Enzyme d'alpha amidation
La peptidyl-glycine alpha-amidating monooxygenase (PAM) est une enzyme qui catalyse la conversion des amides de glycine en amides et en glyoxylate. Elle permet une modification post traductionelle d'alpha amidation de plus de 70% des protéines de l'organisme.
L'enzyme est impliquée dans la biosynthèse de nombreux peptides de signalisation et de certains amides d'acides gras[5].
Chez l'homme, l'enzyme est codée par le gène PAM[6],[7]. Cette transformation est obtenue par conversion d'une prohormone en l'amide correspondant (C(O)NH2). Cette enzyme est la seule voie connue pour générer des amides peptidiques, ce qui rend le peptide plus hydrophile[8].
Une fonction
modifierCe gène code une protéine multifonctionnelle. Il possède deux domaines enzymatiquement actifs avec des activités catalytiques - la peptidylglycine alpha-hydroxylating monooxygenase (PHM) et la peptidyl-alpha-hydroxyglycine alpha-amidating lyase (PAL). Ces domaines catalytiques agissent séquentiellement pour catalyser les peptides neuroendocriniens en produits alpha-amidés actifs. La voie de réaction catalysée par PAM est accessible via un tunnel quantique et une préorganisation du substrat[9]. De multiples variants de transcription épissés alternativement codant différentes isoformes ont été décrits pour ce gène, mais certaines de leurs séquences complètes ne sont pas encore connues[10].
La sous-unité PHM effectue l'hydroxylation d'un résidu glycine O-terminal :
- peptide-C(O)NHCH2CO2− + O2 + 2 [H] → peptide-C(O)NHCH(OH)CO2− + H2O
Impliquant l'hydroxylation d'un hydrocarbure par O2, ce procédé repose sur un cofacteur de cuivre. La dopamine bêta-hydroxylase, également une enzyme contenant du cuivre, effectue une transformation similaire[11].
La sous-unité PAL achève alors la conversion, en catalysant l'élimination de la glycine hydroxylée :
- peptide-C(O)NHCH(OH)CO2− → peptide-C(O)NH2 + CH(O)CO2−
Le coproduit éliminé est le glyoxylate, noté ci-dessus CH(O)CO2− .
Chez les insectes
modifierLes PαAM d'insectes sont sensibles aux concentrations d'O2 et dépendent de Cu2+. Simpson et al 2015 ont découvert que les PαAM des insectes réagissent à l' hypoxie en régulant l'activité de plusieurs hormones peptidiques. Ils trouvent que PαAM est probablement une partie importante des réponses neuroendocrines à l'hypoxie[12].
Notes et références
modifier- GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000145730 - Ensembl, May 2017
- GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000026335 - Ensembl, May 2017
- « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
- « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
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- « Human peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase: cDNA, cloning and functional expression of a truncated form in COS cells », Biochemical and Biophysical Research Communications, vol. 169, no 2, , p. 551–558 (PMID 2357221, DOI 10.1016/0006-291X(90)90366-U)
- « PAM peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase ».
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- « Evidence for substrate preorganization in the peptidylglycine α-amidating monooxygenase reaction describing the contribution of ground state structure to hydrogen tunneling », Journal of the American Chemical Society, vol. 132, no 46, , p. 16393–16402 (PMID 21043511, PMCID 2988104, DOI 10.1021/ja1019194)
- « PAM peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase »
- « Reaction mechanism of the bicopper enzyme peptidylglycine α-hydroxylating monooxygenase », The Journal of Biological Chemistry, vol. 289, no 20, , p. 13726–13738 (PMID 24668808, PMCID 4022847, DOI 10.1074/jbc.M114.558494)
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Bibliographie
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