Colwellia aquaemaris
Colwellia aquaemaris est une espèce du genre de bactéries marines à Gram négatif Colwellia. Cette espèce de la famille des Colwelliaceae et de l'ordre des Alteromonadales fait partie du phylum des Pseudomonadota.
| Domaine | Bacteria |
|---|---|
| Règne | Pseudomonadati |
| Phylum | Pseudomonadota |
| Classe | Gammaproteobacteria |
| Ordre | Alteromonadales |
| Famille | Colwelliaceae |
| Genre | Colwellia |
Historique
modifierL'espèce Colwellia aquaemaris a été décrite en après l'isolement de sa souche type dans un bassin d'aquaculture à recirculation d'eau de mer dans lequel se trouvaient des poissons plats Cynoglossus semilaevis à Tianjin (Chine)[2],[3]. En , Colwellia aquaemaris a été isolée dans des échantillons de l'algue brune Acophyllum nodosum, prélevés dans l'estran de Roscoff (France)[4].
Taxonomie
modifierLe nom correct complet (avec auteur) de ce taxon est Colwellia aquaemaris Liu et al. 2014[5].
Étymologie
modifierClassification Phylogénique
modifierLa taxonomie de cette espèce a été étudiée par une approche polyphasique combinant l'utilisation de comparaisons des séquences nucléotidiques de l'ARNr16S et de leur analyse phylogénique, l'analyse du contenu en acides gras cellulaires, et la caractérisation de ses activités biochimiques[6]. L'analyse phylogénique de la séquence nucléotidique de l'ARNr 16S de la souche S1 a permis de classer cette bactérie dans le genre Colwellia tout en formant une lignée distincte dans un clade comprenant Colwellia meonggei, Colwellia aestuarii, Colwellia polaris et Colwellia chukchiensis[8]. Placée au niveau du même nœud que Colwellia meonggei, la similarité des séquences d'ARNr 16S est de 97,7 %[9]. Les bactéries de ce genre bactérien sont phylogénétiquement incluses dans la classe des Pseudomonadota (ex Proteobactéries)[4].
Description
modifierColwellia aquaemaris est une bactérie hétérotrophe et anaérobie facultative à Gram négatif. Cette espèce est formée des bacilles faiblement positifs pour les tests catalase et oxydase[6]. Cette espèce dispose d'agarases, de κ-carraghénases, de ι-carraghénases capables de dégrader des polysaccharides[4]. Elle n'a pas démontré d'activité alginate lyase[4].
Habitat
modifierIsolée dans l'eau de mer et nécessitant du NaCl pour sa croissance, Colwellia aquaemaris est une bactérie vivant dans l'environnement marin[6]. Colwellia aquaemaris a aussi été isolée sur des algues de l'espèce Ascophyllum nodosum[4].
Notes et références
modifier- ↑ Liu et et al. 2014, p. 3926.
- ↑ Liu et et al. 2014, p. 3930.
- ↑ (en) Charles Thomas Parker (éditeur) et George M Garrity (éditeur), « Nomenclature Abstract for Colwellia aquaemaris Liu et al. 2014. », sur The NamesforLife Abstracts, (DOI 10.1601/nm.26118)
- 1 2 3 4 5 (en) Marjolaine Martin, Tristan Barbeyron, Renee Martin, Daniel Portetelle, Gurvan Michel et Micheline Vandenbol, « The Cultivable Surface Microbiota of the Brown Alga Ascophyllum nodosum is Enriched in Macroalgal-Polysaccharide-Degrading Bacteria », Frontiers in Microbiology, vol. 6, , p. 1487 (DOI 10.3389/fmicb.2015.01487)
- ↑ List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le .
- 1 2 3 4 Liu et et al. 2014, p. 3929.
- ↑ (en) « Species Colwellia aquaemaris », sur LPSN,
- ↑ Liu et et al. 2014, p. 3928-3929.
- ↑ Liu et et al. 2014, p. 3928.
Bibliographie
modifier- (en) Ying Liu, « Colwellia aquaemaris sp. nov., isolated from the Cynoglossus semilaevis culture tank in a recirculating mariculture system », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, vol. 64, no 12, , p. 3926-3930 (DOI 10.1099/ijs.0.063305-0)
Liens externes
modifier- (en) Catalogue of Life : Colwellia aquaemaris Liu et al., 2014 (consulté le )
- (fr + en) EOL : Colwellia aquaemaris (consulté le )
- (fr + en) GBIF : Colwellia aquaemaris Liu et al., 2014 (consulté le )
- (en) LPSN : Colwellia aquaemaris Liu et al. 2014 (consulté le )
- (en) NCBI : Colwellia aquaemaris (taxons inclus) (consulté le )
- (en) Taxonomicon : Colwellia aquaemaris Liu et al. 2014 (consulté le )
