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Cette page est une Liste des agents pathogènes touchant les humains, qui sont des agents qui causent infection qui est un états pathologiques créant des maladies infectieuses chez l'humain[nb 1]. Cette liste inclut:

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Parmi les bactéries décrites avant 2021, 1110 sont des pathogènes établis, 403 sont considérées comme potentiellement pathogènes: ce qui fait un total de 1513 (dont 73,364...% sont des pathogènes établis)[23].

Humain

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Infection

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A

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  • Achromobacter[33] → Alcaligenaceae[50]

B

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C

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D

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E

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F

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G

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H

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I

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J

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(Junin) → complexe Tacaribe[42]

K

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L

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M

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N

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O

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P

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R

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S

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T

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U

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V

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Z

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Bactérie classée

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Dans une étude (Bartlett, Padfield, Lear, Bendall, Vos 2022) portant sur des bactéries connues avant 2021, les genera comptant le plus d'espèces pathogènes étaient [23] (e est établi(p est putatives) = t est total):

  • Mycobacterium: e91(p21) = t112
  • Corynebacterium: 36(20) = 56
  • Nocardia: 35(18) = 53
  • Streptococcus: 35(11) = 46
  • Staphylococcus: 28(3) = 31
  • Prevotella: 26(10) = 36
  • Clostridium: 23(7) = 30
  • Bacteroides: 20(7) = 27
  • Burkholderia: 20(5) = 25
  • Actinomyces: 16(10) = 26

Risque biologique

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Article R. 4421-2 du «Code du travail: Risque biologique» [610]

A

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classe 2

  • Acanthamoeba castellanii [611], Actinomyces gerencseriae [29], Mastadenovirus-adénovirus [29], Alcaligenaceae-Bordetella-bronchiseptica-parapertussis-pertussis [29], Anaplasmataceae-Ehrlichia-sennetsu[29], Arcanobacterium-haemolyticum[29], Arenaviridae-Mammarenavirus-chorioméningite lymphocytaire-Lassa(AMcmlL):souches non-neurotropes[42],[29]AM-Mobala [214], AM-Mopeia [29], Arenaviridae-Mammarenavirus tacaribe(AMt)-Clade B: Tacaribe [214]

classe 3

  • AMcmlL: souches neurotropes[42],[29], AMt-Clade A:Flexal [29]

classe 4

B

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Classe 3

  • Bacillus anthracis [29]

Fongiques prioritaires de l’OMS 2022

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  1. ↑ A. fumigatus: priorité CRITIQUE [177]
  2. ↑ C. albicans: priorité CRITIQUE [177]
  3. ↑ C. auris: priorité CRITIQUE [177]
  4. ↑ C. neoformans: priorité CRITIQUE [177]

Maladies et Traitments

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  • Escherichia coli - hautement pathogènes (E. coli entérohémorragiques (ECEH), entéro-invasifs (ECEI) entéropathogènes (ECEP), entérotoxinogènes (ECET), producteurs de shiga-toxines (STEC))[121]

Précédemment ou actuellement résistant aux médicaments

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Les premiers antimicrobiens efficaces ont été utilisés en 1937. La première résistance aux antimicrobiens est apparue avant 1940[710].

  1. ↑ Enterobacter: un E de le groupe ESKAPE [330] (en)
  2. ↑ Enterobacterales: a une résistant aux carbapénèmes, produit BLSE[51], résistant aux céphalosporines de troisième génération (Mai 2024 - priorité: CRITIQUE: 1 de 3 en cette groupe)[333]
  3. ↑ E. faecium: groupe ESKAPE [359]
  4. ↑ K. pneumoniae: groupe ESKAPE [359]
  5. ↑ Shigella: résistant aux fluoroquinolones (Mai 2024 - priorité: haute: 1 de 6 en cette groupe [333])
  6. ↑ S. pneumoniae: résistant aux macrolides (Mai 2024 - priorité: moyenne [333])
  7. ↑ A. baumannii: résistant aux carbapénèmes[51] ((en) Fabimycin (2022)[668],[669]; trouvé dans la majorité des infections[670](c. 2005[470], 2020[670]) (Mai 2024 - priorité: CRITIQUE: 1 de 3 en cette group [333]) groupe ESKAPE [359]
  8. ↑ M. tuberculosis: une bactérie multirésistante[669], résistant à la rifampicine (Mai 2024 - priorité: CRITIQUE: 1 de 3 en cette groupe [333])
  9. ↑ P. aeruginosa: résistant aux carbapénèmes[51], groupe ESKAPE [359]
  10. ↑ S. typhi: résistant aux fluoroquinolones (Mai 2024 - priorité: haute: 1 de 6 en cette groupe [333])
  11. ↑ S. aureus: résistant à la méthicilline[669] → SARM [696] (Mai 2024 - priorité: haute: 1 de 6 en cette groupe [333]) groupe ESKAPE [359]

(Réseau trophique)

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Article connexe : Réseau trophique.

Infection

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A

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B

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C

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Clostridium: chauvoei, novyi, perfringens, septicum, sordelli - Bovins, caprins, ovins[712]

D

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Dichelobacter nodosus - Bovins, caprins, ovins[712]

E

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F

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Fusobacterium necrophorum - Bovins, caprins, ovins[712]

P

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M

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Melissococcus plutonius - abeille européenne[716]

Voir aussi

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Liste des maladies infectieuses

Notes

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  1. ↑ Marcus Terentius Varro[1] (né 116 av. J.-C.[2]) est considéré comme le premier à spéculer sur l'existence de petits agents pathogènes infectieux, via le livre I[3] chapitre XII[4] de Rerum rusticarum[3] : "quod crescunt animalia quaedam minuta...atque efficiunt difficilis morbos"[4]
  2. ↑ du grec: baktêrion - baktêria - [5] βάκτρον [6] (báktron) [7] bâton, gourdin [6]
  3. ↑ Bacenis - Caesar "saltus ex Germania". bacillum - De Catilinae coniuratione :C·SALLVSTIVS Crispus, dextram subiens D Iunius Iuvenalis particulièrement: lictoris virga de lege Agraria :MT Cicero. Bactra - le premier grande-ville de Bactria: QH Flaccus, "..ultima secum Bactra vehit.." :PV Maro (CL 1888 (1ère éd. 1889) 1962)
  4. ↑
    • parasitus: un parasite femelle. parasitaster: un parasite désolé. parasitus: παράσιτος (qui mange avec un autre): un mangeur de crapauds, qui profite (éponge), chasseur de touffes, "parasite" (sic): parasitorum in comoediis adsentatio :Laelius :MT Cicero, edaces parasitii :Epistulae:QH Flaccus (CL 1888 (1ère éd. 1889) 1962).
    • «manger à la table commune» (Amyot 1567, Vies des hommes illustres par Plutarque, Solon). insectes parasites (JLNF Cuvier, Hist. nat. des animaux 1798) [14]
  5. ↑ πρίω (príō): πρίω δίχα - scier avec force en morceaux. II. en chirurgie trépan. III. dentelé (pointes acérées) Β. πρίω ὀδόντας - grincer ou grincer des dents, en cas de maladie II. piqûre, grinça des dents avec fureur contre lui, irrité, provoqué, C. amputer/arrêter/couper des syllabes III. saisir avec les dents[19] πρίων (príōn): A; scie, scie sans dents pour couper la pierre, bord avec surface tranchante/une rangée pointue irrégulière, crête dentelée de collines II surnom du marchand de bois de construction III scie cylindrique-trépan[20]
  6. ↑ suc puissant (potentibus sucus), liquide médicinal (medicamen liquidum), poison (venenum), venin (veneno), "virus" (sic): "(equa) lentum destillat ab inguine virus"-"malum virus serpantibus addidit" :Georgica :PV Maro, evomere virus acerbitatis suae :Laelius :MT Cicero (CL 1888 (1ère éd. 1889) 1962)
  7. ↑ Isolé dans la région de Leningrad 1951 [25]. Absettarov découverte 5-aminoisoxazole-3-acide carboxylique esters d'adamantylméthyle[26] qui a une activité antivirale[27] de VMET[28]
  8. ↑ Absidia corymbifera (Cohn)[30],[31] Vuill. (1903)[30],[32] Absidia (en) ( it )[33] (PEL van[34],[35] Thieghem 1876)[36] corymbifera[37] (Cohn 1884)[36]
  9. ↑ Sawyer, T. K.; Griffin, J. L. (1975)[41]
  10. ↑ (Волконский)
  11. ↑ Acanthamoeba (Volkonsky [nb 10], 1931)[44] αιχμηρά (akantha[45]) + amibe[46] (Bory de Saint-Vincent 1822, Ehrenberg 1830; 1er décrit: Rösel von Resenhof 1757: petit Protée[47])
  12. ↑ ainsi nommé parce qu'il a été découvert par Castellani[49] (it de en)
  13. ↑ plus fréquemment impliquée en pathologie humaine, 2015 [55]
  14. ↑ microbiote de l'homme dans un état normal [63]
  15. ↑ A. georgiae (Johnson, Moore, Kaneko, Moore: 1990[66] car Dr. L K Georg[67])
  16. ↑ A. gerencseriae (Johnson et al 1990[66] car Mary Ann Gerencser[68])
  17. ↑ A. israelii (Kruse 1896 car Professeur James Israel [70],[71],[72])
  18. ↑ adénovirus A 18 (1er isolé: Rowe, Hartley, Huebner: 1956 & 1958, par un enfant avec maladie de[83] Niemann-Pick[84])
  19. ↑ A. christensenii (apres Jens J. Christensen[91], décrit 1999[90] Collins, Jovita, Hutson, Ohlén, Falsen[92])
  20. ↑ A. sanguinicola (2001[90])
  21. ↑ A. urinae (1992[90])[95]
  22. ↑ A. viridans (Williams et al.[91], 1953[90])[95]
  23. ↑ A. salmonicida (1er cas 2014; Tewari, Dudeja, Nandy, Kumar Das)[106]
  24. ↑ Água Preta, un mairie[108] de Brésil[108]
  25. ↑ de le Préfecture d'Aichi, Japon[110]
  26. ↑ Alcaligenes (Castellani et Chalmers 1919)[118]
  27. ↑ A. denitrificans denitrificans (Rüger et Tan 1983) (et. dénitrifiant)[118]
  28. ↑ A. infernus (Raguénès et al. 1997[126])
  29. ↑ A. canis (1935)[134]
  30. ↑ A. chaffeensis (décrite 1986)[132]
  31. ↑ E. sennetsu (1er isolé: 1954 [137], décrite 1956)[132]
  32. ↑ A. duodenale (Dubini 1843)[140]
  33. ↑ d'Araguari, un mairie de Brésil[145],[146] (prototype souche 1er isolé circa 1969)[146]
  34. ↑ (découverte 1946, Maclean[150],[151]: Corynebacterium[150],[24] haenolyticum)[24]
  35. ↑ arena: sable (de le ribosomes)[153]
  36. ↑ découvert par: C. Armstrong (Service de santé publique des États-Unis), R.D. Lillie (1933)[158]
  37. ↑ Lassa (1er identifié: 1969[155])
  38. ↑ Tacaribe (1er isolé: entre 1956 et 1958, Trinité[173])
  39. ↑ Astrovirus (decouverte 1975[180])
  40. ↑ (de Bary & Löwenthal) G.Arnaud, 1918 [182]
  41. ↑ B. fragilis (Castellani and Chalmers (1919)[195]
  42. ↑ Bas-Congo tibrovirus (Walker, Firth, Widen, Blasdell, Guzman, Wood 2018)[204]
  43. ↑ Batken, Kirgizstan[205] (1er isolé de[206] 1970[205])
  44. ↑ Bourbon (Comté de Bourbon-Kansas[211]) (1er identifié en 2014[211])
  45. ↑ Bhanja de Bhanjanagar, Inde (1er isolé: 1954)[218]
  46. ↑ Crimée-Congo (1er identifié: Crimée, 1944[220])
  47. ↑ Palleroni, Holmes; 1981. Yabuuchi, Kosako, Oyaizu, Yano, Hotta, Hashimoto, Ezaki, Arakawa; 1993[223].
  48. ↑ Walter Burkholder (en) (Cornell 1949) par la maladie: pourriture de l'oignon [226],[227]
  49. ↑ apres Gk. anthinos [229] (c.f. ἄνθινος: var. de fleurs, comme des fleurs, éclos, fleuri, aux couleurs vives [230]) de le jardin, de fleurs [229]
  50. ↑ Clostridium (Prazmowski 1880) (synonyme: Anaerobacter - Duda et al. 1996)[257]
  51. ↑ TONV de Tonate[24] (isolé pour la première fois pendant 1973 en Guyane française, Amérique du Sud[260])
  52. ↑ («couronne ⇒ halo»[266]: de la forme de la péplomère)
  53. ↑ (1ère détection des coronavirus humains: Tyrrell (en) et Bynoe[268] (1965)[269],[270],[268]
  54. ↑ NL63 (1er identifié: 2004 [273] Pays-Bas[274])
  55. ↑ 229E (1er identifié: "nouveau virus respiratoire": Hamre et Procknow, hiver de 1962[270] États-Unis[274])
  56. ↑ HKU1 (1er identifié: 2005[273] Hong Kong[276])
  57. ↑ OC43 (1er identifié: 1967 [273] France[274])
  58. ↑ MERS-CoV (1er isolé: 2012 Jeddah, Arabie Saoudite[276])
  59. ↑ SARS-CoV-2 [281] (1er identifié: Janvier 2020 [278])
  60. ↑ B.1.1.529 (1er identifié: 24 novembre 2021 Sud Afrique[301])
  61. ↑ D. mansoni (Sparganum mansoni (Cobbold, 1883)[317])
  62. ↑ Dracunculus medinensis (Linnæus, 1758 [318]: petit dragon (draco) de Médine[319],[320]) (1er identifié: 1611 ver de Guinée[321], apres Golfe de Guinée)[319] present dans momie 1770 du musée de Manchester datée ~1000 av. J.C[322]
  63. ↑ vecteur: copépodes + hôtes intermédiaires (Alexeï Fedtchenko 1870 [320])
  64. ↑ Ekpoma (État d'Edo, Nigeria)[250] (1er identifié: 2015[327])
  65. ↑ Gavini et al. 1979 [337]
  66. ↑ Bartolomeo Bizio (it) 1823 [336],[339]
  67. ↑ très tôt ou premier cas signalé d'infection rapporté dans la littérature: 1988 (homme, alcoolique - cirrhose) [341]
  68. ↑ Y. enterocolitica enterocolitica (Schleifstein et Coleman 1939; Frederiksen 1964)[348]
  69. ↑ Y. palearctica (Neubauer et al. 2000)[349]
  70. ↑ E. coli (1er décrit Théodore Escherich: Bacterium coli[362])
  71. ↑ F. buski (Lankaster, 1857 Distoma buski)[364]
  72. ↑ ouest de l'Ouganda[366]
  73. ↑ Fairfax[367] nord de[368] Virginie (1989)[369]
  74. ↑ Côte d'Ivoire[370]
  75. ↑ A. albopictus (Skuse, 1894)[386] répartition actuelle en France métropolitaine
  76. ↑ de la forêt de Kyasanur, Karnataka, Inde[388] (1er identifié: 1957[389])
  77. ↑ Kunjin (1er identifié: 1960 Australie)[394]
  78. ↑ Wesselsbron (1er isolé: Weiss et al. 1956 [396], 1er identifié 1954-5 en les moutons de Wesselsbron[397] 1er identifié homo sapiens 1957 (Weinbren et al.)[396] )
  79. ↑ Zika (1er isolé: chez un macaque rhésus[400] GWA Dick[401] 1947[400])
  80. ↑ cytomegalovirus (1er identifié: 1904, 1956)[442]
  81. ↑ roseolovirus (1er identifié : 1986)[444],[445], isolé à partir de cellules mononucléaires du sang périphérique (PBMC) stimulées par l'interleukine 2 de patients atteints du SIDA ou de troubles lymphoprolifératifs[446]
  82. ↑ (de quo Mucor[460]: le premier microbe identifié par la science: Hooke & van Leeuwenhoek en le Micrographia de 1665[461])
  83. ↑ Micropolyspora (Hubert A. Lechevalier et al. 1961)[464]
  84. ↑ A. junii (Bouvet et Grimont 1986 (W. Mannheim 1964 de même que Achromobacter citroalcaligenes)[475]
  85. ↑ A. lwoffii (Audureau 1940) Brisou et Prévot 1954)[476]
  86. ↑ A. ursingii (1er isolé: 2001 - De Baere, Dijkshoorn, Nemec, van der Reijden, Tjernberg, Vaneechoutte[479])
  87. ↑ M. tuberculosis cause de la tuberculose (Robert Koch 1882)[483]
  88. ↑ Nocardia (1er isolé: Edmond Nocard 1888[488])
  89. ↑ influenzavirus α (1er isolé: 1932 - 1933 par Andrewes, Laidlaw, Smith[493])
  90. ↑ Nipah (1er identifié: 1999 - Malaysia[518])
  91. ↑ Langya (1er identifié: 2018 [487])
  92. ↑ Aichi 1 (premier isolé 1989[526])
  93. ↑ (kobuvirus (en)[528] (car au microscope électronique est morphologiquement bosselé; Japonais: kobu[529]) bovin[528] (1er rapport 2003[528])
  94. ↑ Prusiner[533] decouverte l'existence des prions circa 1982 par gratte[534]
  95. ↑ (present comme HERV en le génome[539] (apres Temin 1964; Weiss 1967; et al.[540],[541]) restes d'infections[542],[543] pré-homo sapiens (accepter les archives archéologiques actuelles dans la réalité)[544]. En tant que groupe, principalement non intact, dont HERV-K a été trouvé actif (Wildschutte et al. 2017)[545] dont la sous-clade de (HML)-2 existe depuis 35 millions d'années (Burn et al. 2022)[543], étant le provirus (Temin 1964 et al.) le plus récemment actif résultant de la réintégration de manière endogène[545],[540]. La transcription de HERV-K s'avère exister longitudinalement dans un état stable à de faibles niveaux dans divers tissus et tumeurs (Tönjes et al. 1996)[546]. Les séquences rétrovirales endogènes aient la même structure fondamentale que la forme intégrée (provirale) d'un rétrovirus exogène dans l'ADN chromosomique de l'hôte (Larsson et al. 1989)[547].
  96. ↑ VIH-1 (1er identifié: 1983[548]: Barré-Sinoussi, Chermann[549], Montagnier[550])
  97. ↑ VIH-2 (1er identifié: 1986[548])
  98. ↑ (Theiler’s-like human cardioviruses; Morris Saffold Jones 2007 apres Theiler, 1934[556])
  99. ↑ Sappinia pedata (Dangeard, 1896[560])
  100. ↑ présent chez les pharaons[563] de la XXe dynastie (Ruffer 1910)[564]
  101. ↑ Streptococcus (d'abord décrit par Billroth (1874 puis 1877)[573] par érysipèle et infections des plaies[574])
  102. ↑ pyogenes («pus (pyo) + formant (genes)» - Rosenbach 1884[574])
  103. ↑ (Stackebrandt, Rainey, Ward-Rainey 1997: Actinobacteria classis nov[61]. emend. Zhi, Li, Stackebrandt, 2009 [62])
  104. ↑ ἀκτῖνος + Madura (Lechevalier et Lechevalier[590] 1968 [591] / 1970 [590])
  105. ↑ (Vincent 1894)[592]
  106. ↑ Treponema pertenue (Castellani[24], 1905[594])
  107. ↑ T. pseudospiralis (Garkavi, 1972[596])
  108. ↑ U. chartarum (Preuss) E.G. Simmons[597]
  109. ↑ (A. Yersin 1894[604])
  110. ↑ (forêt Zika[605], à environ 1 150 à 1 170 mètres d'altitude[606], Comté de Kitala[607],[608],[609], ouganda[605])
  111. ↑ Fièvre de Lassa (1er décrit: 1950)[627]
  112. ↑ (une infection présente en un corps datant d'environ 3278 ans av. J.-C., découverte dans les Alpes de l'Ötztal[631])
  113. ↑ SARS-CoV-1 (1er identifié: 2003, Carlo Urbani[637], Hôpital français de Hanoi[638])
  114. ↑ Girolamo Fracastoro 1530 [704]: Syphilis sive morbus gallicus (Dédié à P. Bembo) [705]

Références

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  1. ↑ (en) https://www.rcpe.ac.uk/heritage/history-germ-theory-college-collections, https://www.rcpe.ac.uk/ (Collège royal des médecins d'Édimbourg (en))
  2. ↑ (fr) https://www.lesbelleslettres.com/contributeur/varron, https://www.lesbelleslettres.com/
  3. ↑ a et b (fr) Jean Trinquier https://www.persee.fr/doc/mom_0151-7015_2008_act_39_1_1006#mom_0151-7015_2008_act_39_1_T11_0157_0000 Actes du colloque international tenu à la Maison de l'Orient et de la Méditerranée-Jean Pouilloux, les 26 et 27 octobre 2006 MOM Éditions Année 2008 , https://www.persee.fr/ (Persée) ← Université d'État de l'Oregon par James T. Bawden
  4. ↑ a et b (fr) B. Maroutaeff, C. Ruell, J. Schumacher (2008) http://agoraclass.fltr.ucl.ac.be/concordances/varron_de_agricultura_01/ligne05.cfm?numligne=13&mot=siqua, http://agoraclass.fltr.ucl.ac.be/ (UCLouvain)
  5. ↑ [1]
  6. ↑ a et b Liddell, Scott, Jones
  7. ↑ https://www.etymonline.com/fr/word/bacteria
  8. ↑ a b c d et e (fr) Professeur Catherine Neuwirth http://www.ifsidijon.info/v2/wp-content/uploads/2015/09/2016-Les-agents-infectieux.pdf [archive] (http://www.ifsidijon.info/v2/ Institut de formation en soins infirmiers - CHU de Dijon - https://www.chu-dijon.fr/
  9. ↑ Paul D. Brock, Daniel Otte: phasmida: HomePage: TaxonNameID
  10. ↑ https://www.cnrtl.fr/definition/bact%C3%A9rie: EHRENBERG, Die Infusionsthierchen als vollkommene Organismen, Leipzig, p. 75
  11. ↑ Lise Wilkinson 29 May 2004 https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(04)16329-0/abstract THE LANCET Volume 363, Issue 9423p1835
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Sources et liens externes

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Arbovirus

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Bactérie

Burkholderia

COVID

CRISPR

Gélose

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