« Domaine (biologie) » : différence entre les versions

Le terme '''domaine''' a été introduit pour discuter de la classification du [[monde vivant]] selon un modèle divisant celui-ci en trois grands groupes supposés [[holophylétique|monophylétique]]s<ref>{{Article|langue=en|prénom1=Carl R.|nom1=Woese|prénom2=George E.|nom2=Fox|titre=Phylogenetic structure of the prokaryotic domain: The primary kingdoms|périodique=Proceedings of the National Academy of Sciences|volume=74|numéro=11|date=1977-11-01|issn=0027-8424|issn2=1091-6490|pmid=270744|doi=10.1073/pnas.74.11.5088|lire en ligne=http://www.pnas.org/content/74/11/5088|consulté le=2018-05-14|pages=5088–5090}}</ref>. Bien qu'étant de fait synonymes, l'emploi des termes ''domaine'' ou ''empire'' n'est pas tout à fait neutre. Le mot domaine est généralement rejeté par les taxonomistes qui contestent le modèle à trois domaines de Woese puisqu'au moins l'un d'entre eux n'est pas monophylétiqueholophylétique (les [[Bactérie|bactéries]]). Ce terme est également parfois rejeté par des taxonomistes qui acceptent ce système, simplement au nom de l'antériorité du terme ''empire'' {{Référence nécessaire|date=14 mai 2018}}.

La classification de [[Carl Woese]] {{et al.}} (1977, 1990)<ref>{{en}} C. R. Woese, W. E. Balch, L. J. Magrum, G. E. Fox and R. S. Wolfe, « An ancient divergence among the bacteria », dans Journal of Molecular Evolution, vol. 9, 1977, p. 305–311</ref>{{,}}<ref>[[Carl Woese|Carl R. Woese]] & [[George E. Fox]], "Phylogenetic structure of the prokaryotic domain : The primary kingdoms", ''[[Proc. Natl. Acad. Sci. USA]]'', Vol.74, No.11, November 1, 1977, {{p.}}5088-5090. {{doi|10.1073/pnas.74.11.5088}}</ref>{{,}}<ref>{{en}} [[Carl Woese|Carl R. Woese]], Otto Kandlert & Mark L. Wheelis, "Towards a natural system of organisms : Proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya", ''[[Proceedings of the National Academy of Sciences|Proc. Natl. Acad. Sci. USA]]'', Vol.87, No.12, June 1, 1990, {{p.|4576-4579}}. {{doi|10.1073/pnas.87.12.4576}}</ref> distingue trois domaines supposés [[holophylétique|monophylétique]]s :

Pour les [[Systématique évolutionniste|systématiciens évolutionnistes]], la classification du monde vivant incorporene devrait pas se fonder uniquement sur des [[Clade|clades]] et devrait incorporer le concept de [[grade évolutif]] (voir [[empire (biologie)|empire]] et [[plan d'organisation]])<ref>{{Article|langue=en|prénom1=Ernst|nom1=Mayr|prénom2=W. J.|nom2=Bock|titre=Classifications and other ordering systems|périodique=Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research|volume=40|numéro=4|date=2002-12|issn=0947-5745|issn2=1439-0469|doi=10.1046/j.1439-0469.2002.00211.x|lire en ligne=https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1046/j.1439-0469.2002.00211.x|consulté le=2018-05-14|pages=169–194}}</ref>. Or, la reconnaissance des deux domaines [[bactérie]]s et [[archée]]s au même [[rang taxonomique]] que celui des [[eucaryote]]s aurait pour effet de scinder de manière injustifiée le grade des [[procaryote]]s en deux.