« Raoultella » : différence entre les versions
Contenu supprimé Contenu ajouté
m →Historique : suppression d'une répétition |
→Phylogénies : Travail inédit, et surtout stupidité puisque les auteurs synonymisent les deux genres ! |
||
Ligne 31 :
En 2001, des analyses [[phylogénie|phylogénétiques]] d'[[espèce]]s du [[genre (biologie)|genre]] ''[[Klebsiella]]'', ainsi que d'espèces parmi d'autres genres de la famille des ''[[Enterobacteriaceae]]'', et portant sur deux gènes de référence en taxonomie (l'ARNr 16S et rpoB) révèlent que le genre ''Klebsiella'' est hétérogène<ref name="Drancourt"/>. Ce genre est alors scindé en deux et le genre ''Raoultella'' créé, intégrant les espèces ''K. ornithinolytica'', ''K. planticola'', ''K. trevisanii'' (synonyme de ''K. planticola'') et ''K. terrigena''<ref name="Drancourt"/>. Une autre étude phylogénétique portant sur les gènes ''gyrA'' et ''parC'', publiée en parallèle dans le même journal confirme l'hétérogénéité du genre ''Klebsiella'' où {{citation|les données des séquences supportent la séparation évolutive de ''K. pneumoniae'' d'un groupe phylogénétique incluant ''K. oxytoca'', ''Klebsiella planticola'' et ''Klebsiella ornithinolytica''<ref name=Brisse2001>{{article |langue=en |prénom1=Sylvain |nom1=Brisse |prénom2=Jan |nom2=Verhoef |titre=Phylogenetic diversity of Klebsiella pneumoniae and Klebsiella oxytoca clinical isolates revealed by randomly amplified polymorphic DNA, gyrA and parC genes sequencing and automated ribotyping |périodique=International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology |année=2001 |date=01 mai 2001 |volume=51 |numéro=3 |pages=915-924 |doi=10.1099/00207713-51-3-915}}</ref>.}}
En 2014, une nouvelle analyse phylogénétique basée sur le gène de l'ARNr 16S mais incluant l'ensemble des espèces et tous les genres de la famille des ''Enterobacteriaceae'' différencie le genre ''Raoultella'' des ''Klebsiella'', et conclut que {{citation|[...] ''Providencia'', ''Raoultella'' [...] sont regroupées dans un seul [[Cluster de gènes|cluster]] (chacune) [...] et donc sont très certainement monophylétiques}}, alors que {{citation|sept genres [...] ''Escherichia'', ''Klebsiella'' [...] sont certainement polyphylétiques{{sfn|Octavia|Lan|2014|p=235|id=Prok}}}} avec les ''Klebsiella'' séparées en trois groupes{{sfn|Octavia|Lan|2014|p=235|id=Prok}}{{,}}<ref> Un groupe contenant la majorité des ''Klebsiella'', un groupe contenant ''K. oxytoca'' et ''Enterobacter gergoviae'', un groupe contenant ''K. michiganensis'' proche du groupe ''K. oxytoca'' mais indépendant</ref>.
=== Liste d'espèces ===
|