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Haplogroupe I-M253

L'haplogroupe I-M253, aussi connu comme I1, est un haplogroupe du chromosome Y. Les marqueurs génétiques identifiants confirmés de I-M253 sont les SNP's M253,M307.2/P203.2, M450/S109, P30, P40, L64, L75, L80, L81, L118, L121/S62, L123, L124/S64, L125/S65, L157.1, L186, et L187. C'est une branche primaire de l'Haplogroupe I-M170 (I*).

I1 (M253)
Description de l'image HG I1 europa.jpg.
Caractéristiques
Date d'origine 3170–5070 av. J.-C. (précédemment 11000 av. J.-C. à 33000 av. J.-C.)
Place d'origine Europe du Nord
Ancêtre I* (M170)
Descendants I1a (DF29/S438);
I1b (S249/Z131);
I1c (Y18119/Z17925)
Mutations définies M253, M307.2/P203.2, M450/S109, P30, P40, L64, L75, L80, L81, L118, L121/S62, L123, L124/S64, L125/S65, L157.1, L186, L187

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L'haplogroupe atteint ses fréquences de pointe en Suède (52 % des hommes dans le comté de Västra Götaland) et à l'ouest de la Finlande (plus de 50 % dans la province de Satakunta)[1] En termes de moyennes nationales, I-M253 se situe entre 35 et 38 % des hommes suédois[2], 32,8 % des hommes danois, environ 31,5 % des mâles norvégiens[3] et environ 28 % des hommes finlandais.

L'haplogroupe I-M253 est une branche primaire de l'haplogroupe I* (I-M170), qui a été présente en Europe depuis l'antiquité. L'autre branche primaire de I* est-I-M438, également connue comme I2.

Avant un reclassement en 2008[4], le groupe était connu comme I1a, un nom qui a depuis été réaffecté à une branche primaire, l'haplogroupe I-DF29. Les autres principales branches de I1 (M253) sont I1b (S249/Z131) et I1c (Y18119/Z17925).

Origines

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Selon une étude publiée en 2010, I-M253 est apparu entre 3 170 et 5 000 ans, au Chalcolithique en Europe[5]. Une nouvelle étude en 2015 estime son origine entre 3 470 et 5 070 ans ou entre 3 180 et 3 760, à l'aide de deux techniques différentes[6]. Il est suggéré qu'il a initialement essaimé à partir de la région qui est maintenant le Danemark[7].

Une étude de 2014 en Hongrie révéla les restes de neuf personnes de la culture rubanée, dont un portait le SNP M253 qui définit l'haplogroupe I1. Cette culture perdure entre 5 500 à 4 700 ans av. J.-C.[8].

Structure

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I-M253 (M253, M307.2/P203.2, M450/S109, P30, P40, L64, L75, L80, L81, L118, L121/S62, L123, L124/S64, L125/S65, L157.1, L186, et L187) ou I1&#x20[9];

  • I-DF29 (DF29/S438); I1a
    • I-CTS6364 (CTS6364/Z2336); I1a1
      • I-M227; I1a1a
      • I-L22 (L22/S142); I1a1b
        • I-P109; I1a1b1
        • I-L205 (L205.1/L939.1/S239.1); I1a1b2
        • I-Z74; I1a1b3
        • I-L300 (L300/S241); I1a1b4
          • I-L287
            • I-L258 (L258/S335)
          • I-L813
    • I-Z58 (S244/Z58); I1a2
      • I-Z59 (S246/Z59); I1a2a
        • I-Z60 (S337/Z60, S439/Z61, Z62); I1a2a1
          • I-Z140 (Z140, Z141)
            • I-L338
            • I-F2642 (F2642)
          • I-Z73
            • I-L1302
          • I-L573
          • I-L803
        • I-Z382; I1a2a2
      • I-Z138 (S296/Z138, Z139); I1a2b
        • I-Z2541
    • I-Z63 (S243/Z63); I1a3
      • I-BY151; I1a3a
        • I-L849.2; I1a3a1
        • I-BY351; I1a3a2
            • I-CTS10345
              • I-Y10994
            • I-Y7075
        • I-S2078
          • I-S2077
            • I-Y2245 (Y2245/PR683)
              • I-L1237
                • I-FGC9550
              • I-S10360
                • I-S15301
              • I-Y7234
        • I-BY62 (BY62); I1a3a3
  • I-Z131 (Z131/S249); I1b
    • I-CTS6397; I1b1
  • I-Z17943 (Y18119/Z17925, S2304/Z17937); I1c

Répartition géographique

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I-M253 est trouvé à densité élevée dans le Nord de l'Europe et d'autres pays qui ont subi d'importantes migrations de l'Europe du Nord, soit dans la Période de Migration, la période Viking de ou de l'époque moderne. On le trouve dans tous les endroits envahis par les anciens Germains et les Vikings.

Au cours de l'ère moderne, d'importants populations I-M253 ont d'ailleurs pris racine dans des pays d'immigration et anciennes colonies européennes telles que les États-Unis, l'Australie et le Canada.

Population Taille de l'échantillon I (total) I1 (I-M253) I1a1a (I-M227) Source
Autriche 43 9.3 2.3 0.0 Underhill et al. 2007
Biélorussie: Vitebsk 100 15 1.0 0.0 Underhill et al. 2007
Biélorussie: Brest 97 20.6 1.0 0.0 Underhill et al. 2007
Bosnie 100 42 2.0 0.0 Rootsi et al. 2004
Bulgarie 808 26.6 4.3 0.0 Karachanak et al. 2013
République Tchèque 47 31.9 8.5 0.0 Underhill et al. 2007
République Tchèque 53 17.0 1.9 0.0 Rootsi et al. 2004
Danemark 122 39.3 32.8 0.0 Underhill et al. 2007
Angleterre 104 19.2 15.4 0.0 Underhill et al. 2007
Estonie 210 18.6 14.8 0.5 Rootsi et al. 2004
Estonie 118 11.9 Lappalainen et al. 2008
Finlande (national) 28.0 Lappalainen et al. 2006
Finlande: ouest 230 40 Lappalainen et al. 2008
Finlande: est 306 19 Lappalainen et al. 2008
Finlande: région de Satakunta  50+ Lappalainen et al. 20089
France 58 17.2 8.6 1.7 Underhill et al. 2007
France 12 16.7 16.7 0.0 Cann et al. 2002
France (Basse-Normandie) 42 21.4 11.9 0.0 Rootsi et al. 2004
Allemagne 125 24 15.2 0.0 Underhill et al. 2007
Grèce 171 15.8 2.3 0.0 Underhill et al. 2007
Hongrie 113 25.7 13.3 0.0 Rootsi et al. 2004
Irlande 100 11 6.0 0.0 Underhill et al. 2007
Tatars de Kazan 53 13.2 11.3 0.0 Trofimova 2015
Lettonie 113 3.5 Lappalainen et al. 2008
Lituanie 164 4.9 Lappalainen et al. 2008
Pays-Bas 93 20.4 14 0.0 Underhill et al. 2007
Norvège 2826 31.5 Eupedia 2017 [réf. à confirmer]
Russie (national) 16 25 12.5 0.0 Cann et al. 2002
Russie: Pskov 130 16.9 5.4 0.0 Underhill et al. 2007
Russie: Kostroma 53 26.4 11.3 0.0 Underhill et al. 2007
Russie: Smolensk 103 12.6 1.9 0.0 Underhill et al. 2007
Russie: Voronez 96 19.8 3.1 0.0 Underhill et al. 2007
Russie: Arkhangelsk 145 15.8 7.6 0.0 Underhill et al. 2007
Russie: Cossaques 89 24.7 4.5 0.0 Underhill et al. 2007
Russie: Caréliens 140 10 8.6 0.0 Underhill et al. 2007
Russie: Caréliens 132 15.2 Lappalainen et al. 2008
Russie: Vepsa 39 5.1 2.6 0.0 Underhill et al. 2007
Slovaquie 70 14.3 4.3 0.0 Rootsi et al. 2004
Slovénie 95 26.3 7.4 0.0 Underhill et al. 2007
Suède (national) 160 35.6 Lappalainen et al. 2008
Suède (national) 38.0 Lappalainen et al. 2009
Suède: Västra Götaland 52 Lappalainen et al. 2009
Suisse 144 7.6 5.6 0.0 Rootsi et al. 2004
Turquie 523 5.4 1.1 0.0 Underhill et al. 2007
Ukraine: Lvov 101 23.8 4.9 0.0 Underhill et al. 2007
Ukraine: Ivanovo-Frankov 56 21.4 1.8 0.0 Underhill et al. 2007
Ukraine: Hmelnitz 176 26.2 6.1 0.0 Underhill et al. 2007
Ukraine: Cherkassy 114 28.1 4.3 0.0 Underhill et al. 2007
Ukraine: Belgorod 56 26.8 5.3 0.0 Underhill et al. 2007

Suède

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Danemark

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Norvège

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Finlande

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Grande-Bretagne

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Carte montrant la répartition des chromosomes Y en trans-section de l'Angleterre et du pays de Galles à partir de l'étude "Évidence de l'immigration en masse des Anglo-Saxons par le chromosome Y". Les auteurs attribuent les différences dans les fréquences de l'haplogroupe I à  l'immigration Anglo-Saxonne massive en Angleterre, mais pas au pays de Galles.

En 2002, un document a été publié par Michael E. Weale et collègues en montrant la preuve génétique des différences entre la population anglaise et galloise, y compris un niveau nettement plus élevé de l'ADN-Y de l'haplogroupe I en Angleterre que dans le pays de Galles. Ils ont vu cela comme une preuve convaincante de l'invasion massive anglo-saxonne de l'est de la Grande-Bretagne à partir de l'Allemagne du nord et du Danemark au cours de la Période de Migration[10]. Les auteurs ont supposé que les populations avec des grandes proportions d'haplogroupe I furent originaires de l'Allemagne du nord ou du sud de la Scandinavie, en particulier du Danemark, et que leurs ancêtres avaient migré à travers la Mer du Nord  avec les migrations des Anglo-Saxons et les Vikings danois. La principale revendication faite par les rechercheurs était:

qu'un événement d'immigration anglo-saxonne affectant de 50 à 100 % du fonds génétique des hommes de l'Angleterre centrale serait nécessaire à l'époque. Nous observons, toutefois, que nos données ne nous permettent pas de distinguer un événement simplement ajouté au fonds génétique masculin indigène de l'Angleterre centrale, d'un autre où les populations de mâles autochtones étaient déplacés ailleurs, ou bien où le nombre d'hommes autochtones a été réduit ... Cette étude montre que la frontière galloise était plus une barrière génétique aux flux de gènes du chromosome Y anglo-saxon que la Mer du Nord. Ces résultats indiquent qu'une frontière politique peut être plus important qu'une géophysique dans la structuration génétique des populations.

La Distribution des haplogroupes du chromosome Y de Capelli et coll. (2003). L'haplogroupe I est présent dans toutes les populations, avec des fréquences plus élevées dans l'est et des basses fréquences dans l'ouest. Il ne semble pas exister une limite précise comme observé par Weale et coll. (2002)

En 2003, un document publié par Christian Capelli et les collègues prit en charge, mais modifié, les conclusions de Weale et collègues[11]. Ce document, qui a échantillonné sur une grille la Grande-Bretagne et l'Irlande , a trouvé une petite différence entre les échantillons gallois et anglais, avec une diminution progressive de fréquence de l'haplogroupe I en se déplaçant vers l'ouest dans le sud de la Grande-Bretagne. Les résultats suggérèrent aux auteurs que les envahisseurs vikings norvégiens avaient fortement influencé le secteur nord des Îles Britanniques, mais que les deux échantillons anglais et le écossais (de l’île principale) ont tous les deux de l'influence allemande/danoise .

Membres éminents de l'I-M253

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Alexander Hamilton, par la généalogie et les tests de ses descendants (en supposant être la paternité réelle correspondante de sa généalogie), a été placé dans l'haplogroupe ADN-Y I-M253[12].

Birger Jarl, "Duc de Suède" de la Maison des Goths de Bjalbo, fondateur de Stockholm, dont les vestiges enfouis dans une église avaient été faits tester en 2002 et confirmés aussi I-M253

Les Passagers du Mayflower William Brewster, Edward Winslow et George Soule grâce à des tests ADN

Marqueurs

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ADN, exemple: chaîne 1 ne diffère de la chaîne 2 que par un seul pair de base (polymorphisme C > T).

Voici les spécifications techniques pour les mutations SNP et STR de I'haplogroupe I-M253.

Nom: M253[13]

Type: SNP
Source: M (Peter Underhill de « l'Université de Stanford »(Archive.org • Wikiwix • Archive.is • Google • Que faire ?) (consulté le ))
Position: « ChrY:13532101..13532101 (+ verticale) »(Archive.org • Wikiwix • Archive.is • Google • Que faire ?) (consulté le )
Position (paires de bases): 283
Taille totale (paires de bases): 400
Longueur: 1
ISOGG HG: I1
Amorce F (sense 5'→ 3'): GCAACAATGAGGGTTTTTTTG
Amorce R (anti-sense 5'→ 3'): CAGCTCCACCTCTATGCAGTTT
YCC HG: I1
Changement de nucléotides allèles (mutation): C à T

Nom: M307[14]

Type: SNP
Source: M (Peter Underhill)
Position: « ChrY:21160339..21160339 (+ verticale) »(Archive.org • Wikiwix • Archive.is • Google • Que faire ?) (consulté le )
Longueur: 1
ISOGG HG: I1
Amorce F: TTATTGGCATTTCAGGAAGTG
Amorce R: GGGTGAGGCAGGAAAATAGC
YCC HG: I1
Changement de nucléotides allèles (mutation): G pour A

Nom: P30[15]

Type: SNP
Source: PS (« Michael Hammer »(Archive.org • Wikiwix • Archive.is • Google • Que faire ?) (consulté le ) de l' Université de l'Arizona et James F. Wilson, de l'Université d'Édimbourg)
Position: « ChrY:13006761..13006761 (+ verticale) »(Archive.org • Wikiwix • Archive.is • Google • Que faire ?) (consulté le )
Longueur: 1
ISOGG HG: I1
Amorce F: GGTGGGCTGTTTGAAAAAGA
Amorce R: AGCCAAATACCAGTCGTCAC
YCC HG: I1
Changement de nucléotides allèles (mutation): G pour A
Région: ARSDP

Nom: P40[16]

Type: SNP
Source: PS (Michael Hammer et James F. Wilson)
Position: « ChrY:12994402..12994402 (+ verticale) »(Archive.org • Wikiwix • Archive.is • Google • Que faire ?) (consulté le )
Longueur: 1
ISOGG HG: I1
Amorce F: GGAGAAAAGGTGAGAAACC
Amorce R: GGACAAGGGGCAGATT
YCC HG: I1
De nucléotides allèles changement (mutation): C à T
Région: ARSDP

Références

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  1. ↑ T. Lappalainen, V. Laitinen, E. Salmela et P. Andersen, « Migration Waves to the Baltic Sea Region », Annals of Human Genetics, vol. 72, no 3,‎ , p. 337–348 (PMID 18294359, DOI 10.1111/j.1469-1809.2007.00429.x).
  2. ↑ T. Lappalainen, U. Hannelius, E. Salmela et U. von Döbeln, « Population Structure in Contemporary Sweden: A Y-Chromosomal and Mitochondrial DNA Analysis », Annals of Human Genetics, vol. 73, no 1,‎ , p. 61–73 (PMID 19040656, DOI 10.1111/j.1469-1809.2008.00487.x).
  3. ↑ (en) Eupedia, Distribution of European Y-chromosome DNA (Y-DNA) haplogroups by country in percentage, .
  4. ↑ Tatiana M. Karafet, F. L. Mendez, M. B. Meilerman et P. A. Underhill, « New binary polymorphisms reshape and increase resolution of the human Y chromosomal haplogroup tree », Genome Research, vol. 18, no 5,‎ , p. 830–8 (PMID 18385274, PMCID 2336805, DOI 10.1101/gr.7172008).
  5. ↑ (en) Pedro Soares, Alessandro Achilli, Ornella Semino, William Davies, Vincent Macaulay, Hans-Jürgen Bandelt, Antonio Torroni, and Martin B. Richards, The Archaeogenetics of Europe, Current Biology, vol. 20 (February 23, 2010), R174–R183. yDNA Haplogroup I: Subclade I1, Family Tree DNA.
  6. ↑ (en) « TMRCAs of major haplogroups in Europe estimated using two methods. : Large-scale recent expansion of European patrilineages shown by population resequencing : Nature Communications : Nature Publishing Group », sur www.nature.com (consulté le ).
  7. ↑ (en) Peter A. Underhill et al., New Phylogenetic Relationships for Y-chromosome Haplogroup I: Reappraising its Phylogeography and Prehistory, in Rethinking the Human Revolution (2007), p. 33-42.
  8. ↑ (en) Anna Szécsényi-Nagy et al., « Tracing the genetic origin of Europe's first farmers reveals insights into their social organization », 2015 apr 22.
  9. ↑ ISOGG, Y-DNA Haplogroup I and its Subclades - 2017 (31 January 2017).
  10. ↑ Michael E. Weale, Deborah A. Weiss, Rolf F. Jager et Neil Bradman, « Y chromosome Evidence for Anglo-Saxon Mass Migration », Molecular Biology and Evolution, vol. 19, no 7,‎ , p. 1008–1021 (PMID 12082121, DOI 10.1093/oxfordjournals.molbev.a004160, lire en ligne).
  11. ↑ Cristian Capelli, Nicola Redhead, Julia K. Abernethy et Fiona Gratrix, « A Y Chromosome Census of the British Isles », Current Biology, vol. 13, no 11,‎ , p. 979–984 (PMID 12781138, DOI 10.1016/S0960-9822(03)00373-7, lire en ligne [PDF]).
  12. ↑ « Founding Father DNA », isogg.org, sur isogg.org.
  13. ↑ snpdev, « Reference SNP (refSNP) Cluster Report: rs9341296 », nih.gov, sur nih.gov.
  14. ↑ snpdev, « Reference SNP (refSNP) Cluster Report: rs13447354 », nih.gov, sur nih.gov.
  15. ↑ « P30 »(Archive.org • Wikiwix • Archive.is • Google • Que faire ?) (consulté le ).
  16. ↑ « P40 »(Archive.org • Wikiwix • Archive.is • Google • Que faire ?) (consulté le ).

Projets

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Haplogroupe I bases de données
Bases de données générales ADN-Y

Il existe plusieurs bases de données publiques mettant en vedette I-M253, y compris:

  1. http://www.eupedia.com/europe/european_y-dna_haplogroups.shtml
  2. http://www.semargl.me/
  3. http://www.ysearch.org/
  4. http://www.yhrd.org/
  5. http://www.yfull.com/tree/I1/

Haplogroupes du chromosome Y (Y-ADN)

Plus récent ancêtre patrilinéaire commun
A
BT
 B CT
DE CF
 D E C F
 G H IJK
IJ K
I J LT K2
I1 L T  MS  P  NO
M S Q R N O
R1 R2
R1a R1b
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