Erwinia

Classification LPSN
Domaine	Bacteria
Embranchement	Pseudomonadota
Classe	Gammaproteobacteria
Ordre	Enterobacterales
Famille	Erwiniaceae

Erwinia est un genre de bacilles Gram négatifs de la famille des Erwiniaceae dont il est le genre type. Son nom fait référence au biologiste Erwin F. Smith en hommage à sa carrière consacrée à la phytopathologie^[1]^,^[2].

Les Erwinia sont des bactéries mobiles grâce à des flagelles péritriches. Ces bactéries sont associées aux végétaux en tant que saprophytes ou pathogènes. Elles peuvent entraîner des dégradations de la structure des végétaux, des flétrissements, des dépérissements, des jaunissements ou des pourritures.

Parmi les espèces les plus connues figurent :

Erwinia amylovora, agent du feu bactérien des Rosaceae, notamment le poirier et le pommier,
Erwinia tracheiphila, agent du flétrissement bactérien des Cucurbitaceae.

dont des espèces reclassées :

Erwinia herbicola (désormais reclassée sous le nom de Pantoea agglomerans), bactérie associée aux végétaux, normalement non pathogène ou pathogène opportuniste en cas de faiblesse de la plante, peut aussi être pathogène pour l'homme et les animaux^[3].
Erwinia chrysanthemi (désormais reclassée sous le nom de Dickeya dadantii), entérobactérie phytopathogène (c.-à-d. qui attaque les plantes). Elle a une large gamme d'hôtes que ce soit des plantes ornementales ou d'intérêt agricole. C'est l'une des bactéries responsable de la maladie de la pourriture molle bactérienne.

Taxonomie

Jusqu'en 2016 ce genre était compté parmi les Enterobacteriaceae auquel il était rattaché sur la base de critères phénotypiques. Depuis la refonte de l'ordre des Enterobacterales en 2016 par Adeolu et al. à l'aide des techniques de phylogénétique moléculaire, il a été déplacé vers la famille des Erwiniaceae nouvellement créée^[4].

Liste d'espèces

Selon la LPSN (25 octobre 2022)^[5] :

Erwinia amylovora (Burrill 1882) Winslow et al. 1920 – espèce type
Erwinia aphidicola Harada et al. 1998
Erwinia billingiae Mergaert et al. 1999
Erwinia endophytica Ramírez-Bahena et al. 2016
Erwinia gerundensis Rezzonico et al. 2016
Erwinia iniecta Campillo et al. 2015
Erwinia mallotivora Goto 1976
Erwinia oleae Moretti et al. 2011
Erwinia papayae Gardan et al. 2004
Erwinia persicina corrig. Hao et al. 1990
Erwinia phyllosphaerae Pan et al. 2022
Erwiniria piriflorinigrans López et al. 2011
Erwinia psidii Rodrigues Neto et al. 1988
Erwinia pyrifoliae Kim et al. 1999
Erwinia rhapontici (Millard 1924) Burkholder 1948
Erwinia tasmaniensis Geider et al. 2006
Erwinia teleogrylli Liu et al. 2016
Erwinia toletana Rojas et al. 2004
Erwinia tracheiphila (Smith 1895) Bergey et al. 1923
Erwinia typographi Skrodenytė-Arbačiauskienė et al. 2012
Erwinia uzenensis Matsuura et al. 2012

Plusieurs espèces anciennement comptées parmi les Erwinia ont été reclassées dans d'autres genres :

Brenneria alni (Surico et al. 1996) Hauben et al. 1999 : reclassement de E. alni
Brenneria nigrifluens (Wilson et al. 1957) Hauben et al. 1999 : reclassement de E. nigrifluens
Brenneria rubrifaciens (Wilson et al. 1967) Hauben et al. 1999 : reclassement de E. rubrifaciens
Brenneria salicis (Day 1924) Hauben et al. 1999 : reclassement de E. salicis
Dickeya chrysanthemi (Burkholder et al. 1953) Samson et al. 2005 : reclassement de E. chrysanthemi
Enterobacter cancerogenus (Urosevic 1966) Dickey & Zumoff 1988 : reclassement de E. cancerogena
Enterobacter cloacae subsp. dissolvens (Rosen 1922) Hoffmann et al. 2005 : reclassement de E. dissolvens
Lelliottia nimipressuralis (Carter 1945) Brady et al. 2013 : reclassement de E. nimipressuralis
Lonsdalea quercina (Hildebrand & Schroth 1967) Brady et al. 2012 : reclassement de E. quercina
Musicola paradisiaca (Fernandez-Borrero & Lopez-Duque 1970) Hugouvieux-Cotte-Pattat et al. 2021 : reclassement de E. paradisiaca
Pantoea agglomerans (Beijerinck 1888) Gavini et al. 1989 : reclassement de E. herbicola et E. milletiae
Pantoea ananatis corrig. (Serrano 1928) Mergaert et al. 1993 : reclassement de E. ananatis et E. uredovora
Pantoea cypripedii (Hori 1911) Brady et al. 2010 : reclassement de E. cypripedii
Pantoea stewartii (Smith 1898) Mergaert et al. 1993 : reclassement de E. stewartii
Pectobacterium cacticida corrig. (Alcorn et al. 1991) Hauben et al. 1999 : reclassement de E. cacticida
Pectobacterium carnegieanum corrig. (Standring 1942) Brenner et al. 1973 : reclassement de E. carnegieana
Pectobacterium carotovorum (Jones 1901) Waldee 1945 : reclassement de E. carotovora

Notes et références

↑ Winslow CE et al. « The families and genera of the bacteria : final report of the Committee of the Society of American Bacteriologists on characterization and classification of bacterial types » J Bacteriol. 1920;5(3):191-229. Accès libre.
↑ (en) Samuel S. Gnanamanickam, Plant-Associated Bacteria, Springer Science & Business Media, 2007, 712 p. (ISBN 978-1-4020-4537-0, lire en ligne), p. 423.
↑ (en) Andrea T. Cruz, Andreea C. Cazacu et Coburn H. Allen, « Pantoea agglomerans, a Plant Pathogen Causing Human Disease », J Clin Microbiol., vol. 45, n^o 6,‎ juin 2007, p. 1989–1992 (PMCID PMC1933083, DOI 10.1128/JCM.00632-07, lire en ligne).
↑ Adeolu M et al. « Genome-based phylogeny and taxonomy of the ‘Enterobacteriales’: proposal for Enterobacterales ord. nov. divided into the families Enterobacteriaceae, Erwiniaceae fam. nov., Pectobacteriaceae fam. nov., Yersiniaceae fam. nov., Hafniaceae fam. nov., Morganellaceae fam. nov., and Budviciaceae fam. nov. » Int J Syst Evol Microbiol. 2016;66(12):5575-5599. Accès libre.
↑ List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 25 octobre 2022

Liens externes

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Erwinia, sur Wikispecies

(en) Référence Catalogue of Life : Erwinia Winslow et al., 1920 emend. Hauben et al., 1998 (consulté le 7 avril 2023)
(en) Référence LPSN : Erwinia (consulté le 25 octobre 2022)
(en) Référence NCBI : Erwinia Winslow et al. 1920 (Approved Lists 1980) (taxons inclus) (consulté le 14 juin 2014)
(en) Référence WoRMS : Erwinia (+ liste espèces) (consulté le 14 juin 2014)

[1] Winslow CE et al. « The families and genera of the bacteria : final report of the Committee of the Society of American Bacteriologists on characterization and classification of bacterial types » J Bacteriol. 1920;5(3):191-229. Accès libre.

[2] (en) Samuel S. Gnanamanickam, Plant-Associated Bacteria, Springer Science & Business Media, 2007, 712 p. (ISBN 978-1-4020-4537-0, lire en ligne), p. 423.

[3] (en) Andrea T. Cruz, Andreea C. Cazacu et Coburn H. Allen, « Pantoea agglomerans, a Plant Pathogen Causing Human Disease », J Clin Microbiol., vol. 45, n^o 6,‎ juin 2007, p. 1989–1992 (PMCID PMC1933083, DOI 10.1128/JCM.00632-07, lire en ligne).

[4] Adeolu M et al. « Genome-based phylogeny and taxonomy of the ‘Enterobacteriales’: proposal for Enterobacterales ord. nov. divided into the families Enterobacteriaceae, Erwiniaceae fam. nov., Pectobacteriaceae fam. nov., Yersiniaceae fam. nov., Hafniaceae fam. nov., Morganellaceae fam. nov., and Budviciaceae fam. nov. » Int J Syst Evol Microbiol. 2016;66(12):5575-5599. Accès libre.

[LPSN25_octobre_2022-5] List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 25 octobre 2022

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