Thermodesulfobacteriota
Les Thermodesulfobacteriota sont un phylum du règne des Pseudomonadati au sein du domaine Bacteria. Son nom provient de Thermodesulfobacterium qui est le genre type de ce phylum. On y trouve des bactéries thermophiles sulfato-réductrices.
| Domaine | Bacteria |
|---|---|
| Règne | Pseudomonadati |
- Desulfovibriota Soltysova et al. 2025
- Desulfovibrionota corrig. Soltysova et al. 2025
- Desulfobacterota Waite et al. 2023
- Deferrisomatota Murphy et al. 2021
- Desulfobacterota Waite et al. 2020
- Thermodesulfobacteriota Whitman et al. 2018
- Thermodesulfobacteraeota Oren et al. 2015
- Thermodesulfobacteria Garrity & Holt 2001
Description
modifierLes Thermodesulfobacteriota sont des bactéries impliquées dans le cycle de fixation de l'azote. Une étude récente montre que la proportion de ces bactéries augmente dans les zones côtières soumises au réchauffement climatique et à l'eutrophisation. Leur population est plus importante dans les zones ayant un taux d'hypoxie plus important que dans les aires plus oxygénées[2]. La classe Desulfovibrionia est notamment en quantité plus importante dans ces zones hypoxiques (entre 16 et 28% de la population globale en fonction de la profondeur) que dans les zones non hypoxiques (inférieur à 10%) tandis que la classe Desulfuromonadia présente majoritairement dans les zones normales profonde, reste à des niveaux de plus de 30% dans les zones hypoxiques[2].
Historique
modifierEn , Garrity et Holt décrivent le phylum des Thermodesulfobacteria dans le Bergey's Manual of Systematic Bacteriology mais celui-ci n'est pas publié de manière valide[3]. Ce taxon a été republié en avec une modification de son nom en Thermodesulfobacteriota pour se conformer aux règles de Nomenclature de l'ICSP en maintenant l'autorité d'invention à Garrity et Holt mais avec la date de validation de 2021[1].
Taxonomie
modifierÉtymologie
modifierL'étymologie du phylum Thermodesulfobacteriota est la suivante : Ther.mo.de.sul.fo.bac.te.ri.o’ta N.L. neut. n. Thermodesulfobacterium, genre type du phylum; N.L. neut. pl. n. suff. -ota, suffixe utilisé pour définir un phylum; N.L. neut. pl. n. Thermodesulfobacteriota, le phylum des Thermodesulfobacterium[1],[4].
Liste des classes
modifierSelon la LPSN ()[5] ce phylum comporte les classes suivantes :
- Deferrisomatia Waite et al. 2020
- Desulfarculia Waite et al. 2020
- Desulfobaccia Waite et al. 2020
- Desulfobacteria Waite et al. 2020
- Desulfobulbia Waite et al. 2020
- Desulfomonilia Waite et al. 2020
- Desulfovibrionia Waite et al. 2020
- Desulfuromonadia Waite et al. 2020
- Dissulfuribacteria Waite et al. 2020
- Syntrophia Waite et al. 2020
- Syntrophobacteria Waite et al. 2020
- Syntrophorhabdia Waite et al. 2020
- Thermodesulfobacteria Hatchikian et al. 2002
Il comporte aussi un genre incertae sedis, les Thermosulfuriphilus Slobodkina et al. 2017[6].
Notes et références
modifier- 1 2 3 Oren et Garrity 2021, p. 5.
- 1 2 (en) « Chemoautotrophic Thermodesulfobacteriota as a key genomic potential group in the hypoxic diazotrophic community of the Changjiang (Yangtze River) estuary », Frontiers in Microbiology, vol. 16, (DOI 10.3389/fmicb.2025.1671267)
- ↑ Garrity et Holt 2001, p. 389.
- ↑ (en) « Phylum Thermodesulfobacteriota », sur LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (consulté le )
- ↑ List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le .
- ↑ « Family Thermodesulfobacteriota, not assigned to family », sur LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (consulté le )
Bibliographie
modifier- (en) A Oren et GM Garrity, « Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 71, no 10, , p. 005056 (DOI 10.1099/ijsem.0.005056)
- (en) GM Garrity et Holt JG., Bergey's Manual of Systematic Bacteriology (Boone DR, Castenholz RW, Garrity GM (eds)), vol. 1 (The Archaea and the Deeply Branching and Phototrophic Bacteria), New York, Springer, , « Phylum BIII. Thermodesulfobacteria phy. nov. », p. 389-393
Liens externes
modifier- (en) LPSN : Thermodesulfobacteriota Garrity & Holt 2021 (consulté le )
- (en) NCBI : Thermodesulfobacteriota (taxons inclus) (consulté le )