Jérôme Depaquit
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Jérôme Depaquit est un parasitologue et entomologiste médical français, professeur à l'Université de Reims-Champagne-Ardenne. Ses travaux portent principalement sur les phlébotomes, leur taxonomie, leur systématique moléculaire et leur rôle dans la transmission des leishmanioses et de certaines arboviroses.
| Naissance | |
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| Nationalité | |
| Activité |
| Directrice de thèse |
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Le Centre national de référence des leishmanioses présente le laboratoire de parasitologie de la faculté de pharmacie de Reims, associé à Jérôme Depaquit et à l'USC ANSES VECPAR, comme l'un des spécialistes européens de la taxonomie des phlébotomes vecteurs[1].
Formation et carrière
modifierEn 1997, il soutient à l'Université de Reims-Champagne-Ardenne une thèse de doctorat intitulée Révision du sous-genre Paraphlebotomus (Phlebotomus, Phlebotominae, Psychodidae, Diptera) : approches morphologique et moléculaire, sous la direction de Nicole Léger[2],[3].
Jérôme Depaquit exerce à l'Université de Reims-Champagne-Ardenne, au sein de l'unité de recherche ESCAPE, consacrée à l'épidémiosurveillance et à la circulation des parasites dans les environnements. Le Répertoire national des structures de recherche indique qu'il dirige cette unité à partir du 15 octobre 2024, après en avoir été directeur adjoint de 2018 à 2024[4]. Il exerce également une activité de praticien attaché au sein du service Bactériologie Virologie Hygiène Parasitologie Mycologie du CHU de Reims[5].
Il enseigne l'entomologie médicale dans plusieurs formations spécialisées, notamment à l'Institut Pasteur, dans le Master Internacional en Enfermedades Parasitarias Tropicales de Valence et à la summer school d'entomologie médicale de l'école vétérinaire de Toulouse[6].
Travaux scientifiques
modifierPhlébotomes et maladies vectorielles
modifierLes travaux de Jérôme Depaquit portent principalement sur les phlébotomes, insectes d'intérêt médical impliqués dans la transmission de plusieurs agents pathogènes, notamment ceux des leishmanioses. Le Centre national de référence des leishmanioses souligne que l'équipe de Reims associée à Jérôme Depaquit a mené des études de terrain dans de nombreux pays et possède une expertise particulière sur les phlébotomes vecteurs[1].
En 2016, il intervient devant l'Office parlementaire d'évaluation des choix scientifiques et technologiques lors d'une audition publique consacrée aux maladies à transmission vectorielle, sur le thème des maladies transmises par les phlébotomes[7].
Systématique, phylogénie et biogéographie
modifierUne partie de ses recherches concerne l'application des méthodes moléculaires à la systématique des phlébotomes. En 1998, il publie avec Sylvie Perrotey, Guillaume Lecointre, Annie Tillier, Simon Tillier, Hubert Ferté, Matthieu Kaltenbach et Nicole Léger une étude pilote de systématique moléculaire des Phlebotominae, consacrée notamment à la paraphylie du genre Phlebotomus[8]. Un hommage à Nicole Léger présente ce travail, mené sous son encadrement avec Guillaume Lecointre, comme le premier travail de systématique moléculaire des phlébotomes[9]. En 2014, il publie une revue consacrée à la systématique moléculaire des Phlebotominae et à ses perspectives pour l'étude évolutive du groupe[10].
Il participe également à des travaux de phylogénie et de biogéographie historique des phlébotomes. En 2021, il est coauteur d'une étude consacrée à l'évolution, à la systématique et à la biogéographie historique des phlébotomes du sous-genre Paraphlebotomus, fondée sur des marqueurs génomiques de type RADseq[11].
Guides, synthèses et outils d'identification
modifierJérôme Depaquit est coauteur de plusieurs publications de synthèse ou de standardisation consacrées à l'étude des Phlebotominae.
En 2017, il participe avec Eunice A. B. Galati, Fredy Galvis-Ovallos, Phillip Lawyer et Nicole Léger à un guide illustré consacré aux caractères et à la terminologie utilisés dans les descriptions taxonomiques des Phlebotominae[12].
En 2025, il est coauteur d'une checklist mondiale des phlébotomes, présentée par ses auteurs comme la première liste détaillée des noms valides de Phlebotominae à l'échelle mondiale, avec les pays où ils sont documentés[13].
En 2025, il participe également à la publication d'une clé picturale d'identification des espèces de Phlebotomus du bassin méditerranéen et du Moyen-Orient, comprenant des photographies et illustrations de caractères morphologiques discriminants[14].
En 2026, il participe à la publication d'un guide consensuel sur le traitement et le montage des phlébotomes, publié dans la revue Parasite[15]. La revue met également à disposition des matériels supplémentaires correspondant à la version originale anglaise et à trente-quatre traductions de ce guide[16].
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Contributions taxonomiques
modifierSes travaux taxonomiques comprennent la description ou la révision de plusieurs taxons de Phlebotominae.
Ils concernent notamment le genre asiatique Chinius. La checklist mondiale des Phlebotominae publiée en 2025 reconnaît quatre espèces valides dans ce genre, dont trois associent Jérôme Depaquit comme auteur taxonomique : Chinius barbazani Depaquit, Léger & Beales, 2006 ; Chinius eunicegalatiae Depaquit, Léger & Beales, 2006 ; et Chinius samarensis Léger, Depaquit & Gay, 2012[13].
Une partie de ses travaux porte également sur les phlébotomes de Madagascar et des îles voisines. Plusieurs taxons malgaches ou associés à cette région ont été décrits avec sa participation, notamment les sous-genres Vattieromyia Depaquit, Léger & Robert, 2008, Trouilletomyia Depaquit & Léger, 2014, et Madaphlebotomus Depaquit, Léger & Randrianambinintsoa, 2015[9].
Ses travaux taxonomiques incluent également la production de dessins et de planches morphologiques utilisés pour la description de nouveaux taxons. C'est le cas notamment dans une étude récente consacrée aux phlébotomes cavernicoles du Laos, où il réalise les dessins et participe à la description des nouvelles espèces[17].
Contributions à des ouvrages
modifierJérôme Depaquit est coauteur, avec Nicole Léger, du chapitre consacré aux phlébotomes dans l'ouvrage collectif Entomologie médicale et vétérinaire, publié par IRD Éditions et Éditions Quæ en 2017[18].
Il fait également partie des auteurs de Les phlébotomes de la région afro-tropicale / Sand flies of the Afrotropical region, un logiciel d'identification et d'enseignement publié en 2004 par l'IRD et l'IFAN[19].
Projets de recherche
modifierJérôme Depaquit participe au projet européen CLIMOS, consacré aux maladies transmises par les phlébotomes dans le contexte des changements climatiques et environnementaux. Ce projet Horizon Europe, dont l'identifiant de convention est 101057690, est financé dans le domaine de la santé pour la période 2022-2026[20],[21].
En 2025, l'ANRS Maladies infectieuses émergentes annonce la sélection du projet EXPECTS, codirigé par Jérôme Depaquit et Khamsing Vongphayloth de l'Institut Pasteur du Laos, dans le cadre de l'appel Emergences Low- and Middle-Income Countries 2024. Ce projet porte sur l'étude des phlébotomes comme vecteurs d'arbovirus dans des grottes d'Asie du Sud-Est [22].
Collections entomologiques
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Jérôme Depaquit est associé à la conservation à Reims de collections historiques de phlébotomes. La collection de phlébotomes de Jean-Antoine Rioux, comprenant 130 840 spécimens provenant de dix pays et regroupant 26 espèces, a été transférée dans la Plateforme des centres de ressources biologiques de Reims, où elle est entretenue et inventoriée afin d'être mise à disposition pour des usages scientifiques[23].
Les collections de phlébotomes d'Émile Abonnenc et de Nicole Léger sont également conservées à la faculté de pharmacie de Reims, où elles peuvent être examinées ou prêtées à la communauté des chercheurs[9].
Participation aux réseaux scientifiques
modifierJérôme Depaquit participe à l'International Symposium on Phlebotomine Sandflies (ISOPS), congrès international spécialisé consacré aux phlébotomes. L'édition ISOPS IX se tient à Reims en 2016 ; les actes du symposium sont publiés dans la revue Parasite[24]. Il figure ensuite dans le comité d'honneur d'ISOPS X (Galápagos, 2019)[25], puis dans celui d'ISOPS XI (Portorož, 2024)[26].
Éponymie taxonomique
modifierL'espèce néotropicale Trichopygomyia depaquiti (Gantier, Gaborit & Rabarison, 2006), initialement décrite sous le nom Lutzomyia (Trichopygomyia) depaquiti, est dédiée à Jérôme Depaquit[27]. La checklist mondiale des Phlebotominae publiée en 2025 la reconnaît dans le genre Trichopygomyia, avec une distribution au Brésil et en Guyane française[13].
Responsabilités éditoriales
modifierJérôme Depaquit est éditeur associé de la revue Parasite[28].
Publications
modifier- Jérôme Depaquit, Nicole Léger et Robert Killick-Kendrick, « Description de Phlebotomus (Paraphlebotomus) riouxi n. sp. (Diptera-Psychodidae) d'Afrique du Nord », Parasite, vol. 5, no 2, , p. 151-158 (DOI 10.1051/parasite/1998052151).
- Jérôme Depaquit, Sylvie Perrotey, Guillaume Lecointre, Annie Tillier, Simon Tillier, Hubert Ferté, Matthieu Kaltenbach et Nicole Léger, « Systématique moléculaire des Phlebotominae : étude pilote. Paraphylie du genre Phlebotomus », Comptes Rendus de l'Académie des Sciences - Series III - Sciences de la Vie, vol. 321, no 10, , p. 849-855 (DOI 10.1016/S0764-4469(99)80025-0).
- (en) Jérôme Depaquit, « Molecular systematics applied to Phlebotomine sandflies: review and perspectives », Infection, Genetics and Evolution, vol. 28, , p. 744-756 (DOI 10.1016/j.meegid.2014.10.027).
- (en) Eunice A. B. Galati, Fredy Galvis-Ovallos, Phillip Lawyer, Nicole Léger et Jérôme Depaquit, « An illustrated guide for characters and terminology used in descriptions of Phlebotominae », Parasite, vol. 24, , p. 26 (DOI 10.1051/parasite/2017027).
- Jérôme Depaquit et Nicole Léger, « Les phlébotomes (Diptera : Psychodidae : Phlebotominae) », dans Entomologie médicale et vétérinaire, Marseille, IRD Éditions, Éditions Quæ, , 295-320 p. (DOI 10.4000/books.irdeditions.22046).
- (en) Antoine Cruaud, Victor Lehrter, Gwenn Genson, Jean-Yves Rasplus et Jérôme Depaquit, « Evolution, systematics and historical biogeography of sand flies of the subgenus Paraphlebotomus (Diptera, Psychodidae, Phlebotomus) inferred using restriction-site associated DNA markers », PLOS Neglected Tropical Diseases, vol. 15, no 7, , e0009479 (DOI 10.1371/journal.pntd.0009479).
- (en) Eunice A. B. Galati, Andrey José de Andrade et al., « Phlebotomine sand flies (Diptera, Psychodidae) of the world », Parasites & Vectors, (DOI 10.1186/s13071-025-06748-5).
- (en) Mohammad Akhoundi et al., « A pictorial identification key for Mediterranean and Middle Eastern Phlebotomus sand flies », Scientific Reports, vol. 15, , p. 7725 (DOI 10.1038/s41598-024-77815-7).
- (en) Fano José Randrianambinintsoa et al., « Processing and mounting phlebotomine sand flies: a consensus guideline », Parasite, vol. 33, , p. 18 (DOI 10.1051/parasite/2026009).
Notes et références
modifier- 1 2 « Centre national de référence des leishmanioses », sur Université de Montpellier (consulté le ).
- ↑ « Jérôme DEPAQUIT », sur Université de Reims Champagne-Ardenne (consulté le ).
- ↑ « Révision du sous genre paraphlebotomus (phlebotomus, phlebotominae, psychodidae, diptera) ; approches morphologique et moléculaire », sur theses.fr (consulté le ).
- ↑ « 200414212K : ESCAPE Epidémiosurveillance et circulation des parasites dans les environnements », sur Répertoire national des structures de recherche (consulté le ).
- ↑ « Annuaire praticiens CHU Reims » (consulté le )
- ↑ « DEPAQUIT Jérôme », sur DU Pathologies tropicales essentielles (consulté le ).
- ↑ « Maladies à transmission vectorielle », sur Sénat, (consulté le ).
- ↑ Jérôme Depaquit, Sylvie Perrotey, Guillaume Lecointre, Annie Tillier, Simon Tillier, Hubert Ferté, Matthieu Kaltenbach et Nicole Léger, « Systématique moléculaire des Phlebotominae : étude pilote. Paraphylie du genre Phlebotomus », Comptes Rendus de l'Académie des Sciences - Series III - Sciences de la Vie, vol. 321, no 10, , p. 849-855 (DOI 10.1016/S0764-4469(99)80025-0).
- 1 2 3 Jérôme Depaquit, Marie-Claude Durette-Desset, Jean-Charles Gantier et al., « Hommage à Nicole Léger (1933-2024) », Médecine tropicale et santé internationale, (DOI 10.48327/mtsi.v5i4.2025.728).
- ↑ (en) Jérôme Depaquit, « Molecular systematics applied to Phlebotomine sandflies: review and perspectives », Infection, Genetics and Evolution, vol. 28, , p. 744-756 (DOI 10.1016/j.meegid.2014.10.027).
- ↑ (en) Antoine Cruaud, Victor Lehrter, Gwenn Genson, Jean-Yves Rasplus et Jérôme Depaquit, « Evolution, systematics and historical biogeography of sand flies of the subgenus Paraphlebotomus (Diptera, Psychodidae, Phlebotomus) inferred using restriction-site associated DNA markers », PLOS Neglected Tropical Diseases, vol. 15, no 7, , e0009479 (DOI 10.1371/journal.pntd.0009479).
- ↑ (en) Eunice A. B. Galati, Fredy Galvis-Ovallos, Phillip Lawyer, Nicole Léger et Jérôme Depaquit, « An illustrated guide for characters and terminology used in descriptions of Phlebotominae », Parasite, vol. 24, , p. 26 (DOI 10.1051/parasite/2017027).
- 1 2 3 (en) Eunice A. B. Galati, Andrade et Jérôme Depaquit, « Phlebotomine sand flies (Diptera, Psychodidae) of the world », Parasites & Vectors, (DOI 10.1186/s13071-025-06748-5).
- ↑ (en) Mohammad Akhoundi et al., « A pictorial identification key for Mediterranean and Middle Eastern Phlebotomus sand flies », Scientific Reports, vol. 15, , p. 7725 (DOI 10.1038/s41598-024-77815-7).
- ↑ (en) « Processing and mounting phlebotomine sand flies: a consensus guideline », Parasite, vol. 33, , p. 18 (DOI 10.1051/parasite/2026009).
- ↑ (en) « Supplementary material. Processing and mounting phlebotomine sand flies: a consensus guideline », sur Parasite (consulté le ).
- ↑ (en) Khamsing Vongphayloth, Fano José Randrianambinintsoa, Khaithong Lakeomany et al., « A study on the diversity of phlebotomine sand flies (Diptera, Psychodidae) in karstic limestone areas in Vientiane Province, Laos, with a description of two new species of Sergentomyia França and Parrot », Parasites & Vectors, vol. 17, , p. 385 (DOI 10.1186/s13071-024-06444-w).
- ↑ Jérôme Depaquit et Nicole Léger, « Les phlébotomes (Diptera : Psychodidae : Phlebotominae) », dans Entomologie médicale et vétérinaire, Marseille, IRD Éditions, Éditions Quæ, , 295-320 p. (DOI 10.4000/books.irdeditions.22046).
- ↑ (fr + en) A. A. Niang, Jean-Paul Hervy, Jérôme Depaquit, Philippe Boussès, I. Davidson, Bernard Geoffroy, Nicole Léger, J. Trouillet, R. Killick-Kendrick, M. Killick-Kendrick, Jean-Antoine Rioux et Jacques Brunhes, Les phlébotomes de la région afro-tropicale / Sand flies of the Afrotropical region : logiciel d'identification et d'enseignement / an identification and training programme, Paris ; Dakar, IRD ; IFAN, (ISBN 2-7099-1499-9).
- ↑ (en) « Climate Monitoring and Decision Support Framework for Sand Fly-borne Diseases Detection and Mitigation with COst-benefit and Climate-policy MeasureS », sur CORDIS (consulté le ).
- ↑ (en) « Trapping site 3: France », sur CLIMOS (consulté le ).
- ↑ (en) « Laureates of the Emergence Low- and Middle-Income Countries (LMICs) 2024 call for projects », sur ANRS Maladies infectieuses émergentes, (consulté le ).
- ↑ Jérôme Depaquit, « Sur la collection de phlébotomes (Diptera: Psychodidae) du Professeur Jean-Antoine Rioux », Médecine tropicale et santé internationale, vol. 1, no 3, (DOI 10.48327/mtsi.v1i3.2021.127).
- ↑ (en) Jérôme Depaquit, Bernard Pesson, Denis Augot, James Gordon Campbell Hamilton, Phillip Lawyer et Nicole Léger, « Proceedings of the IX International Symposium on Phlebotomine Sandflies, Reims, France, 28 June – 1 July 2016 », Parasite, vol. 23, , p. 61 (DOI 10.1051/parasite/2016061).
- ↑ (en) « 10th International Symposium On Phlebotomine Sandflies », sur Universidad San Francisco de Quito (consulté le ).
- ↑ (en) « Committees – ISOPS XI », sur ISOPS XI (consulté le ).
- ↑ Jean-Charles Gantier, Pascal Gaborit et P. Rabarison, « Les phlébotomes (Diptera : Psychodidae) de la Guyane Française. I - Description du mâle de Lutzomyia (Trichopygomyia) depaquiti n. sp. », Parasite, vol. 13, no 1, , p. 11-15 (DOI 10.1051/parasite/2006131011).
- ↑ (en) « Editorial board », sur Parasite (consulté le ).
