[[Fichier:FCRouen-SMCaen2.jpg|thumb|Au fond du terrain, la bâche du « KIR » dans la tribune Sud (2004).|alt=Vue d'une tribune à l'autre bout du terrain pendant un match]]
Le club compte depuis 2012 deuxtrois groupes de supporters actifs, situé à domicile dans laLa tribuneTribune Lenoble et dans La Tribune Sud : les ''Rouen Fans'' en tribune Sud, groupe à la mentalité [[Ultras (supporters)|ultras]] fondé en 2012, et le ''12 Rouennais'', fondé en 2004<ref>{{lien web |url=http://www.supporters-12rouennais.com/ |titre=Site officiel de 12 Rouennais |consulté le=18 janvier 2011}}.</ref> et le ''Kop Lenoble'' fondé en 2023. Depuis le début de la saison 2015-2016, les différentes entités ont décidé de se regrouper dans le Bloc H (bloc historique du supporterisme rouennais) pour raviver une ferveur et prouver aux dirigeants de l'USQRM que le FC Rouen n'est pas mort. Ce regroupement va permettre aux Rouen Fans de reprendre petit à petit leurs activités correctement après deux saisons d'essoufflement en DH. La ferveur est telle que le bloc H recommence à se remplir pour pousser les diables rouges jusqu'à la remontée en N3 à la fin de la saison 2016-2017. Les Rouen Fans sont un acteur majeur dans la reconstruction du club et sa survie face au projet QRM. En 2019, ils se décalent entre les deux blocs H et F à cause de leur nombre devenus trop important à chaque match pour rester uniquement dans le bloc H de la tribune Lenoble. En 2023, le club monte en National. Les Rouen Fans décident de migrer en tribune Sud au début de la saison 2023-2024 afin de retrouver une mentalité plus ultra et revenir aux bases du mouvement ultra rouennais fondé dans cette tribune en 2003. Ce qui amène à la création du Kop Lenoble en 2023 qui prend la place laissée libre par les Rouen Fans entre les blocs H et F de la tribune Lenoble.
Ces vingt dernières années, quatre autres groupes ont existé : le [[kop]] ''Diochon Boys'' (DB96) (fondé en 1996), le Diaboli'Kop 02 (fondé en 2002), leles RedUltras BoyRouen 082011 (fondé en 20082011),et le Ultras''Kollectif RouenIndépendant 2011Rouennais'' (KIR), fondé au moment de la remontée du club en 2011)Ligue 2 en 2003. Ce dernier, situé en tribune Sud, est mis en cause lors d'un incident lors d'un match à Dunkerque en 2008 et arrête progressivement ses activités de groupe quelques mois plus tard. Le Diaboli'Kop cesse lui ses activités après le match FC Rouen - [[Union sportive Boulogne Côte d'Opale|US Boulogne]] du 2 novembre 2012.
et le ''Kollectif Indépendant Rouennais'' (KIR), fondé au moment de la remontée du club en Ligue 2 en 2003. Ce dernier, situé en tribune sud, est mis en cause lors d'un incident lors d'un match à Dunkerque en 2008 et arrête progressivement ses activités de groupe quelques mois plus tard. Le Diaboli'Kop cesse lui ses activités après le match FC Rouen - [[Union sportive Boulogne Côte d'Opale|US Boulogne]] du 2 novembre 2012.
Par ailleurs, parmi les supporters célèbres du FC Rouen on compte notamment [[François Hollande]], [[président de la République française]] de 2012 à 2017, qui a vécu à Rouen jusqu'à ses 14 ans et a joué dans les équipes du club en minimes et cadet<ref>{{Lien web | auteur=Stéphane Alliès |url=http://blogs.mediapart.fr/edition/coup-de-tete/article/061109/francois-hollande-l-autre-vision-du-football |titre=François Hollande, l'autre vision du football|jour=6|mois=11|année=2009|site=[[Mediapart]]|consulté le= 26 mars 2012}}.</ref>.