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Les ouvrages utilisés pour les besoins du film étaient si remarquablement imités, par la qualité des [[enluminure]]s et des [[reliure]]s, que certains d'entre eux furent volés durant le tournage, cette indélicatesse obligeant l'équipe à mettre les livres au coffre à la fin de chaque journée de travail.
L'historien [[médiéviste]] [[Michel Pastoureau]] raconte durant une interview<ref>Interview de [[Michel Pastoureau]] sur [[France Inter]] dans l'émission ''Le grand entretien'' du jeudi {{date-|27 janvier 2011}}.</ref> qu'au [[Moyen Âge]] les porcs n'étaient pas roses mais noirs et, comme on avait beaucoup de mal à en trouver de cette couleur pour le tournage, on utilisa des porcs « roses » que l'on avait peints. Les porcs se frottant les uns contre les autres, la peinture tenait difficilement.
La scène érotique entre [[Christian Slater]] et [[Valentina Vargas]] a été tournée avec une équipe minimale, l'actrice ayant demandé le départ de tous y compris des producteurs, et en une seule prise<ref name=rencontre/>.
Lors de la scène finale, le décor de sept étages de l'abbaye est entièrement détruit pour les besoins du scénario : l’incendie est filmé par sept caméras mais seules trois ont fonctionné. Annaud a alors l'idée de « floper » (inverser) et grossir les images des caméras restantes pour diversifier les prises de vue du brasier<ref name="Cras"/>.
Parce qu'il avait froid aux pieds, l'acteur [[Sean Connery]] tournait les scènes d'extérieur en [[Moon Boot]]s. Le réalisateur Jean Jacques Annaud s'arrangeait pour ne pas le cadrer en pied, et des bruits de sandales dans la neige furent rajoutés en post production<ref>{{Ouvrage|langue=fr|prénom1=Florian|nom1=GAZAN|titre=Le Petit Livre à lire aux toilettes... Le Retour|éditeur=edi8|date=2019-02-21|isbn=978-2-412-04701-9|lire en ligne=https://books.google.fr/books?id=6umIDwAAQBAJ&pg=PT74&lpg=PT74&dq=sean+connery+moon+boots&source=bl&ots=Dwrq1-VEjl&sig=ACfU3U0ySzNANUOsB7rAo9qXA2tn0T_fXA&hl=fr&sa=X&ved=2ahUKEwirysbBkKTpAhVKCxoKHXJeCxsQ6AEwD3oECAkQAQ#v=onepage&q=sean%20connery%20moon%20boots&f=false|consulté le=2020-05-08}}</ref>.
L'abbaye bénédictine ayant inspiré Umberto Eco est aussi celle du film, l'[[abbaye Saint-Michel-de-la-Cluse]], symbole du [[Piémont]].