Sphingobacterium
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Sphingobacterium est un genre de bactéries de la famille des Sphingobacteriaceae.
Sphingobacterium
Colonie de Sphingobacterium mizutii sur Chocolat agar
| Domaine | Bacteria |
|---|---|
| Embranchement | Bacteroidota |
| Classe | Sphingobacteriia |
| Ordre | Sphingobacteriales |
| Famille | Sphingobacteriaceae |
Historique
modifierLe genre Sphingobacterium a été créé en 1983 par la microbiologiste japonaise Eiko Yabuuchi (d)[1] et son équipe (Takichi Kaneko, Ikuya Yano, C. Wayne Moss et Noriko Miyoshi)[2] avec comme espèce type Sphingobacterium spiritivorum[2]. Ce genre comprend un certain nombre d'espèce qui étaient classées parmi les Flavobacterium[3].
Taxonomie
modifierÉtymologie
modifierL'étymologie du genre Sphingobacterium est la suivante : Sphin.go.bac.te.ri.um. N.L. neut. n. sphingosinum, sphingosine; du Gr. fem. n. sphinx (gen. sphingos), du sphinx; de Chem. fem. suff. -ine; N.L. pref. sphingo-, se rapportant à la sphingosine; N.L. neut. n. bacterium, un bâtonnet et en biologie, une bactérie; N.L. neut. n. Sphingobacterium, une bactérie contenant de la sphingosine[4].
Liste d'espèces
modifierSelon LPSN (18 février 2023)[5] :
- Sphingobacterium alimentarium Schmidt et al. 2012
- Sphingobacterium alkalisoli Xu et al. 2017
- Sphingobacterium anhuiense Wei et al. 2008
- Sphingobacterium arenae Jiang et al. 2014
- Sphingobacterium athyrii Cheng et al. 2019
- Sphingobacterium bambusae Duan et al. 2010
- Sphingobacterium bovisgrunnientis Kaur et al. 2018
- Sphingobacterium bovistauri Wang et al. 2022
- Sphingobacterium caeni Sun et al. 2013
- Sphingobacterium canadense Mehnaz et al. 2008
- Sphingobacterium cavernae Zhou et al. 2020
- Sphingobacterium cellulitidis Huys et al. 2017
- Sphingobacterium changzhouense Liu et al. 2013
- Sphingobacterium chungjuense Song et al. 2020
- Sphingobacterium chuzhouense Wang et al. 2016
- Sphingobacterium cibi Lai et al. 2016
- Sphingobacterium cladoniae Lee et al. 2013
- Sphingobacterium composti Ten et al. 2007
- Sphingobacterium corticibacter Li et al. 2019
- Sphingobacterium corticibacterium Li et al. 2020
- Sphingobacterium corticis Li et al. 2017
- Sphingobacterium daejeonense Kim et al. 2006
- Sphingobacterium detergens Marqués et al. 2012
- Sphingobacterium endophyticum Liu et al. 2021
- Sphingobacterium faecale Chen et al. 2022
- Sphingobacterium faecium Takeuchi & Yokota 1993
- Sphingobacterium ginsenosidimutans Son et al. 2014
- Sphingobacterium gobiense Zhao et al. 2014
- Sphingobacterium griseoflavum Long et al. 2016
- Sphingobacterium haloxyli Liu et al. 2018
- Sphingobacterium hotanense Xiao et al. 2013
- Sphingobacterium humi Lee et al. 2017
- Sphingobacterium hungaricum Tóth et al. 2021
- Sphingobacterium jejuense Siddiqi et al. 2016
- Sphingobacterium kitahiroshimense Matsuyama et al. 2008
- Sphingobacterium kyonggiense Choi & Lee 2012
- Sphingobacterium lactis Schmidt et al. 2012
- Sphingobacterium litopenaei Zhang et al. 2021
- Sphingobacterium lumbrici Zhang et al. 2021
- Sphingobacterium micropteri Zhang et al. 2021
- Sphingobacterium mizutaii corrig. Yabuuchi et al. 1983
- Sphingobacterium mucilaginosum Du et al. 2015
- Sphingobacterium multivorum (Holmes et al. 1981) Yabuuchi et al. 1983
- Sphingobacterium nematocida Liu et al. 2012
- Sphingobacterium olei Liu et al. 2020
- Sphingobacterium pakistanense Ahmed et al. 2015
- Sphingobacterium paludis Feng et al. 2014
- Sphingobacterium pedocola Tóth et al. 2022
- Sphingobacterium phlebotomi Kakumanu et al. 2021
- Sphingobacterium populi Li et al. 2016
- Sphingobacterium praediipecoris Le et al. 2019
- Sphingobacterium prati Besaury et al. 2021
- Sphingobacterium psychroaquaticum Albert et al. 2013
- Sphingobacterium puteale He et al. 2019
- Sphingobacterium rhinopitheci Han et al. 2022
- Sphingobacterium shayense He et al. 2010
- Sphingobacterium siyangense Liu et al. 2008
- Sphingobacterium solani Niu et al. 2018
- Sphingobacterium soli Fu et al. 2017
- Sphingobacterium spiritivorum (Holmes et al. 1982) Yabuuchi et al. 1983
- Sphingobacterium suaedae Sun et al. 2015
- Sphingobacterium tabacisoli Zhou et al. 2017
- Sphingobacterium terrae Chaudhary & Kim 2018
- Sphingobacterium thalpophilum (Holmes et al. 1983) Takeuchi & Yokota 1993
- Sphingobacterium thermophilum Yabe et al. 2013
- Sphingobacterium wenxiniae Zhang et al. 2012
- Sphingobacterium yanglingense Peng et al. 2014
- Sphingobacterium zeae Kämpfer et al. 2016
Espèces non valides
modifierSelon LPSN (18 février 2023)[5], les espèces suivantes n'ont pas été publiées de manière valide :
- Candidatus comitans Jacobi et al. 1996. Cet genre a été publié mais de manière non valide et sans proposer formellement le nom d'espèce Sphingobacterim comitans[6]
- Sphingobacterium deserti Teng et al., 2015
- Sphingobacterium paramultivorum Wang et al., 2021
- Sphingobacterium paucimobilis White & Suttle 2013
- Sphingobacterium rhinocerotis Li et al. 2015
- Candidatus Sphingobacterium stercorigallinarum Gilroy et al. 2021
- Candidatus Sphingobacterium stercoripullorum Gilroy et al. 2021
- Sphingobacterium versatilis Yabuuchi et al. 1981
- Sphingobacterium yamdrokense Xiao et al. 2015
Anciennes espèces
modifierSelon LPSN (18 février 2023)[5], les espèces suivantes ne font plus partie du genre Sophingobacterium :
- Sphingobacterium antarcticus Shivaji et al. 1992 contenant une erreur de latinisation du nom a été renommée Sphingobacterium antarcticum corrig. Shivaji et al. 1992 puis est devenue l'espèce Pedobacter antarcticus (Shivaji et al. 1992) Farfán et al. 2014[7].
- Sphingobacterium heparinum (Payza and Korn 1956) Takeuchi and Yokota 1993 est devenue l'espèce Pedobacter heparinus (Payza and Korn 1956) Steyn et al. 1998.
- Sphingobacterium piscium Takeuchi and Yokota 1993 a été renommée Pedobacter antarcticus.
Noms corrigés
modifier- Sphingobacterium antarcticus Shivaji et al. 1992 contenant une erreur de latinisation du nom a été renommée Sphingobacterium antarcticum
- L'espèce Sphingobacterium mizutae Yabuuchi et al. 1983 a vu son nom corrigé en Sphingobacterium mizutaii corrig. Yabuuchi et al. 1983.
- L'espèce Sphingobacterium pakistanensis Ahmed et al. 2014 publiée de manière non valide et comportant un nom avec erreur a été renommée et publiée de manière valide sous le nom de Sphingobacterium pakistanense.
Publication originale
modifier- (en) Eiko Yabuuchi, Takichi Kaneko, Ikuya Yano, C. Wayne Moss et Noriko Miyoshi, « Sphingobacterium gen. nov., Sphingobacterium spiritivorum comb. nov., Sphingobacterium multivorum comb. nov., Sphingobacterium mizutae sp. nov., and Flavobacterium indologenes sp. nov.: Glucose-Nonfermenting Gram-Negative Rods in CDC Groups IIK-2 and IIb », International Journal of Systematic Bacteriology, vol. 33, no 3, , p. 580–598 (ISSN 0020-7713, 1465-2102 et 1070-6259, DOI 10.1099/00207713-33-3-580, lire en ligne)
Notes et références
modifier- NCBI, consulté le 6 novembre 2022
- Yabuuchi et al. 1983, p. 592
- Steinberg et Burg 2015.
- (en) « Genus Sphingobacterium », sur LPSN,
- List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 18 février 2023
- (en) « Genus "Candidatus Comitans" », sur LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature,
- (en) « Species Sphingobacterium antarcticum », sur LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature,
Bibliographie
modifier- (en) James P. Steinberg et Eileen M. Burd, Mandell, Douglas, and Bennett's Principles and Practice of Infectious Diseases, vol. 2, 8, (DOI 10.1016/B978-1-4557-4801-3.00238-1), « 238 - Other Gram-Negative and Gram-Variable Bacilli - Sphingobacterium species », p. 2667-2683
Liens externes
modifier- (en) Référence NCBI : Sphingobacterium Yabuuchi et al., 1983 (taxons inclus) (consulté le )
- (en) Référence Tree of Life Web Project : Sphingobacterium (consulté le )
