Deltaproteobacteria

classe de bactéries

Les Deltaproteobacteria (en français les Deltaprotéobactéries) sont une classe de bactéries à Gram négatif de l'embranchement des Pseudomonadota. Son nom, formé sur les mots grecs delta (δέλτα : quatrième lettre de l'alphabet) et Proteus (Προτεύς : Protée, dieu capable de se métamorphoser) complétés du néolatin bacteria (bactérie), n'est exceptionnellement pas dérivé du nom de son ordre type Myxococcales.

Deltaproteobacteria
Description de cette image, également commentée ci-après
Desulfovibrio vulgaris (ici observée au microscope électronique) est une espèce de la classe des Deltaproteobacteria
Classification LPSN
Domaine Bacteria
Embranchement Pseudomonadota

Classe

Deltaproteobacteria
Kuever (d) et al. 2006[1]

Synonymes

  • Desulfobaccia Waite et al. 2020
  • Desulfobulbia Waite et al.. 2020
  • Desulfomonilia Waite et al. 2020
  • Syntrophia Waite et al. 2020
  • Polyangiia corrig. Waite et al. 2020
  • Syntrophorhabdia Waite et al. 2020
  • Desulfovibrionia Waite et al. 2020
  • Syntrophobacteria Waite et al. 2020
  • Desulfobacteria Waite et al. 2020
  • Myxococcia Waite et al. 2020
  • Desulfarculia Waite et al. 2020
  • Desulfuromonadia Waite et al. 2020
  • Desulfurellia Waite et al. 2020
  • Deferrisomatia Waite et al. 2020
  • Dissulfuribacteria Waite et al. 2020
  • Deltabacteria Cavalier-Smith 2002


Taxonomie

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Ce taxon est décrit en 2006 par J. Kuever et al. dans la deuxième édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology[1]. Il est validé la même année par une publication dans l'IJSEM[2].

En 2020, s'appuyant sur un séquençage des gènes de l'ARN ribosomique et de 120 gènes marqueurs non dupliqués, D.W. Waite et al. réfutent la monophylie des Deltaproteobacteria et leur inclusion dans l'embranchement des Proteobacteria (devenu Pseudomonadota)[3]. Ces auteurs proposent de réorganiser le groupe « Deltaproteobacteria-Oligoflexia-Thermodesulfurobacteria » en le subdivisant en quatre nouveaux embranchements : Bdellovibrionota, Desulfurobacterota, Myxococcota et un quatrième taxon nommé provisoirement « SAR324 ».

Liste d'ordres

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Ordres validement publiés

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Selon la LPSN (3 décembre 2022)[4] :

L'ordre des Bdellovibrionales a été reclassé dans la classe des Oligoflexia (même embranchement).

Ordres en attente de publication valide

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Selon la LPSN (3 décembre 2022)[4] les ordres suivants sont en attente de publication valide (Ca. signifie Candidatus) :

Notes et références

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  1. a et b (en) Jan Kuever, Fred A. Rainey et Friedrich W. Widdel, « Class IV. Deltaproteobacteria class nov. », dans D. J. Brenner, N. R. Krieg, J. T. Staley, G. M. Garrity, Bergey's Manual of Systematic Bacteriology : The Proteobacteria, part C (The Alpha-, Beta-, Delta-, and Epsilonproteobacteria), vol. 2, New York, Springer, , 2e éd., XXVIII-1388 p. (ISBN 978-0387-24145-6, BNF 39993051)
  2. Euzéby JP « Validation list no. 107. List of new names and new combinations previously effectively, but not validly, published » Int J Syst Evol Microbiol. 2006;56(1):1-6. Accès libre.
  3. Waite DW et al. « Proposal to reclassify the proteobacterial classes Deltaproteobacteria and Oligoflexia, and the phylum Thermodesulfobacteria into four phyla reflecting major functional capabilities » Int J Syst Evol Microbiol. 2020;70(11):5972–6016. Accès libre.
  4. a et b List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 3 décembre 2022