-habeas-corpus-12-03-2018-do-stj?ref=topic_feed JusBrasil]</ref>. En juin 2016, le haut fonctionnaire brésilien responsable de l'attribution du marché à SICPA est incarcéré dans le cadre de cette affaire<ref>[http://politica.estadao.com.br/blogs/coluna-do-estadao/operacao-esfinge-prendeu-auditor-da-receita-que-atua-na-area-de-fiscalizacao/ Operação Esfinge prendeu auditor da Receita que chefiou área de fiscalização], Estadao</ref>. En 2018, l'affaire est encore en cours<ref>[https://www.jusbrasil.com.br/diarios/136755436/trf-2-jud-jfrj-08-02-2017-pg-674 JusBrasil]</ref>. La Casa da Moeda a détaillé les conditions d’attributions du contrat dans une note concernant la procédure d’appel d’offres<ref>[http://www.casadamoeda.gov.br/portalCMB/noticias La Casa da Moeda]</ref> et le contrat avec SICPA a été annulé<ref>[https://www.neweurope.eu/article/commission-troubled-over-tobacco-traceability-and-security-bids/ NewEurope]</ref>. SICPA affirme n'avoir commis aucune irrégularité et coopérer pleinement avec les autorités<ref>{{Lien web|titre = Top euro banknote security firm faces Brazil probe|url = http://www.politico.eu/article/euro-bank-security-greece-faces-brazil-tax-million/ |site = Politico.eu|consulté le = 2015-7-16}}</ref>. Le gouvernement brésilien poursuit également sa collaboration avec l'entreprise, notamment pour la traçabilité des produits du tabac (contrat SCORPIOS), prolongé en 2017<ref>{{Lien web|langue=|titre=Diario Oficial de Uniao|url=http://www.consultaesic.cgu.gov.br/busca/dados/Lists/Pedido/Attachments/636967/RESPOSTA_PEDIDO_Resposta%20e-%20SIC%2099916000028201829%20-%20Amanda%20Dudenhoeffer%20Braga%20-%20DOU%20N%20167%20-%20Seo%203%20-%2030-08-2017%20-%205%20Ter.pdf|site=cgu.gov.br|date=30 août 2017|consulté le=}}</ref>.
En 2017, les poursuites pour corruption en cours au Brésil font naître une polémique en Équateur après la signature d'un contrat de traçabilité de 73 millions $ de SICPA dans le pays : selon le journal ''[[:es:La Hora (Ecuador)|La Hora]]'', « le système n'a pas été exempt de controverse en raison de son coût, des liens avec une société poursuivie au Brésil, et parce que la société Sicpa était la seule à avoir soumis une proposition »<ref>[https://lahora.com.ec/noticia/1102029409/sri-contrata-empresa-vinculada-a-corrupcic3b3n- L'Internal Revenue Service choisit une société liée à des affaires de corruption], ''La Hora''</ref>. Les autorités fiscales du pays (''Servicio de Rentas Internas'') ont demandé au Brésil et à la Suisse de fournir des explications sur le dossier brésilien<ref>[http://www.sri.gob.ec/web/guest/transparencia1 Correspondances entre le SRI et SICPA]</ref>, tandis qu'un blog du journal ''[[:es:La República (Ecuador)|La República]]'' souligne que la société a fait preuve d'un « haut niveau d'opacité » dans ses activités en Equateur et questionne les pratiques de lobbying de la société<ref>[https://www.larepublica.ec/blog/economia/2017/02/24/sri-pide-investigar-en-brasil-a-empresa-con-la-que-firmo-contrato-en-2016/ SRI pide investigar en Brasil a empresa con la que firmó contrato en 2016]</ref>.
