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Le caractère de la chaîne de squelette dépend du type de polymérisation : dans la [[Polymérisation par étapes|polymérisation par croissance par étapes]], le fragment du [[monomère]] devient le squelette, et ainsi le squelette est typiquement fonctionnel. Il s'agit notamment des [[polythiophène]]s ou des polymères à faible bande interdite dans les [[Semi-conducteur organique|semi-conducteurs organiques]]<ref>{{Article |nom1=Budgaard |prénom1=Eva |nom2=Krebs |prénom2=Frederik |titre=Low band gap polymers for organic photovoltaics |périodique=Solar Energy Materials and Solar Cells |volume=91 |numéro=11 |date=2006 |doi=10.1016/j.solmat.2007.01.015 |pages=954–985}}.</ref>. Dans la [[Polymérisation en chaîne|polymérisation par croissance de chaîne]], généralement appliquée pour les [[alcène]]s, le squelette n'est pas fonctionnel, mais porte des [[Chaîne latérale|chaînes latérales]] fonctionnelles ou des groupes pendants.
 
Le caractère du squelette, c'est-à-dire sa flexibilité, détermine les propriétés thermiques du polymère (comme la [[température de transition vitreuse]]). Par exemple, dans les [[polysiloxane]]s ([[silicone]]), la chaîne principale est très flexible, ce qui se traduit par une température de transition vitreuse très basse de {{tmp|-123|°C}}<ref>{{Lien web |titre=Polymers |url=http://courses.chem.psu.edu/chem112/materials/polymers.html |consulté le=2015-09-17 |archive-url=https://web.archive.org/web/20151002172625/http://courses.chem.psu.edu/chem112/materials/polymers.html |archive-date=2015-10-02}}.</ref>. Les polymères à squelettes rigides sont sujets à la [[Cristallisation (chimie)|cristallisation]] (par exemple les [[polythiophène]]s) en [[Couche mince|couches minces]] et en [[Solution (chimie)|solution]]. La cristallisation à son tour affecte les propriétés optiques des polymères, sa [[Théorie des bandes|bande interdite]] optique et les niveaux électroniques<ref>{{Article |nom1=Brabec |prénom1=C.J. |nom2=Winder |prénom2=C. |nom3=Scharber |prénom3=M.C |nom4=Sarıçiftçi |prénom4=S.N. |titre=Influence of disorder on the photoinduced excitations in phenyl substituted polythiophenes |périodique=Journal of Chemical Physics |volume=115 |numéro=15 |date=2001 |doi=10.1063/1.1404984 |bibcode=2001JChPh.115.7235B |lire en ligne=https://pure.rug.nl/ws/files/6636890/2001BrabecJChemPhys.pdf |pages=7235}}.</ref>.
 
=== Biochimie ===
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