Projet:Microbiologie/Orientation bibliographique en microbiologie

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Sommaire taxonomique par ordre alphabétique : Eubacteria - Archaea - Eukaryotes unicellulaires - Virus, et Voir aussi

Actinopoda Acantharea - Actinopoda Heliozoa - Actinopoda Radiolaria - Alveolata - Amoebozoa - Apicomplexa - Bacillariophyta - Chlorarachniophyta - Choanoflagellata - Chromista - Ciliata - Cryptophyta - Dinoflagellata - Écologie microbienne - Euglenozoa - Excavata - Foraminifera - Glaucophyta - Haptophyta - Metamonada - Microsporidia - Mycetozoa - Mycota - Oomycota - Parabasalia - Percolozoa - Rhizaria - Rhizopoda -

Sommaire géographique et écologique

Europe - Moyen-Orient - Asie - Afrique - Amérique du Nord - Amérique centrale - Amérique du Sud - Régions polaires -
Eaux douces - Milieu océanique - Plancton - Extrêmophiles

Introduction modifier

Cette page n'a ni la prétention ni pour objet de proposer une liste exhaustive des références relatives à la microbiologie, une telle entreprise serait, bien entendu, sans fin... Son ambition est de présenter une liste d'ouvrages, de publications ou de sites internet reconnus par la communauté scientifique comme incontournables ou majeurs, qu'ils soient généraux ou plus ciblés. Pour les sujets comportant une liste de références trop importante, se reporter aux éventuelles sous-pages plus spécialisées via les liens proposés. Le second objectif de cette page est, pour chaque groupe, d'en présenter les grandes lignes historiques de la littérature ainsi que d'en citer les auteurs ayant le plus de notoriété. Pour des références se rapportant plus spécifiquement à l'évolution, consulter la page Orientation bibliographique sur l'origine et l'évolution du vivant.

REFERENCE :

Référence scientifique majeure -

Vulgarisation particulièrement excellente

*Plasmodium sp.* (Plasmodiidae), agent du paludisme

Microbiologie générale modifier

Bibliographie modifier

John P.Harley, Donald A. Klein, Lansing M. Prescott, Linda M. Sherwood, Joanne M. Willey, Christopher J. Woolverton 2003. Microbiologie. De Boeck (ed).
Madigan M.T. and Martinko J.M., 2001. Brock Biology of Microorganisms. Prentice Hall (ed).
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Sites internet modifier

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Microbiologie médicale modifier

Bibliographie modifier

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Dictionnaire de Bactériologie Vétérinaire
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Biologie et biochimie microbienne modifier

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Références par groupes modifier

Articles détaillés : Eubacteria (classification phylogénétique), Eukaryota (classification phylogénétique) et Archaea (classification phylogénétique).

Eubacteria modifier

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Archaea modifier

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Eukaryotes unicellulaires (en général) modifier

Bibliographie modifier

Patterson, D., 1996. Free-Living Freshwater Protozoa : A Colour Guide. ASM Press (ed.).
Puytorac (de), P., Grain, J., Mignot, J.P., 2006. Précis de protistologie. Lubrecht & Cramer Ltd (éd.). 581 p. (ISBN 2850040495 et 978-2850040498).
Minchin, E.A., 1912. An introduction to the study of the Protozoa. London, E. Arnold (ed.).
Kudo, R.R., 1954. Protozoology. Springfield, Illinois, C. C. Thomas (publisher).
Treatise on Invertebrate Paleontology. The Geological Society of America & The University of Kansas. Boulder, Colorado & Lawrence, Kansas.
- Kaesler, R. L., ed. Part B, Protista 1, vol. 1: Charophyta. 2005.
- Selden, P.A., ed. Part B, Protista 1, vol. 2: Chrysomonadida, Coccolithophorida, Charophyta, Diatomacea & Pyrrhophyta. In preparation.
- Moore, R.C., ed. Part C, Protista 2, vol. 1 & 2: Sarcodina, Chiefly “Thecamoebians” and Foraminiferida. 1964.
- Moore, R.C., ed. Part D, Protista 3: Protozoa (Chiefly Radiolaria and Tintinnina). 1954.
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Sites internet modifier

Micro*Scope est la source d'images de protistes la plus riche à l'heure actuelle.

Algues unicellulaires modifier

Algaebase représente aujourd'hui LA référence en matière de taxonomie des microalgues.

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Alveolata modifier

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Ciliata modifier

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Dinoflagellata modifier

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Chromista modifier

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Oomycota modifier

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Bacillariophyta modifier

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Loir, M., 2004. Guide des diatomées. Delachaux et Niestlé (éd.).
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Cryptophyta modifier

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Haptophyta modifier

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Rhizaria modifier

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Actinopoda - Acantharea modifier

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Actinopoda - Heliozoa modifier

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Actinopoda - Radiolaria modifier

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Bykhovsky, B.E., 1971. Radiolaria of the World Ocean. Pensoft (ed.), 420 pp. (en russe)
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Foraminifera modifier

Bibliographie modifier

Sen Gupta, B.K., 1999, 2002. Modern Foraminifera. Kluwer Academic Publishers (ed.), 371 pp. (ISBN 0412824302) (1999); (ISBN 1402005989) (2002).
Murray, J., 2006. Ecology and Applications of Benthic Foraminifera. Cambridge University Press (ed.), 426 pp. (ISBN 0521828392).

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Chlorarachniophyta modifier

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Excavata modifier

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Euglenozoa modifier

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Parabasalia modifier

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Metamonada modifier

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Percolozoa modifier

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Glaucophyta modifier

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Amoebozoa modifier

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Molecular phylogeny of amoeboid protists (Université de Genève)
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Rhizopoda modifier

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Mycetozoa modifier

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Mycota modifier

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Microsporidia modifier

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Choanoflagellata modifier

Bibliographie modifier

Leadbeater, B., Thomsen, H., 2000. Order choanoflagellida. In « An Illustrated Guide to the Protozoa », by Leadbeater, B. and Thomsen, H. Society of Protozoologists, Lawrence (ed.), 14-38.
Leadbeater, B., Kelly, M., 2001. Evolution of animals choanoflagellates and sponges. Water and Atmosphere Online, 9 (2) : 9-11.
Nerad, A., Daggett, P., 1992. Cultivation of Choanoflagellates. In « Protocols In Protozoology », by Nerad, A. and Daggett, P. Society of Protozoologists, Lawrence (ed.), A-20.1-A-20.4.

Sites internet modifier

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Virus modifier

Bibliographie modifier

Boyer, M., Yutin, N., Pagnier, I., Barrassi, L., Fournous, G., Espinosa, L., Robert, C., Azza, S., Sun, S., Rossmann, M.G., Suzan-Monti, M., La Scola, B., Koonin, E.V., Raoult, D. : Giant Marseillevirus highlights the role of amoebae as a melting pot in emergence of chimeric microorganisms. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2009 (pdf)
Raoult, D., 2006. Mimivirus : le plus gros des virus. Pour la Science, janvier 2006, p54-59.
Pierre Ardoin : Virus et diagnostic virologique. Paris, Maloine Éditeur, 1983, 997p.
Thierry Borrel : Les Virus. Diversité et organisation du monde viral. Interactions avec le vivant. Nathan Université, Paris, 1996.
Gessain A., Manuguerra J.C. : Les virus émergents. Collection « Que sais-je ? », Presses Universitaires de France, 2006.

Sites internet modifier

All the Virology on the www
International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV)
- Index officiel des virus, d'après l'ICTV
Généralités en virologie : notes de cours proposées par deux étudiants de la faculté de La Rochelle (France). Version du 12/03/2003.
Principes actuels de classification des virus : extraits de cours de microbiologie, par Anne Decoster et al., de la faculté libre de médecine de Lille (France). Version du 22/05/2002.

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Références par zone géographiques modifier

Europe modifier

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Moyen-Orient - Asie modifier

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Afrique modifier

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Amérique du Nord modifier

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Amérique centrale et du Sud modifier

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Régions polaires modifier

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Écologie microbienne générale modifier

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Eaux douces modifier

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Milieu océanique modifier

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Plancton modifier

Bibliographie modifier

C. S. Reynolds, 2006. The Ecology of Phytoplankton (Ecology, Biodiversity and Conservation). Cambridge University Press (May 29, 2006), 550 pp. (ISBN 0521605199 et 978-0521605199).
Tomas, C. (ed.), 1997, Identifying Marine Phytoplankton, Academic Press, San Diego
Horner, R.A., 2002, A taxonomic guide to some common marine phytoplankton, Biopress limited

Sites internet modifier

PlanktonNet (Images de nombreuses espèces de plancton)
Plankton Web
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Extrêmophiles modifier

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Voir aussi modifier

Liens internes modifier

Liens externes modifier

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