Deinococcota

Deinococci

Deinococcota

Deinococcus radiodurans

Classification

Domaine	Bacteria

Embranchement

Deinococcota
Weisburg et al. 2021

Classe

Deinococci
Garrity & Holt, 2001

Taxons de rang inférieur

• ordre Deinococcales
• ordre Thermales

Classification phylogénétique

Position :

• Eubactéries
  • Protéobactéries
  • groupe :
    • Firmicutes
      • groupe Bacillus / Clostridium
      • Actinobactéries
    • groupe :
      • Cyanobactéries
      • groupe Thermus / Deinococcus
  • groupe :
    • Bactéries vertes sulfureuses
    • groupe :
      • Flavobactéries
      • Bactéroïdes
  • groupe :
    • Spirochètes
    • Chlamydiales
  • Planctomycétales
  • Bactéries vertes non sulfureuses
  • Aquificales
  • Thermotogales

Les Deinococcota (Deinococcobactéries ou anciennement Deinococcobacteria ou groupe Deinococcus-Thermus) sont un petit phylum de bactéries composée de coques très résistantes aux risques environnementaux. Elle comprend la classe des Deinococci, elle-même divisée en deux ordres.

Historique

Décrit en 1989 sous le nom de groupe Deinococcus-Thermus par Weisburg et al. mais publié de manière non valide, ce taxon a été republié en 2021 pour se conformer aux règles de nomenclature de l'ICSP et rebaptisé Deinococcota en maintenant l'autorité d'invention à Weisburg mais avec la date de validation de 2021.

Taxonomie

Étymologie

L'étymologie de Deinococcota est la suivante : Dei.no.coc.co’ta N.L. masc. n. Deinococcus, genre type du phylum; N.L. neut. pl. n. suff. -ota, suffixe pour définir un phylum; N.L. neut. pl. n. Deinococcota, le phylum des Deinococcus.

Liste des classes

Selon NCBI (12 novembre 2022), le phylum Deinococcota ne compte qu'une seule classe :

• Deinococci Garrity et Holt 2002

Les Deinococcales

• famille Deinococcaceae
  • Deinobacter
  • Deinococcus
• famille Trueperaceae
  • Truepera

Deinococcus est composé de plusieurs espèces résistantes aux radiations. Ils sont devenus célèbres pour leur capacité à ingérer des déchets nucléaires et autres matières toxiques, de survivre dans le vide de l'espace et à des températures extrêmes.

Les Thermales

• famille Thermaceae
  • Marinithermus
  • Meiothermus
  • Oceanithermus
  • Thermus
  • Vulcanithermus

Les Thermales comprennent plusieurs genres résistant à la chaleur. Thermus aquaticus est important dans le développement de la réaction en chaîne par polymérase où les cycles répétés de chauffage près de l'ADN font bouillir celui-ci qui utilise une enzyme thermo-stable vis-à-vis de l'ADN polymérase. Ces bactéries ont une épaisseur de parois cellulaires qui donnent des taches gram-positives, mais elles comprennent une deuxième membrane et sont donc plus proches de la structure Gram-negative. Cavalier-Smith appelle ce clade Hadobacteria (de Hadès, le souterrain).

Bibliographie

• (en) A Oren et GM Garrity, « Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 71, n^o 10,‎ 2021, p. 005056 (DOI 10.1099/ijsem.0.005056)
• (en) WG Weisburg, SJ Giovannoni et CR Woese, « The Deinococcus-Thermus phylum and the effect of rRNA composition on phylogenetic tree construction », Syst Appl Microbiol, vol. 11,‎ 1989, p. 128-134 (DOI 10.1016/S0723-2020(89)80051-7)

Liens externes

• Ressources relatives au vivant :
  • Global Biodiversity Information Facility
  • List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
• (en) Référence NCBI : Deinococcus-Thermus (taxons inclus)
• (fr + en) Référence ITIS : Deinococcus-Thermus
• Classe des Deinococci Garrity & Holt, 2001 sur Taxonomicon (en)
• Phylum des Deinococcobacteria (en)