Bogota découle du nom Bacatá donné par les indigènes Chibcha. Au centre de leur civilisation avant la conquête espagnole, elle abritait une importante population. Le chroniqueur Juan de Castellanos affirma que le sens originel de Bacatá en langue indigène était «la fin des champs. Le lieu où se situe actuellement la ville avait reçu de nom de Muequetá ("champ ou savane des cultures") et le district du Zipa (le prince Chibcha le plus important) avait reçu celui de Funza ("homme puissant"). C’est précisément dans le territoire de l’actuelle municipalité de Funza, une banlieue de Bogota, et probablement un peu aux alentours, que l’on peut rencontrer la source de la population de Bacatá, la ville la plus importante du peuple chibcha, un des groupes indiens les plus avancés qui rencontrèrent les espagnols à leur arrivée aux Indes occidentales ; mais le Prince Chibcha était éduqué dans l’actuelle municipalité de Chía. Bogota se situe au centre de la Colombie, dans une zone naturelle dénommée Savane de Bogota (Sabana de Bogotá), qui, à son tour fait partie de l’Altiplano Cundiboyacense, plateau situé dans la cordillère Orientale, une ramification de la cordillère des Andes. En termes de superficie, Bogota est la plus grande ville en Colombie et son altitude, 2 640 mètres, fait d'elle la troisième plus haute capitale dans le monde, après La Paz et Quito.
