Utilisateur:Þþanon/Chronologie de la pandémie de Covid-19 en 2019

Cet article traite de la chronologie et de l'épidémiologie en 2019 du SRAS-CoV-2, le virus qui cause la maladie coronavirus 2019 (COVID-19) et qui est responsable de la pandémie de COVID-19. Les premiers cas humains de COVID-19 ont été identifiés à Wuhan, Hubei, Chine intérieure, en Chine, en décembre.

Avant décembre

L'étude de l'origine du SRAS-CoV-2 en comparant les séquences génétiques est compliquée par son faible taux d'évolution, dû à la relecture par l'exoribonucléase virale (ExoN), et le faible échantillonnage des premiers centres d'infection à Wuhan, en Iran et en Italie[1]. On ne sait pas si le virus lui-même a évolué dans des populations d'animaux sauvages ou si ses protéines de pointe distinctives ont été sélectionnées pour un transfert zoonotique à l'homme[6][7][2][3].

Une étude de septembre 2020 a noté que "la possibilité que l'infection COVID-19 se soit déjà propagée en Europe à la fin de l'année dernière est maintenant indiquée par des preuves abondantes, même si elles sont partiellement circonstanciées", notamment le nombre de cas de pneumonie et la radiologie en France et en Italie en novembre et décembre[8].

Des tests RT-PCR sur des échantillons d'eaux usées non traitées provenant du Brésil et de l'Italie ont suggéré la détection du SRAS-CoV-2 dès novembre et décembre 2019, respectivement, mais les méthodes de ces études sur les eaux usées n'ont pas été optimisées, beaucoup n'ont pas fait l'objet d'un examen par des pairs, les détails manquent souvent et il y a un risque de faux positifs dus à la contamination ou si une seule cible génétique est détectée[9].

Des anticorps au domaine de liaison au récepteur SRAS-COV-2 ont été signalés chez 111 (11,6 %) des 959 participants asymptomatiques à un essai de dépistage du cancer du poumon en Italie à partir du 3 septembre 2019, ce qui, selon les auteurs, pourrait indiquer un début plus précoce de la pandémie de COVID-19. L'Organisation mondiale de la santé a déclaré qu'elle examinait les résultats, qu'elle cherchait à vérifier les résultats de la neutralisation et que "la possibilité que le virus ait pu circuler silencieusement ailleurs ne peut être exclue"[10] [11]. Ces tests de séroprévalence sont sujets à des faux positifs, peut-être en raison d'une réactivité croisée avec d'autres coronavirus, et doivent être confirmés[12].

1er décembre

Les symptômes du cas index, ou patient zéro, ont commencé le 1er décembre[13]. L'homme n'était pas allé au marché de gros des fruits de mer de Huanan. Sa famille n'a pas été touchée, et aucun lien épidémiologique n'a été trouvé entre lui et les autres cas confirmés en laboratoire au 2 janvier[13]. Wu Wenjuan, médecin-chef à l'hôpital Jinyintan, a déclaré que l'homme était septuagénaire, avait la maladie d'Alzheimer, vivait à plusieurs trajets de bus du marché et n'avait pas quitté son domicile[14].

16 décembre

En février 2020, les premières admissions hospitalières COVID-19 documentées dans le monde étaient datées du 16 décembre 2019 à Wuhan[13].

24 décembre

Un cas clinique non résolu déclenche la première implication scientifique : un échantillon de liquide de lavage bronchoalvéolaire (LBA) a été envoyé de l'hôpital central de Wuhan à Vision Medicals (广州微远基因科技) à Guangzhou, une société privée spécialisée dans l'analyse de séquençage parallèle massif en métagénomique[16] [17] Selon le dossier de GenBank, l'échantillon a été obtenu le 23 décembre, alors que Ren et al.,Chin Med J, 2020 fixe la date au 24 décembre 2019[18] [19].

26 décembre

Un couple de personnes âgées souffrant de fièvre et de toux s'est fait soigner à l'hôpital provincial de médecine chinoise et occidentale intégrée de Hubei (湖北省新华医院). Zhang Jixian, directeur du Département des soins respiratoires et intensifs, a examiné le couple et a posé le diagnostic préliminaire de leur maladie comme quelque chose qui "ressemblait à une grippe ou une pneumonie courante" [20] [21]. 27 décembre

Après avoir constaté que les scanners du couple de personnes âgées étaient anormaux, Zhang Jixian a demandé au fils du couple de passer un scanner et a trouvé le même schéma. Zhang Jixian avait travaillé comme expert médical lors de l'épidémie de SRAS en 2003, et connaissait les signes d'une épidémie suspecte de maladie infectieuse[20][21]. Un autre patient, un marchand du marché de gros des fruits de mer de Huanan[21], est arrivé à l'hôpital avec de la fièvre et une toux ce jour-là, et son scanner a montré les mêmes caractéristiques. Tous les tests sanguins des quatre patients ont indiqué une infection virale et une autre série de tests liés à la grippe sont revenus négatifs. Zhang Jixian a fait un rapport à ses supérieurs et a également pris la précaution de faire une zone de quarantaine provisoire[20][21].

L'hôpital central de Wuhan est informé par téléphone par Vision Medicals que l'échantillon de LBA prélevé le 24 décembre contenait un nouveau type de coronavirus (en chinois : ... "一种新的冠状病毒。" ; ... "un nouveau type de coronavirus")[16], et le patient a alors été mis en quarantaine[22]. Vision Medicals envoie également un rapport écrit à l'Académie chinoise des sciences médicales. Le rapport dit : ... "样本里面确实有一个跟Bat SARS like coronavirus类似的新型病毒" ; ... "un échantillon contenant un nouveau coronavirus similaire au coronavirus du SRAS des chauves-souris" et dans les jours qui suivent, il y a une communication intensifiée entre le PDG de Vision Medicals Li Youngjun (李永军), l'hôpital central de Wuhan et le CDC local[22].

Toujours à l'hôpital central de Wuhan, un autre cas non résolu a entraîné le prélèvement d'un échantillon de LBA, cette fois-ci envoyé au CapitalBio Medlab de Pékin (北京博奥医学检验所)[16].

Des échantillons respiratoires provenant d'un homme hospitalisé à Paris, en France, ont été diagnostiqués rétrospectivement (étude du 14 avril, publiée le 3 mai) comme contenant le virus du SRAS-CoV-2. Il présentait des symptômes avancés (scanner thoracique ) et son enfant avait déjà présenté une maladie de type grippal. L'homme n'avait pas voyagé récemment (son dernier voyage hors de France avait eu lieu en Algérie en août 2019), bien que sa femme ait travaillé près d'un aéroport[8][23][24][25] Les circonstances épidémiologiques n'ont pas été étudiées[26] et il est possible que l'échantillon ait été contaminé[27] (Note : ces résultats ne figurent pas dans l'aperçu statistique du ministère français de la santé publique[28]).

Selon des informations de février 2020 - Workers Daily, Global Times - à l'hôpital provincial de Hubei de médecine chinoise et occidentale intégrée et suite au rapport du docteur Zhang Jixian, l'hôpital a immédiatement alerté le CDC local, le Centre de prévention et de contrôle des maladies de Wuhan Jianghan[21], cependant, le rapport du 22 janvier 2020 du CDC chinois semble affirmer que ce contact est tombé le 29 décembre[29].

29 décembre

Ce jour-là et le précédent, trois cas similaires sont arrivés à l'hôpital provincial de Hubei de médecine chinoise et occidentale intégrée, tous liés au marché des fruits de mer. Les autorités sanitaires avaient été informées, et des experts médicaux de l'hôpital Wuhan JinYinTan, "un hôpital désigné pour traiter les maladies infectieuses"[30] sont venus transférer six des sept patients. Zhang Jixian a pris l'initiative de laisser les médecins et les infirmières du service respiratoire porter des masques faciaux, et a passé commande de 30 couches de toile fine pour l'hôpital[20]. L'administration de l'hôpital provincial de Hubei de médecine chinoise et occidentale intégrée a convoqué un groupe de médecins interdépartemental, dont les conclusions étaient que les cas étaient inhabituels et nécessitaient une attention particulière, et ayant également eu connaissance de deux cas similaires dans la ville, a décidé de faire part de ses conclusions aux autorités sanitaires municipales et provinciales, à la commission sanitaire municipale de Wuhan et au comité sanitaire de la province de Hubei[21].

Le personnel du CDC de Wuhan a également trouvé d'autres patients présentant des symptômes similaires qui étaient liés au marché[29] (Le "Center for Disease Control and Prevention" (CDC) de Wuhan fait partie du Centre chinois de contrôle et de prévention des maladies).

Le 30 décembre

L'hôpital central de Wuhan reçoit un rapport du CapitalBio Medlab indiquant que leur échantillon (obtenu le 27 décembre) contient le coronavirus du SRAS[16], ce qui est une erreur, selon un reportage de Caixin et les médias sociaux[22], qui affirment que cet échantillon a ensuite été envoyé par le CapitalBio Medlab à Vision Medicals, et que Vision Medicals a pu confirmer que l'échantillon contenait le SRAS-CoV-2, c'est-à-dire qu'il était identique au premier échantillon que Vision Medicals avait reçu[22].

Plusieurs médecins de l'hôpital central de Wuhan ont partagé le rapport de test sur les médias sociaux ("社交媒体") lors de discussions principalement destinées à des collègues[16]. Comme l'indique Caixin Online, d'après le compte rendu de Li Wenliang sur les médias sociaux, il y aurait sept cas de SRAS à l'hôpital central de Wuhan, tous liés au marché de gros des fruits de mer à Huanan[16].

Pour les professionnels de la vue, ce sont également des journées très chargées (27-30 décembre), le CDC chinois demandant tous les résultats des professionnels de la vue et de l'Académie chinoise des sciences médicales : "c'était une enquête urgente, secrète et sérieuse"[22]. Premiers messages officiels

La Commission municipale de santé de Wuhan a envoyé un message sur papier à ses institutions affiliées[31], contenant des lignes directrices pour faire face à une éventuelle épidémie de pneumonie infectieuse[31]. Deux copies scannées ont également été envoyées le même jour au service Weibo QQ, une plateforme de médias sociaux[32][33][34].

Les médecins superviseurs doivent respecter la discipline et créer des équipes spécialisées.

   Le personnel général doit être attentif à la situation, notamment en gardant un œil sur les patients présentant des symptômes de pneumonie infectieuse.
   Des données statistiques doivent être recueillies en permanence et envoyées à la commission sanitaire de la municipalité de Wuhan et au comité sanitaire de la province de Hubei.
   Le matériel statistique de la semaine précédente, relatif aux patients présentant des symptômes de pneumonie infectieuse, doit être envoyé à la commission sanitaire de la municipalité de Wuhan avant 16 heures ce jour-là.
   Sans l'autorisation du personnel autorisé, personne n'est autorisé à diffuser des informations sur le traitement médical[32][33].

Première alerte internationale

FluTrackers, un site web international de suivi des maladies créé en 2006, a été le premier rapport à atteindre un contexte international sur la situation à Wuhan le 30 décembre à 23:35:00 tel qu'enregistré dans Internet Archive et rapporté par le Washington Post, Forbes, et CIDRAP[35][36][37][38] Le programme de rapport ProMED, sous l'égide de l'ISID, a rendu compte de la situation à Wuhan. La date complète est en fait le 30 décembre 23:59:00 [31].

L'OMS a peut-être aussi remarqué les informations provenant de Wuhan [39].

31 décembre

Premier message public

La Commission municipale de la santé de Wuhan a publié sur son site web un briefing sur les premiers signes d'une épidémie de pneumonie dans la ville[40]. Le message donne une impression de vigilance, en résumant les ordres donnés hier aux hôpitaux de la ville, en mettant l'accent sur les enquêtes scientifiques et cliniques en cours et sur la nécessité de se faire soigner à l'hôpital en cas de fièvre persistante tout en présentant des symptômes de pneumonie, ainsi qu'en conseillant au public de porter des masques faciaux et d'éviter les lieux publics fermés et les zones encombrées.

   Nombre total de cas : 27
   Cas graves : 7
   Guérissant : 2
   Pour l'instant : aucun décès, aucun travailleur de la santé infecté, aucun signe de transmission interhumaine, la cause de l'infection par la pneumonie est toujours à l'étude

Le message sur la pneumonie d'étiologie inconnue a été repris par les agences de presse, notamment la télévision d'État CCTV[41], les agences de presse locales, comme le Hubei Daily[42], et les médias sociaux, comme le compte-rendu de Weibo sur la CCTV. Le People's Daily a déclaré que la cause exacte restait incertaine, et qu'il serait prématuré de spéculer[44]. Par le biais du compte-rendu de Weibo "YangShiXinWen", la CCTV a également envoyé une alerte concernant le virus inconnu, ajoutant qu'une équipe d'experts de la Commission nationale de la santé arriverait à Wuhan[41]. [43] [Une meilleure source est nécessaire]

Les agences internationales ont également repris les rapports, notamment Reuters, [45] Deutsche Welle [46] et le South China Morning Post [44].

Qu Shiqian, un vendeur du marché de gros des fruits de mer à Huanan, a déclaré que les fonctionnaires du gouvernement avaient désinfecté les locaux le 31 décembre et dit aux vendeurs de porter des masques. Qu a déclaré qu'il n'avait appris l'existence de l'épidémie de pneumonie que par les reportages des médias. "Auparavant, je pensais qu'ils avaient la grippe", a-t-il dit. "Cela ne devrait pas être grave. Nous sommes des commerçants de poissons. Comment pouvons-nous être infectés ?" [44] Réponses interrégionales et internationales

En réponse à l'annonce de Wuhan, le Centre pour la protection de la santé de Hong Kong a renforcé ses procédures de contrôle à l'arrivée. Il a annoncé que diverses "mesures de surveillance à tous les points de contrôle frontaliers" ont été mises en place - y compris l'imagerie thermique pour le contrôle de la température corporelle[47]. Le centre a appelé le public à respecter les règles d'hygiène, avec des conseils détaillés sur le lavage des mains et le port d'un masque, ainsi que des précautions supplémentaires pour les voyages en dehors de Hong Kong[47]. La secrétaire d'État à l'alimentation et à la santé de Hong Kong, Sophia Chan, a annoncé que "[tous les cas suspects], y compris la présentation de fièvre et de maladie respiratoire aiguë ou de pneumonie, et les antécédents de voyage à Wuhan dans les 14 jours précédant l'apparition des symptômes, nous mettrons les patients en isolement"[44].

Tao Lina, expert en santé publique et ancien fonctionnaire du Centre de contrôle et de prévention des maladies de Shanghai, a déclaré : "Je pense que nous sommes [maintenant] tout à fait capables de le tuer dans la phase initiale, étant donné le système de contrôle des maladies, la capacité de traitement des urgences et le soutien de la médecine clinique de la Chine". Aucune infection interhumaine n'a été signalée jusqu'à présent et d'autres tests et enquêtes pathologiques sont en cours, a déclaré un fonctionnaire[44].

Le bureau de l'Organisation mondiale de la santé en Chine a repris la déclaration aux médias du site web de la Commission municipale de santé de Wuhan sur les cas de pneumonie virale[48]. Le bureau de l'OMS en Chine a ensuite informé le Bureau régional de l'OMS pour le Pacifique occidental de l'avis du gouvernement de Wuhan[48].

Le CDC américain affirme avoir "appris ce jour-là l'existence d'un "groupe de 27 cas de pneumonie" à Wuhan"[49].

Source

Cet article est issu d'une traduction de https://en.wikipedia.org/wiki/Timeline_of_the_COVID-19_pandemic_in_2019. Voir la liste des auteurs https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Timeline_of_the_COVID-19_pandemic_in_2019&action=history

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