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Présentation de WikipediaBioReferences

WikipediaBioReferences est un petit logiciel libre prenant en entrée un taxon (nom scientifique uniquement) et générant du code wikipédia référençant des pages web décrivant ce taxon.

Ces pages sont choisies parmi une liste de sites couramment référencés par wikipédia, au point qu'il existe un Modèle pour leurs références (voir la catégorie Modèle de biologie créant un lien externe).

Ce programme est en java avec une interface graphique simple.

Le code wiki généré par WBR n'est pas destiné à être recopié intégralement sans discernement sur les articles. C'est une aide à la rédaction des ébauches, dont le contenu dépendra du groupe concerné et des conventions au sein des projets (voir notamment Projet:Biologie/Bases de données suivies). En cas de doute, le café des biologistes répondra à vos questions, surtout si vous envisager de faire des contributions en masse.

L'intérêt du Logiciel

• Lorsque l'on édite une page de biologie, on est censé fournir les références justifiant ces modifications. Si vous copiez de l'information d'un autre site web (ayant une licence compatible avec wikipédia) il est préférable de référencer ce site web dans l'article.

• Certains articles de biologie de wikipédia sont désespérément vides (à part la taxobox rapidement remplie). Dans ce cas je trouve sympathique de fournir des liens vers des pages web fournissant plus d'informations. Comme ces sites ont une licence compatible avec wikipedia, ces liens permettront aussi aux personnes voulant remplir ces articles vides de vérifier leurs dires.

• Lorsqu'il y a conflit sur la détermination de l'auteur, il est bien d'avoir plusieurs références web pour vérifier s'il y a un consensus sur l'auteur sur le web.

• Je sais que wikipedia ne doit pas devenir un outil de recherche sur internet, de promotion de petits sites comme de blogs, des sites personnels… Mais on parle ici d'une quinzaine de grands sites renommés, des références dans leur domaine.

Exemple de résultat

Si vous lancez la requète "Panthera leo", vous obtiendrez du code wikipedia qui une fois collé dans un article donnera : Exemple de résultat pour "Panthera leo"

Copies d'écran

Voici l'écran principal du logiciel :

Si vous tapez Anthericaceae<entrée>, vous obtenez :

Bien sur vous pouvez configurer les sites dont vous voulez les références:

Références traitées pour l'instant

• erick.dronnet.free.fr/belles_fleurs_de_france et perso.orange.fr/erick.dronnet

Modèle utilisé : Le code généré utilise {{Belles fleurs de France}} et {{Belles fleurs de France2}}

• The families of flowering plants (delta-intkey.com/angio)(L. Watson and M.J. Dallwitz (1992 onwards))

Modèle utilisé : Le code généré utilise {{Delta-angio}}

• www.fishbase.org

Description : La référence mondiale pour les poissons.

Modèles utilisés : Le code généré utilise {{FishBase espèce}}, {{FishBase genre}}, {{FishBase famille}} ou {{FishBase ordre}}

Avantage : L'auteur est récupéré du site (uniquement si le taxon est une espèce ou un genre) et utilisé comme paramètre de description du modèle.

• Animaldiversity de l'université du Michigan

Modèle utilisé : Le code généré utilise {{ADW}}

• CITES (sea.unep-wcmc.org)

Description : Un des grand site décrivant les menaces exercées sur une espèce

Modèles utilisés : Le code généré utilise {{CITES espèce}}, {{CITES genre}} ou {{CITES famille}}

Avantage : L'auteur est récupéré du site et utilisé comme paramètre de description du modèle.

• ITIS (www.itis.usda.gov)

Description : Un très bon site de taxonomie

Modèle utilisé : Le code généré utilise {{ITIS}}

Avantage : L'auteur est récupéré du site et utilisé comme paramètre de description du modèle.

• www.arkive.org

Description : Un site plein de photographies, extraits sonores et vidéos

Modèles utilisés : Le code généré utilise {{ARKive GES}} ou {{ARKive ARK}}

• IUCN (www.redlist.org)

Description : Un des grands sites décrivant les menaces exercées sur une espèce

Modèle utilisé : Le code généré utilisera {{IUCN}}

• La Liste d'Alan P Peterson (Zoonomen.net)

Description : La référence pour les oiseaux.

Modèle utilisé: Le code généré utilisera {{Zoonomen}}

• NCBI Taxonomy

Description : Un site très intéressant de taxonomie avec des liens vers d'autres sites

Modèles utilisés : Le code généré utilisera {{NCBI}}

• Fauna Europaea (www.faunaeur.org)

Modèle utilisé : Le code généré utilisera {{Faunaeur}}

• Tela Botanica (www.tela-botanica.org)

Modèles utilisés : Le code généré utilisera {{Tela-antilles}} {{Tela-métro}} {{Tela-réunion}}

• www.ars-grin.gov

Modèle utilisé : Le code généré utilisera {{GRIN espèce}}, {{GRIN genre}} ou {{GRIN famille}}

• Angiosperm Phylogeny Website (mobot.org)(Stevens, P.F. (2001 onwards))

Description : Un site très intéressant de taxonomie phylogénétique

Modèle utilisé : Le code généré utilisera {{APWebsite famille}} {{APWebsite ordre}} ou {{APWebsite}}

• Florabase (Australie Ouest)

Modèle utilisé : Le code généré utilisera {{Florabase}}

Références prévues pour un futur proche

Quelques sites ne fonctionnent (temporairement) plus dans WikipediaBioReferences :

• {{FishBase espèce}} répond une fois sur deux "cannot be blanck"

Quelques sites seront rajoutés dans WikipediaBioReferences :

• {{algaeBASE espèce}} est à faire
• {{EFloras}} est à faire

Détails

• Toutes les références générées utilisent des modèles de la catégorie Modèle de biologie créant un lien externe car :
  • Le modèle peut être modifié pour prendre en compte :
    • un changement d'affichage (copyright…)
    • un changement d'URL (Delta-angio a complètement changé d'URL)
  • Les modèles sont faciles à rechercher dans wikipédia :
    • pour une suppression totale…
    • pour des statistiques

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