Haplogroupe C1a1
En génétique humaine, l'haplogroupe C1a1 (aussi appelé C-M8) est un haplogroupe du chromosome Y. L'haplogroupe C1a1 est le groupe-frère de l'haplogroupe C1a2 (ou C-V20). A eux deux, ils constituent les branches majeures de l'haplogroupe C1a, elle-même sous-clade du C1 et plus généralement de l'haplogroupe C.
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| Date d'origine |
41,900 avant présent[1] 51,800 avant présent[2] |
|---|---|
| Place d'origine | Asie du Sud-Est[3] |
| Ancêtre | Haplogroupe C1a |
| Mutations définies | M8, M105, M131, P122 |
| Plus hautes fréquences | Japon, peuple Jomon |
Origine
modifierLe Dernier ancêtre commun (DAC) avec son groupe frère C1a2 date de 40 000[1] à 50 000[2] ans. La diffusion du C1a1 et de ses sous-clades est estimée aux alentours de 12 000 ans avant présent, coïncidant avec le début approximatif de la période Jōmon[4] et de ses chasseurs-cueilleurs. Il a en effet été retrouvé chez des individus du peuple Jōmon et serait lié aux flux migratoires venant du sud via les multiples îles de l'archipel Nansei et Taïwan. De fait, juste avant que la dernière période glaciaire touche à sa fin, celles-ci étaient directement reliée par un pont de terre au continent. Cependant, il est impossible d'affirmer avec certitude les routes migratoires empruntées par les individus du C1a1, une autre hypothèse pouvant être une arrivée par la Corée ; la seule certitude étant que cet haplogroupe est quasiment exclusif à l'archipel Japonais.
Le C1a1 est considéré comme étant l'un des haplogroupes courants parmi le peuple Jōmon (environ 30% voire plus), avec le D1a2a, le D1a1, le C2, le K et le F.[5]
Distribution
modifierSelon des études génétiques récentes sur les origines du peuple japonais, il a été trouvé sur environ 6% (entre 2.3% et 16.7%) des individus masculins pris au Japon et est considéré comme l'haplogroupe du chromosome Y correspondant aux peuples de la période Jōmon (période mésolithique japonaise)[6],[7].
Partout ailleurs, il n'a été observé dans des études académiques que chez un unique individu venant de la province de Jeju en Corée du Sud[8]. En ajoutant à cela les individus ayant fait des tests d'analyses généalogiques commerciales, il a également été retrouvé très rarement chez des individus originaires de Corée et de Chine[9],[10],[11],[12],[8]
Fréquence au Japon
modifierVoici la fréquence du C1a1 dans les échantillons au Japon selon les différentes régions[7]:
- Okinawa 9.0% (4.4%[13] - 16.7%[14])[15]
- Kagawa: 8.5%[16]
- Tokyo 7.1%[2]
- Miyazaki 6.5% (de 0/29 = 0% Misato à 2/8 = 25% Aya, ou 28/291 = 9.6% Western Miyazaki, 22/349 = 6.3% Northern Miyazaki, 27/488 = 5.5% Central Miyazaki, 6/141 = 4.3% Southern Miyazaki)[17]
- Tokushima 6.3% (5.7%[18] - 10.0%[4])
- Osaka 6.2%[7]
- Fukuoka 5.9%[18]
- Kawasaki 5.6%[18]
- Shizuoka 4.9%[4]
- Sapporo 4.1% (3.4%[18] - 4.6%[18])
- Kanazawa 4.0% (3.4%[18] - 4.7%[18])
- Aomori 3.8% (2.5%[14] - 7.7%[4])
- Nagasaki 3.3%[18]
- Saga 2.3%[14]
Schéma général
modifier|
Haplogroupes du chromosome Y (Y-ADN) | ||||||||||||||||||||||||
| Plus récent ancêtre patrilinéaire commun | ||||||||||||||||||||||||
| A | ||||||||||||||||||||||||
| BT | ||||||||||||||||||||||||
| B | CT | |||||||||||||||||||||||
| DE | CF | |||||||||||||||||||||||
| D | E | C | F | |||||||||||||||||||||
| G | H | IJK | ||||||||||||||||||||||
| IJ | K | |||||||||||||||||||||||
| I | J | LT | K2 | |||||||||||||||||||||
| I1 | L | T | MS | P | NO | |||||||||||||||||||
| M | S | Q | R | N | O | |||||||||||||||||||
| R1 | R2 | |||||||||||||||||||||||
| R1a | R1b | |||||||||||||||||||||||
Références
modifier- Zhong H, Shi H, Qi XB et al. (July 2010). "Global distribution of Y-chromosome haplogroup C-M130 reveals the prehistoric migration routes of African exodus and early settlement in East Asia". J. Hum. Genet. 55 (7): 428–35. DOI 10.1038/jhg.2010.40. .
- G. David Poznik, Yali Xue, Fernando L. Mendez, et al., "Punctuated bursts in human male demography inferred from 1,244 worldwide Y-chromosome sequences." Nature Genetics 2016 June ; 48(6): 593–599. DOI 10.1038/ng.3559.
- « FamilyTreeDNA - Genetic Testing for Ancestry, Family History & Genealogy »
- Hammer MF, Karafet TM, Park H et al. (2006). "Dual origins of the Japanese: common ground for hunter-gatherer and farmer Y chromosomes". J. Hum. Genet. 51 (1): 47–58. DOI 10.1007/s10038-005-0322-0. .
- (en) Jun Ohashi, Katsushi Tokunaga, Yuki Hitomi, Hiromi Sawai, Seik-Soon Khor, Izumi Naka et Yusuke Watanabe, « Analysis of whole Y-chromosome sequences reveals the Japanese population history in the Jomon period », Scientific Reports, vol. 9, no 1, , p. 8556 (ISSN 2045-2322, PMID 31209235, PMCID 6572846, DOI 10.1038/s41598-019-44473-z, Bibcode 2019NatSR...9.8556W)
- Michael F Hammer; Tatiana M Karafet; Hwayong Park; Keiichi Omoto; Shinji Harihara; Mark Stoneking; Satoshi Horai (2006). “Dual origins of the Japanese: common ground for hunter-gatherer and farmer Y chromosomes”. Journal of Human Genetics 51 (1): 47 - 58. DOI 10.1007/s10038-005-0322-0. .
- (en) Yutaka Nakahori, Teruaki Iwamoto, Aiko Yamauchi, Ashraf A. Ewis, Toshikatsu Shinka et Youichi Sato, « Overview of genetic variation in the Y chromosome of modern Japanese males », Anthropological Science, vol. 122, no 3, , p. 131–136 (ISSN 0918-7960, DOI 10.1537/ase.140709
, lire en ligne)
- Soon-Hee Kim, Ki-Cheol Kim, Dong-Jik Shin, Han-Jun Jin, Kyoung-Don Kwak, Myun-Soo Han, Joon-Myong Song, Won Kim et Wook Kim, « High frequencies of Y-chromosome haplogroup O2b-SRY465 lineages in Korea: A genetic perspective on the peopling of Korea », Investigative Genetics, vol. 2, no 1, , p. 10 (PMID 21463511, PMCID 3087676, DOI 10.1186/2041-2223-2-10)
- Phylogenetic tree of haplogroup C-M8/C-M105 according to FamilyTreeDNA
- Phylogenetic tree of haplogroup C-M8 according to YFull
- Phylogenetic tree of haplogroup C-M8 according to 23mofang
- Phylogenetic tree of haplogroup C-M8 according to TheYtree
- Tajima, Atsushi; Hayami, Masanori; Tokunaga, Katsushi; Juji, T; Matsuo, M; Marzuki, S; Omoto, K; Horai, S (2004). "Genetic origins of the Ainu inferred from combined DNA analyses of maternal and paternal lineages". Journal of Human Genetics 49 (4): 187–193. DOI 10.1007/s10038-004-0131-x. .
- Shoji Totsuka, The Super Science High School Consortium, Youichi Sato, and Masashi Tanaka, "A study of the geographic distribution of Y chromosomal and mitochondrial DNA haplogroups in Japanese population by Super Science High School Consortium (SSH)." Anthropological Science (Japanese Series) Vol. 124(2), 85–91, 2016.
- Nonaka I, Minaguchi K, Takezaki N (July 2007). "Y-chromosomal binary haplogroups in the Japanese population and their relationship to 16 Y-STR polymorphisms". Ann. Hum. Genet. 71 (Pt 4): 480–95. DOI 10.1111/j.1469-1809.2006.00343.x. .
- Yali Xue, Tatiana Zerjal, Weidong Bao, Suling Zhu, Qunfang Shu, Jiujin Xu, Ruofu Du, Songbin Fu, Pu Li, Matthew E. Hurles, Huanming Yang, and Chris Tyler-Smith, "Male Demography in East Asia: A North–South Contrast in Human Population Expansion Times." Genetics 172: 2431–2439 (April 2006). DOI: 10.1534/genetics.105.054270
- Hirofumi Nohara, Ikuko Maeda, Rinnosuke Hisazumi, Taketo Uchiyama, Hiroko Hirashima, Masahito Nakata, Ohno Rika, Tetsuro Hasegawa, and Kenshi Shimizu, "Geographic distribution of Y-STR haplotypes and Y-haplogroups among Miyazaki Prefecture residents." Japanese Journal of Forensic Science and Technology, Volume 26 (2021), No. 1., p. 17-27. https://doi.org/10.3408/jafst.778
- Youichi Sato, Toshikatsu Shinka, Ashraf A. Ewis, Aiko Yamauchi, Teruaki Iwamoto, and Yutaka Nakahori, "Overview of genetic variation in the Y chromosome of modern Japanese males." Anthropological Science Vol. 122(3), 131–136, 2014. DOI 10.1537/ase.140709
