Parabacteroides

genre de bactérie

Parabacteroides est un genre de bactérie à Gram négatif auparavant inclus dans le groupe de bactéries du genre Bacteroides résistantes à la bile. Parabacteroides fait partie de l'ordre des Bacteroidales et du phylum Bacteroidota.

Historique

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Dans le genre Bacteroides plusieurs espèces dont Bacteroides distasonis faisaient partie d'un groupe de bactéries dites «groupe Bacteroides fragilis» résistantes à la bile . Cette espèce, décrite en [2] a été reclassée comme Parabacteroides distasonis à la suite de l'analyse de sa séquence de l'ARNr 16S et a donné naissance au genre Parabacteroides[1].

Taxonomie

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Étymologie

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L'étymologie du genre Parabacteroides est la suivante : Gr. pref. para-, à côté de; N.L. masc. n. Bacteroides, un nom de genre bactérien; N.L. masc. n. Parabacteroides, qui ressemble aux Bacteroides[3],[4].

Classification Phylogénique

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Des bactéries du groupe résistant à la bile identifiées comme des Bacteroides ont présenté une meilleure similarité de séquence de l'ARNr 16S avec l'espèce Tannerella forsythensis (près de 90%) contre seulement 82% (environ) avec les autres espèces de Bacteroides et environ 84% avec un groupe de Porphyromonas[1]. L'analyse phylogénique qui en a été déduite a positionné les trois bactéries de ce groupe (Bacteroides distasonis, B. goldsteinii et B. merdae ) dans un même clade plus proche des genres Tannerella et Porphyromonas que de Bacteroides[5]. Ce genre a d'abord été classé dans la famille Bacteroidaceae[6] puis à partir de proposé pour être dans celle des Porphyromonadaceae[7]. En , Parabacteroides est reclassé dans la famille des Tannerellaceae, l'ordre des Bacteroidales[8], la classe des Bacteroidia et dans le phylum Bacteroidota[4].

Liste des espèces

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Selon la LPSN (21 février 2023)[9], le genre Parabacteroides comprend 11 espèces publiées de manière valide.

Description

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Les bactéries du genre Parabacteroides sont des bacilles à Gram négatif non mobiles anaérobies strictes[6],[3]. Ces bactéries ne forment pas de spores. Ce genre produit comprend des bactéries catalase positiveset est négative pour les tests uréase et de liquéfaction de la gélatine[3].

Habitat

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Les bactéries du genre Parabacteroides sont fréquemment isolées dans les fèces humaines où l'espèce Parabactéeroides distasonis est l'une des plus communément identifiée[3]. Des souches de ce genre bactérien peuvent être identifiées dans des échantillons cliniques[3].

Notes et références

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Bibliographie

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  • (en) Mitsuo Sakamoto et Yoshimi Benno, « Reclassification of Bacteroides distasonis, Bacteroides goldsteinii and Bacteroides merdae as Parabacteroides distasonis gen. nov., comb. nov., Parabacteroides goldsteinii comb. nov. and Parabacteroides merdae comb. nov. », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, vol. 56, no 7,‎ , p. 1599-1605 (DOI 10.1099/ijs.0.64192-0)
  • (en) Arnold H. Eggerth et Bernard H. Gagnon, « The Bacteroides of Human Feces. », J Bacteriol, vol. 25,‎ , p. 389-413 (DOI 10.1128/jb.25.4.389-413.1933)
  • (en) Noel R. Krieg, « Family IV. Porphyromonadaceae fam. nov. », dans Krieg NR, Staley JT, Brown DR, Hedlund BP, Paster BJ, Ward NL, Ludwig W, Whitman WB (eds), Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, vol. 4, New York, Springer, , 2nd edn éd. (DOI 10.1007/978-0-387-68572-4), p. 61
  • (en) KL Ormerod, DL Wood, N Lachner, SL Gellatly, JN Daly, JD Parsons, CG Dal'Molin, RW Palfreyman, LK Nielsen, MA Cooper, Mark Morrison, Philip M. Hansbro et Philip Hugenholtz, « Genomic characterization of the uncultured Bacteroidales family S24-7 inhabiting the guts of homeothermic animals », Microbiome, vol. 4,‎ , p. 36 (DOI 10.1186/s40168-016-0181-2)

Liens externes

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