« SARS-CoV-2 » : différence entre les versions
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{{Sujet Pandémie de COVID-19}}
'''SARS-CoV-2''' ([[Acronymie|acronyme]] anglais de ''{{langue|en|severe acute respiratory syndrome {{nobr|coronavirus 2}}}}'') est le [[sigle]] du '''{{nobr|coronavirus 2}} du syndrome respiratoire aigu sévère'''. Il est parfois partiellement francisé en '''SRAS-CoV-2'''. Ce [[coronavirus]] hautement [[Agent infectieux|pathogène]] a été découvert en {{date-|décembre 2019}} dans la ville de [[Wuhan]] ([[Provinces de Chine|province]] de [[Hubei]], en [[Chine]]). Il appartient au genre [[betacoronavirus]] qui regroupe entre autres les [[SARS-CoV-1]] et [[MERS-CoV]]. Le SARS-CoV-2 est une nouvelle souche de [[coronavirus]] [[Coronavirus lié au syndrome respiratoire aigu sévère|SARSr-CoV]].
Le SARS-CoV-2 est à l'origine d'une [[Pneumonie aiguë|pneumonie atypique]] [[maladie infectieuse émergente|émergente]], la [[maladie à coronavirus 2019]] (Covid-19). La progression de cette maladie a conduit l'[[Organisation mondiale de la santé]] (OMS) à la déclarer [[urgence de santé publique de portée internationale]] le {{date-|30|janvier|2020}}, puis [[pandémie de Covid-19|pandémie]] le {{date-|11 mars 2020}}.
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En dehors des coronavirus humains, le SARS-CoV-2 partage des similitudes avec le [[Coronavirus félin|FCoV]], le coronavirus du chat, car SARS-CoV-2 et FCoV peuvent se répliquer activement dans les [[macrophage]]s, qui sont des globules blancs. En revanche, le SARS-CoV-2 est l’unique coronavirus à pouvoir se reproduire dans les [[lymphocytes T]] et les [[lymphocytes B]], qui sont les plus importants [[Leucocyte|globules blancs]] du système immunitaire. Peu de virus ont cette capacité de se répliquer dans les lymphocytes. Le plus souvent, ces virus font des infections aiguës et non persistantes, le virus est éliminé comme dans le cas du [[virus de la rougeole]], qui ne s’attrape qu’une fois, mais qui provoque une « amnésie immunitaire ». ''A contrario'', le [[VIH]], qui a un fort tropisme pour les lymphocytes, est chronique, contamine le sang et provoque un [[syndrome d'immunodéficience acquise]] (SIDA). D'autres virus capables de se répliquer dans les lymphocytes peuvent persister de manière latente, sans [[virémie]], comme l'[[EBV]]/mononucléose de la famille des [[herpès]], et peut-être le SARS-CoV-2.
Présentant une vitesse actuelle de [[Mutation (génétique)|mutation]] de l’ordre de 5,
Les vaccins développés en 2020 contre le SARS-CoV-2 ciblent principalement la [[Péplomère|protéine S]] du virus, comme ceux développés contre le FCoV. Avec le FCoV, cette approche vaccinale s'est révélée contre-productive : en cas d’infection, la protection est de courte durée, les anticorps visant la protéine S font muter le FCoV et les globules blancs ([[macrophage]]s) deviennent son principal site de réplication. La conséquence est le plus souvent une [[péritonite infectieuse féline]] (PIF).
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=== Nom du virus et de la maladie ===
D'abord dénommé « coronavirus de Wuhan »<ref name="GDT-SRAS">{{GDT|SRAS-CoV-2|fiche=26557605|consulté le=2020-03-28}}.</ref> puis « nouveau coronavirus 2019 » (2019-nCoV), son nom officiel SARS-CoV-2<ref name="appellation">{{Lien web |langue=fr |titre=Appellation de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) et du virus qui la cause |url=https://www.who.int/fr/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/technical-guidance/naming-the-coronavirus-disease-(covid-2019)-and-the-virus-that-causes-it |site=who.int |éditeur=[[Organisation mondiale de la santé]] |date=2020 |consulté le=28 mars 2020}}.</ref> a été choisi le {{Date|11|février|2020}} par l'[[International Committee on Taxonomy of Viruses]] (ICTV), conformément à ses recommandations générales en cas d'émergence épidémiologique<ref>{{Lien web |titre=WHO {{!}} WHO best practices for naming of new human infectious diseases |url=https://www.who.int/topics/infectious_diseases/naming-new-diseases/en/ |site=WHO |consulté le=2020-02-10}}.</ref>. La forme longue en français de l’acronyme SARS-CoV-2 est désignée par l’[[Organisation mondiale de la santé|OMS]] {{citation|{{nobr|coronavirus 2}} du syndrome respiratoire aigu sévère}}<ref name="appellation" />, tandis que l’[[Office québécois de la langue française]] la désigne {{citation|coronavirus du syndrome respiratoire aigu {{nobr|sévère 2}}}} et francise partiellement l'acronyme en SRAS-CoV-2<ref name="GDT-SRAS" />.
Le groupe d'étude [[Nidovirales]] de l'ICTV a proposé le nom SARS-CoV-2 au terme d'une analyse taxonomique poussée<ref name="10.1101/2020.02.07.937862">{{article|langue=en |auteur1=Alexander E. Gorbalenya |auteur2=Susan C. Baker |auteur3=Ralph S. Baric |auteur4=Raoul J. de Groot |auteur5=Christian Drosten |auteur6=Anastasia A. Gulyaeva |auteur7=Bart L. Haagmans |auteur8=Chris Lauber |auteur9=Andrey M. Leontovich |auteur10=Benjamin W. Neuman |titre=Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus – ''The species and its viruses, a statement of the Coronavirus Study Group'' |périodique=bioRxiv |année=2020 |doi=10.1101/2020.02.07.937862 |lire en ligne=https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.07.937862v1 |consulté le=11 février 2020 |auteur11=Dmitry Penzar |auteur12=Stanley Perlman |auteur13=Leo L.M. Poon |auteur14=Dmitry Samborskiy |auteur15=Igor A. Sidorov |auteur16=Isabel Sola |auteur17=John Ziebuhr}}.</ref>. Ce travail montre notamment que le nouveau coronavirus appartient à la même espèce biologique que SARS-CoV qui avait causé l'épidémie de [[Syndrome respiratoire aigu sévère|SRAS]] en 2003, même si le syndrome observé en 2019 diffère de celui-ci
Simultanément, l'OMS donne à la maladie liée au virus le nom officiel de « [[maladie à coronavirus 2019]] » ([[Maladie à coronavirus 2019|COVID-19]]<ref name="appellation" />{{,}}<ref name="WHOsituationreport">{{Lien web |langue=en |format=pdf |titre=Novel Coronavirus (2019-nCoV) Situation Report – 22 |url=https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/situation-reports/20200211-sitrep-22-ncov.pdf |site=who.int |éditeur=[[Organisation mondiale de la santé]] |date=2020-02-11 |consulté le=2020-02-11 |extrait=Following WHO best practices for naming of new human infectious diseases, which were developed in consultation and collaboration with the World Organisation for Animal Health (OIE) and the Food and Agriculture Organization of the United Nations (FAO), WHO has named the disease COVID-19, short for “coronavirus disease 2019.” |page=1}}.</ref>, de l'anglais ''{{Langue|en|coronavirus disease 2019}}'') qui avant était informellement dénommée « pneumonie de Wuhan ». À noter que Covid-19 désigne la maladie et non le coronavirus, et s'emploie donc au féminin<ref name="GDT-COVID">{{GDT|COVID-19|fiche=26557671|consulté le=2020-03-28}}.</ref>{{,}}<ref>{{Lien web|titre=Le covid 19 ou La covid 19 {{!}} Académie française|url=http://academie-francaise.fr/le-covid-19-ou-la-covid-19|site=academie-francaise.fr|consulté le=2020-05-14}}.</ref>.
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